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Skeletal Development: Cartilage Condensation: BMP1, BMPR1B, COL2A1, SOX9.
Ossification: ACVR1, AHSG, BGLAP (Osteocalcin), BMP1, BMP2, BMP3, BMP4, BMP5, BMP6, BMP7, BMPR1A, BMPR1B, BMPR2, CDH11, CHRD, COL1A1, COL2A1, CSF1 (MCSF), CTSK, DLX5, EGFR, FGF2 (bFGF), FGFR2, GDF10 (BMP3B), GLI1, IGF1, IGF1R, IGF2, IHH, MMP2, MMP8, MMP9, NOG, RUNX2, SMAD1, SMAD3, SOX9, SP7, SPP1 (Osteopontin), TGFB1, TGFB2, TGFB3, TNFSF11, TWIST1.
Osteoclast Differentiation: BGLAP (Osteocalcin), CSF1 (MCSF), TNF, TNFSF11.
Osteoblast Differentiation: ACVR1, BGLAP (Osteocalcin), BMP2, BMP4, BMP6, BMP7, BMPR1A, BMPR1B, BMPR2, CHRD, COL1A1, DLX5, FGF2 (bFGF), FGFR2, GDF10 (BMP3B), GLI1, IGF1, IHH, NOG, RUNX2, SMAD1, SMAD3, SP7, SPP1(Osteopontin), TWIST1.
Other Genes: ALPL, COMP, FGFR1, TGFBR1, TGFBR2.
Bone Mineral Metabolism: Bone Mineralization: ACVR1, AHSG, BGLAP (Osteocalcin), BMP2, BMP4, BMP6, BMP7, BMPR1A, BMPR1B, BMPR2, FGFR2, IGF1, SMAD3, SOX9, TGFB1, TGFB3, TWIST1.
Calcium Ion Binding and Homeostasis: ANXA5, BGLAP (Osteocalcin), CALCR, CDH11, COMP, EGF, FGF2 (bFGF), ITGB1, MMP2, MMP8, TGFB1, VDR.
Extracellular Matrix (ECM) Molecules: Collagens: COL10A1, COL14A1, COL15A1, COL1A1, COL1A2, COL2A1, COL3A1, COL5A1.
ECM Protease Inhibitors: AHSG, SERPINH1.
ECM Proteases: CTSK, MMP10, MMP2, MMP8, MMP9, PHEX.
Other Genes: ALPL, BGN, FLT1.
Cell Adhesion Molecules: Cell-Cell Adhesion: BMP1, BMPR1B, CDH11, COL14A1, COL2A1, EGFR, ICAM1, IHH, ITGB1, SOX9, TGFB1, TNF, TNFSF11, VCAM1.
Cell-Matrix Adhesion: CD36, COL3A1, CSF1 (MCSF), ITGA1, ITGA2, ITGA3, ITGAM, ITGB1, SMAD3.
Other Genes: BGLAP (Osteocalcin), COL15A1, COL5A1, COMP, FN1, TNF.
Growth Factors: CSF2 (GM-CSF), CSF3 (GCSF), EGF, FGF1, FGF2 (bFGF), GDF10 (BMP3B), IGF1, IGF2, PDGFA, VEGFA, VEGFB.
Transcription Factors: GLI1, NFKB1, RUNX2, SMAD1, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMAD5, SOX9, TWIST1.
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文献和实验简介:什么是PCR芯片? 实时定量PCR是检测基因表达最灵敏,最可靠的方法。通过在试验过程中,实时监测荧光染料的信号变化,反映样品中的基因拷贝数。实时定量PCR线性范围广(能达到5个数量级),因此可以检测同一样品中表达量极低的基因和表达量很高的基因。但是,由于实时定量PCR需要制备标准曲线和同时分析内参基因,因此,每次实验只能检测少数几个基因的表达水平,若要检测大量基因,则工作量巨大,耗时长久。 通过简单的,经过优化的实时定量PCR体系,如SuperArray的RT2ProfilerTM
基因表达的检测有几种方法。经典的方法(仍然重要)是根据在细胞或生物体中所观察到的生物化学或表型的变化来决定某一特定基因是否表达。随着大分子分离技 术的进步使得特异的基因产物或蛋白分子的识别和分离成为可能。 随着重组 DNA 技术的运用,现在有可能检测。分析任何基因的转录产物。目前有好几种方法广泛应用于 于研究特定RNA分子。这些方法包括原位杂交、NORTHERN凝胶分析、打点或印迹打点、S-1 核酸酶分析和RNA酶保护研究。这里描述 RT-PCR 从 RNA 水平上检查基因表达的应用
基因芯片技术具有快速多样、微型化和自动化等特点在生物医学领域广泛的应用。但由于其基本原理是基于核酸杂交技术,有着内在的缺陷,实验的敏感性和重复性都存在一定问题。核酸杂交较适合于检测基因的表达,不易检测基因组DNA的基因的重排,突变和缺失。而大多数肿瘤性疾病和一些遗传变异和表型的改变与后者有关。为了解决上述问题,我们将芯片技术与荧光PCR技术相结合,设立设计一种含有大量微反应池的PCR基因芯片,以期能快速、准确的对基因的重排,突变和缺失等基因变异进行检测。常规PCR反应产物的检测是电泳后观察获得
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