
联川生物隆重推介Seq-Array服务
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- 2025年07月16日
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联川生物全球首家推出Seq-ArraySM 一站式服务,综合了二代测序技术,领先的生物信息学分析策略和自有的μParaflo® 微流体定制化芯片技术,加速科研人员个性化的miRNA表达谱发现与差异分析工作。
第二代测序技术具有高通量高覆盖的序列解析能力,不需要既有的序列信息即可展开实验,但是分析其产生的庞大数据和相对较高的实验支出又给科研人员的大量使用带来困难。芯片技术是一项重复性和可靠性已被反复证实的表达谱分析工具,其实验支出相对较低,可用于大量的样本检测,但是芯片探针的合成需要序列信息的输入。如果可以将二种技术的优势互补,强强联合,无疑将成为科研人员进行miRNA研究的又一项利器。
不受物种miRNA序列报道与否的限制,利用二代测序可以对任意物种的完整miRNA谱进行发现。
- Meng F, Hackenberg M, Li Z, Yan J, Chen T. (2012) Discovery of Novel MicroRNAs in Rat Kidney Using Next Generation Sequencing and Microarray Validation. PLoS ONE 7(3), e34394.
- Wong CE, Zhao YT, Wang XJ, Croft L, Wang ZH, Haerizadeh F, Mattick JS, Singh MB, Carroll BJ, Bhalla PL. (2011) MicroRNAs in the shoot apical meristem of soybean. J Exp Bot 62(8), 2495-506.
- Fu Y, Shi Z, Wu M, Zhang J, Jia L & Chen X (2011) Identification and differential expression of microRNAs during metamorphosis of the Japanese flounder (Paralichthys olivaceus). PLoS One 6, e22957.
- Li B, Qin Y, Duan H, Yin W, Xia X. (2011) Genome-wide characterization of new and drought stress responsive microRNAs in Populus euphratica. J Exp Bot 62(11), 3765-79.
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- Yao Y, Smith LP, Petherbridge L, Watson M, Nair V. (2012) Novel microRNAs encoded by duck enteritis virus. J Gen Virology 93(Pt 7), 1530-36.
- Zhou ZS, HQ, Liu ZP, Yang ZM. (2011) Genome-wide identification of Medicago truncatula microRNAs and their targets reveals their differential regulation by heavy metal. Plant Cell Environ 35(1), 86-99.
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文献和实验DNA Analyzer)的Applied BioSystem(ABI)这家一直占据着测序市场最大份额的公司的领先地位就开始动摇了,因为他们的拳头产品毛细管阵列电泳测序仪系列(series capillary array electrophoresis sequencing machines)遇到了两个强有力的竞争对手,一个就是罗氏公司(Roche)的454 测序仪(Roche GS FLX sequencer),另一个就是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析平台
个外显子。在ADAM2基因符号旁的箭头(粉红色区域内)显示了基因转录的方向。基因符号本身与LocusLink相链接,这是一类NCBI资源,可提供有关此基因的大量信息,包括别名、核苷酸及蛋白质序列,并与其它资源相链接。基因符号右侧的链接指向了有关此基因的附加信息。 sv,或称序列浏览,表明基因在基因组 克隆重叠群(contig)上的位置,包括核酸和编码的蛋白质序列。 ev给使用者提供证据浏览,显示了支持某特定基因模型的生物学证据。这个视图显示所有的标准序列模型(RefSeq
,适合于样本量大,中高通量的甲基化研究。芯片以矩阵微珠芯片(Sentrix Array Matrix(SAM))的格式,每个panel可以检测96个样本,根据客户的定制要求,每个样品可同时检测384-1536个甲基化位点。 而安捷伦采用的是免疫共沉淀的方法(MeDIP-ChIP )的方法。基因组DNA分成两份,一份用来做MeDIP,加入抗5'-甲基化胞嘧啶核苷抗体,使用免疫磁珠法分离样品中甲基化DNA片段的抗体复合物,样品中其余的非甲基化DNA片段被洗脱;另一份作为对照。两个样品都标记
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