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蛋白基因芯片检测
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伊莱博生物科技(上海)有限公司
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文献和实验杂交信号的检测是DNA芯片技术中的重要组成部分。以往的研究中已形成许多种探测分子杂交的方法,如荧光显微镜、隐逝波传感器、光散射表面共振、电化传感器、化学发光、荧光各向异性等等,但并非每种方法都适用于DNA芯片。由于DNA芯片本身的结构及性质,需要确定杂交信号在芯片上的位置,尤其是大规模DNA芯片由于其面积小,密度大,点样量很少,所以杂交信号较弱,需要使用光电倍增管或冷却的电荷偶连照相机(charged-coupled device camera,CCD)摄像机等弱光信号探测装置。此外,大多
管盖基因芯片是将基因探针固定在特制的管盖内表面,与内置杂交贮液池的Eppendorf管一起构建的基因检测器件。在一个全封闭的管内,完成基因扩增,荧光标记,芯片杂交及检测等一系列生物化学操作,实现多基因高通量并行检测。本文报道了一种用于管盖基因芯片的检测分析系统,它包括光学检测平台、图像采集系统、图像分析系统及结果报告系统。光学检测平台利用尼康显微镜光学系统,通过电荷耦合器件(CCD)的进行图像采集。管盖基因芯片杂交后,经过荧光信号被CCD捕获,经通用串行总线(USB)传递给计算机。图像经过旋
体系的设计不但针对PCR阳性产物的筛选,也同时兼顾了上述检测环节的质量控制。为此该体系包含了以下一系列的质控物质: DNA阳性质控:针对DNA制备是否成功以及PCR扩增过程有无差错的质控问题,HLA-B*27的基因芯片检测体系包含了两种阳性质控物质,即PCR反应液中用以扩增β2微球蛋白基因片段的特异性引物和在芯片上包被的检测β2微球蛋白基因扩增产物的探针。β2微球蛋白广泛存在于有核细胞的细胞膜表面,而且序列保守程度高。如果最终检测结果显示该探针并未与PCR产物发生特异性结合,即说明在DNA
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