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文献和实验臂区域如果 GC 含量过高过低,或者有重复序列,都可能在核酸外切酶切割后形成发卡结构,影响重组效率,可以使用质粒设计软件来检查同源重组臂的设计。 ⑤插入序列本身的问题:有些序列本身存在连接载体困难、连接产物不稳定、连接产物在大肠杆菌中复制困难等问题。对于这类序列可以考虑将序列打断后分步构建,或者更换载体或感受态的方式尝试解决。 2. 质粒提取量不足 质粒提取量少常见的原因可能是: ①摇菌时间过长:大肠杆菌生长已经超过对数期,细菌老化,导致细胞和 DNA 降解。 ②摇菌时间不足:细菌生长不充分
结合。 彻底去乙醇 漂洗步骤结束后,务必进行空转离心(12000 rpm 离心 2~3 分钟),并用吹风机冷风吹干吸附膜。残留的乙醇会抑制下游酶切反应,并导致转染时细胞大量死亡。 预热洗脱液 洗脱液(EB 或 TE)提前预热至 60~70℃,滴加在吸附膜中央,室温静置 3~5 分钟后再离心。这能大幅提高洗脱效率。若想进一步提高产量,可将第一次洗脱液倒回柱子进行二次洗脱。 四、质粒质检:4个关键指标,一个都不能少 拿到质粒后,怎么判断质量好不好?很多同学只看浓度
加入1/10体积的ETR,颠倒7-10次后溶液变得浑浊,冰浴10-20min。 10. 42°C水浴5min后,25°C,3,000-5,000xg离心5min,ETR溶液将在管底形成蓝色分层。离心后,如果溶液中有大量的液滴悬浮,静置10分钟让液滴自然沉降。 11. 转移上清液移至离心管中,加入0.5倍体积无水乙醇(室温),混匀后室温静置1-2min。 12. 将HiBind® 中量柱装在15ml收集管中。转移20ml混合液至柱子內,室温下3,000-5,000xg离心
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