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- 2025年07月03日
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我们的使命
北京泱深生物信息技术有限公司（Y.Shen Bioinfo Co., LTD）是在北京海淀区注册成立的一家生物信息学技术服务的专业化机构。公司团队核心成员全部为硕士和博士学历，拥有多名国内外知名的生物信息学专家顾问、软件工程研究员以及多位具有生物学、生物信息学、计算机、软件工程等多学科背景的复合型专家人才，其中绝大多数研发骨干成员具有海外留学背景和相关科研经历。北京泱深生物信息技术有限公司是北京地区最早成立的专业围绕为客户提供生物信息学领域的高端技术服务和测序数据分析平台综合服务的专业机构之一。
我们的目标
公司聚焦生物信息学、基因组科学、系统生物学领域，借助先进的生物信息技术手段深入挖掘和揭示生物医学数据背后的规律和奥秘，为生命科学研究、临床医学疾病预防、疾病诊断和治疗用药提供快速、经济、有效、可靠的数据分析平台服务和专业技术支持。公司始终坚持以丰富的生物信息学、基因组学、系统生物学以及相关领域的优质资源为依托，凭借强大的科学研究实战经验，并关注当前生命科学研究最前沿动态，努力打造中国生物信息学技术服务的领先品牌。
北京泱深将致力于为国内外的生物医学研究者提供专业的生物信息学数据分析服务，秉承专业高效的服务态度、严谨求实的服务宗旨践行未来中国生物信息学产业化发展道路。目前，公司与复旦大学、北京师范大学、华东师范大学、解放军军事医学科学院和一大批生物医学技术公司建立了长期的合作关系，在此基础上大力推进产学研相结合的一体化创新平台建设。
我们的理念
北京泱深的一切内外事务都始终围绕“诚信，务实，创新”的科学理念，秉承“专业高效的服务态度、严谨求实的服务宗旨”。公司把目标定位为打造国内一流、具有一定国际影响的生物信息技术专业公司。公司致力于生物信息以及相关领域的数据分析平台建设、生物信息学软件设计和联合开发、技术服务、技术培训以及相关软件销售等。目前，公司已经与国内外多家生命科学领域科研机构建立了密切的合作关系。
我们的优势
目前，一批国内外知名的生物信息学专家和学者给予了公司大力的支持，使北京泱深生物信息技术有限公司具有巨大的发展潜力和业务项目实施能力。目前，公司拥有合理的人才梯队，人员组成主要是高学历的青年开发和业务人员。除此之外，公司已经拥有完善的软硬件设施，为业务的顺利开展提供了必备的条件。
服务目标：
为生物医学科研院所、医疗科研机构、生物制药企业的生物信息数据分析需求提供高质量的专业技术服务。
为客户提供包括基因芯片、蛋白质芯片、质谱及大规模测序相关的实验设计、数据分析及结果验证在内的全方位服务解决方案。
我们致力于满足生命科学基础研究、生物医药与农业技术应用的信息分析需求。
我们致力于为客户的国际研究论文提供分析支持以及撰写支持。
我们致力于将客户的高端论文发表目标作为我们的工作目标。
基因组学相关分析
1) 序列拼接，BAC及中小基因组组装；
2) 序列比对，同源性搜索；
3) 多序列全局比对，同源进化树构建；
4) EST的基因组定位，可变剪切形式确定；
5) Promoters预测与查找，CpG岛，调控元件等；
6) 重复序列注释：SSR,STR,LINE,SINE,Transposons等；
7) 基因预测及基因结构分析：真核，原核，mRNA/cDNA编码区预测；
8) Non-Coding RNA的预测与注释：
tRNA预测及二级结构分析、rRNA预测
MiRNA预测及结合靶点预测
siRNA预测及甲基化位点预测
9) 分子进化相关分析：分歧年代、进化树、进化压力（Ka,Ks）；
10) EST序列/一般序列分析
序列基本分析：去除载体，污染，聚类，拼接
表达谱分析：特异表达基因，共调控基因
Unigene的功能注释及分类
基于EST的SNP分析
11) 基因的功能注释及分类
NCBI非冗余核酸库（NT）
NCBI非冗余蛋白库（NR）
SwissProt蛋白数据库
Kegg Pathway数据库
COG/KOG蛋白家族数据库
Interpro&GO蛋白功能位点
结构域（domain）数据库
蛋白质组学相关分析
1）蛋白的抗原表位分析
2） 蛋白二级/三级结构预测
3）蛋白质亲/疏水性、等电点分析
4）跨膜蛋白、信号肽等性质分析和相似性分析
Microarray/Biochio生物芯片数据分析
1) 对基因芯片的表达谱数据进行预处理与归一化分析；
2) 使用多种统计方法筛选具有显著性差异表达的基因；
3) 对差异表达基因数据进行多种聚类分析，并给出树状图；
4) 结合基因GO分类(gene ontology)、信号转导数据库（KEGG），进行相关路径分析、差异表达基因的功能分类、所属信号通路分类等。
北京泱深生物信息技术有限公司
电话：010-68169950 13520784977 18001305720
网址：
电邮：biodata@preintell.com
丁香通展台：http://www.biomart.cn/yshenbioinfo/index.htm
地址：北京市海淀区苏州街1号绿创大厦057
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文献和实验【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（adiponectin）蛋白质序列； 2、使用BioEdit软件对上述蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成、和疏水性等基本性质分析； 3、对人脂联素蛋白质序列进行基于NCBI/Blast
前两天在网上提问，有不少朋友回答，万分感谢，后来我的一位同学给我寄来了科学出版社的一本蛋白质预测的书的WORD版，放在这儿给需要的人看看。 涉及到的因特网资源 物理性质预测： Compute PI/MW http://expaxy.hcuge.ch/ch2d/pi-tool.html Peptidemass http://expaxy.hcuge.ch/sprot/peptide-mass.html TGREASE ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta
检索 当网络不是很畅通时或并不急于得到较多数量的蛋白质序列时，可采用EMAIL方式进行序列检索。 蛋白质基本性质分析 蛋白质序列的基本性质分析是蛋白质序列分析的基本方面，一般包括蛋白质的氨基酸组成，分子质量，等电点，亲水性，和疏水性、信号肽，跨膜区及结构功能域的分析等到。蛋白质的很多功能特征可直接由分析其序列而获得。例如，疏水性图谱可通知来预测跨膜螺旋。同时，也有很多短片段被细胞用来将目的蛋白质向特定细胞器进行转移的靶标（其中最典型的例子是在羧基端含有KDEL序列特征的蛋白质将被引向内质网。WEB
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