产品性能 基于蛋白质芯片的血清标志物的筛选是获得生物标志物的第一步,后续仍需要严格的验证。就这一部分而言,分为三个部分: 1. 样品选择 样本的选择和质量极其重要。考虑到疾病的复杂性和个体差异性,需要准确记录每个样本的各个参数,以获得准确的和可靠的结论。 样本选择要求: a. 有明确的临床诊断结论; b. 血清收集时最好未进行治疗(除特别研究外)。
样本信息登记表(根据不同疾病额外需更多参数):
样本ID
来源及编号
年龄
性别
临床诊断结论
其它特别备注
备注:健康人随机选择但保证年龄分布和性别分布应与病人组一致。 取样步骤和要求: a. 需用促凝采血管,采血量为6-10ml,收集血清3-5ml; b. 血样需离心,离心转速为3000rpm,4℃,5分钟; c. 所有血清标本用标准冻存管保存,1 ml/管,每例病人血清保存3-5管;所有标本于-20℃环境保存时间不大于7天, -86℃可长期保存。
2. 芯片筛选 按照本公司标准SOP执行,简述为: a. 芯片封闭——使用BSA封闭芯片上为结合蛋白的位点。 b. 血清样品孵育——血清按照一定的比例稀释,在存在封闭剂的条件下加入到芯片表面,该步骤使得血清中存在的抗体同其特异性识别的抗原结合; c. 清洗——去除未结合的蛋白和抗体; d. 荧光检测——使用荧光标记的anti-Human-IgG或IgM或IgD的二抗针对性检测结合的抗体,清洗后置于荧光扫描仪下显示结果。
3. 数据分析 由本公司专业数据分析团队完成,具体方法简述为: a. 依据芯片蛋白样品标记文件(Gel file)提取所有血清样本对应芯片上的所有蛋白点的荧光信号数据; b. 使用基于背景的算法对芯片(样品)间的数据进行归一化处理; 基于数学检验统计分析,找出在开放性肺结核、非开放性肺结核特异性蛋白,并计算其与健康人和其它对照组的P值。 d. 画出聚簇分析图和box-plot图,生成潜在血清标志物名单。