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磷酸化蛋白质组
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cusabio
翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,在生命现象的许多关键调节机制中,蛋白质的磷酸化是重要的翻译后修饰,它与信号传导,细胞周期,生长发育以及癌症机理等诸多生物学问题有密切关系。因此,对于蛋白质磷酸化的研究对阐明蛋白质的功能具有重要意义。武汉华美生物蛋白质组平台根据客户需求,可提供磷酸化蛋白质组全谱鉴定技术服务。
磷酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本的为研究对象,目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的位点。对蛋白样本进行酶解,TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与相应数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,同时通过生物信息软件计算出磷酸化位点。
定量方面,磷酸化蛋白质常常选择iTRAQ定量或SWATH定量方法。
图:TiO2或者IMAC富集磷酸化流程图。
我公司的技术特点
磷酸化蛋白质组全谱鉴定以组织、细胞等较为复杂样本的为研究对象,目的在于鉴定样品中发生磷酸化的蛋白质以及相应的位点。对蛋白样本进行酶解,TiO2或IMAC富集磷酸化肽段,5600-plus质谱检测,利用得到的质谱谱图与相应数据库搜索比较,从而得到肽段序列结果,同时通过生物信息软件计算出磷酸化位点。
定量方面,磷酸化蛋白质常常选择iTRAQ定量或SWATH定量方法。
图:TiO2或者IMAC富集磷酸化流程图。
我公司的技术特点
- 高效率、高准确性:单次实验可鉴定上千种磷酸化位点,快速构建某种细胞或者组织的磷酸化蛋白修饰谱。精确定位到单个氨基酸位点的磷酸化修饰。
- 碎裂模式选择:提供目前性能最佳的TOF-CID碎裂模式,提高磷酸化位点鉴定准确性。
- 定量准确:该方法可以较为准确的发现多个样品间同一蛋白质磷酸化位点的差异;
- 磷酸化位点鉴定,依据位点打分过滤,可靠性评估;
- 磷酸化肽段和磷酸化蛋白质鉴定;
- 磷酸化位点、磷酸化肽段差异表达分析;
- 磷酸化蛋白质GO 功能注释、Pathway代谢通路注释;
- 差异磷酸化蛋白GO、Pathway功能富集分析。
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文献和实验相关实验
prince1101 非磷酸化抗体是识别总得蛋白的,比如AKT。 P-AKT和AKT其实只差一些磷酸基,分子量稍大点,以前听别人讲P-AKT和AKT之间有shift,有时候WB是可以做出来的。 用的是梯度胶?分子量在68KD左右。应该怎么样来配胶呢?梯度胶的浓度? 谢谢! prince1101 希望高手能赐教! ourlab 某些 AKT抗体,如cell
本节课重点介绍磷酸化修饰位点的蛋白激酶预测、GSEA 方法、 iKAP方法等知识点。
haohuaiyong 各位战友,最近我在做磷酸化STAT3的检测,用cell signaling公司的磷酸化检测抗体与总STAT3抗体做WB,实验组(bFGF+EGF)与阳性对照的磷酸化水平是有增加的,但总STAT3在实验组是减少的而在对照组是强表达的,我看别人的文献都是将总STAT3作为阳性内参一样,应该是不变化的啊,为什么我做了好多次都是不均一的啊?实在是搞不明白,请做过这方面的战友帮忙!谢谢! dzhzh 你的灌注
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