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miRNA QC PCR Array
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SAB
miScript miRNA QC PCR Array layout for plate formats A, C, D, F. Wells 1 and 2 of each row contain replicate C. elegans miR-39 miScript Primer Assays (39). Well 3 of each row contains a miR-16 miScript Primer Assay (16). Well 4 of each row contains a miR-21 miScript Primer Assay (21). Well 5 of each row contains a miR-191 miScript Primer Assay (191). Wells 6 to 8 of each row each contain an assay for a different snoRNA (61 = SNORD61 assay, 95 = SNORD95 assay, 96A = SNORD96A assay). Wells 9 and 10 of each row contain replicate miRTC miScript Primer Assays (miRTC). Wells 11 and 12 of each row contain replicate positive PCR controls (PPC). These formats enable the quality assessment of up to 8 cDNA samples
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文献和实验的小分子――筛选一定大小的RNA分子,连接到3'和5'的适配子(adapters),逆转录并通过PCR扩增、亚克隆并测序。miRNA前体在基因组上的定位和聚类是通过向基因组数据库查询进行。这个方法有助于判断miRNAs是否是mRNAs、tRNAs、rRNAs等分子的降解产物。 有的实验室通过一种RNA folding program 'mfold'来判断C. elegans和C. briggsae之间的高度保守区域是否含有潜在的miRNA前体,然后用Northern Blots的方法来确定
。一般是做6张可以了。但是还要有后继实验的啊,比如real time pcr,进行验证芯片结果。做几十例,然后做统计。 要是配对的样本做配对T检验,但先做F检验,看是正态还是偏态分布。然后选择合适的统计方法。 以上是个人意见。 lide658 你好:我也曾经做过PCR-array芯片,首先我觉得你实验组和对照组各做3张完全可以计算P值,其次一般认为有差异的倍数是3倍,若是条件放宽一点,2倍的也可以入选。对于结果分析方面,有些公司
、 miRNA靶基因的验证与miRNA靶基因 的预测方法相比,对miRNA靶基因进行实验验证的方法并不多,目前还没有一个快速、简便、高通量的鉴定方法。最直接的鉴定方法是, 利用荧光定量PCR及Westernblot方法分别检测转染或敲低miRNA后细胞中mRNA水平及蛋白水平的变化,从而确定miRNA与靶基因的对应关系。这种方法能够直接鉴定出miRNA的靶基因, 准确度高但不能鉴定miRNA的靶位点。转染或敲低miRNA:方式主要有两种,一种是构建miRNA过表达载体的稳定表达系统,一种是人工合成miRNA










