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- 详细信息
- 技术资料
- 提供商:
宜明生物
- 服务名称:
Long gRNA (e.g. pegRNA) IVT synthesis and purification
一、服务概述
Long gRNA (e.g. pegRNA) IVT synthesis and purification 服务聚焦长链向导 RNA(如 Prime Editing Guide RNA,pegRNA)的体外转录(IVT)合成与高纯度纯化,为精准基因编辑领域的科研机构、生物医药企业提供从序列设计、专项制备到严格质控的一站式解决方案。
相较于常规短链 gRNA,长链 gRNA(通常 100-300nt,pegRNA 因含引物结合区与逆转录模板区,长度多为 150-250nt)结构更复杂、合成难度更高,但其在 Prime Editing(引导编辑)、Base Editing(碱基编辑)等精准编辑技术中不可或缺。本服务通过长链 RNA 专属 IVT 体系与定制化纯化工艺,高效合成高活性长链 gRNA,结合多维度质控确保其结构完整性与编辑功能,助力客户在单碱基修复、基因插入 / 缺失、疾病基因精准矫正等领域突破技术瓶颈。
二、核心优势
1. 长链专属 IVT 体系,攻克合成效率与结构稳定难题
针对长链 gRNA 易形成二级结构、转录过程易终止的痛点,研发长链 RNA 专属 IVT 反应体系:采用高 processivity 重组 T7 RNA 聚合酶(经突变优化,延伸能力提升 60%),搭配特殊缓冲液(含二级结构解旋辅助因子),有效抑制转录过程中的链终止现象,使长链 gRNA(如 200nt pegRNA)合成效率较传统体系提升 50% 以上;添加 RNA 伴侣蛋白与抗氧化剂,减少长链 RNA 因折叠导致的聚集与降解,确保产物完整性(完整片段比例≥90%)。针对 pegRNA 的特殊结构(含引物结合区 PBS、逆转录模板区 RT),通过序列预优化(如调整 GC 分布、避免连续互补序列)与转录温度梯度调控,保障关键功能区域的正确合成,避免因结构异常影响引导编辑效率。
2. 精准序列定制,适配多类长链 gRNA 应用场景
基于专业生物信息学平台,提供高度个性化的长链 gRNA 序列设计与合成服务:
- pegRNA 定制:根据靶基因编辑需求(单碱基替换、小片段插入 / 缺失),精准设计 PBS 区(10-15nt,确保与靶位点附近序列互补)、RT 区(含编辑模板,长度按需调整)及向导序列(20nt),支持添加 5' 端磷酸化(增强与 Prime Editor 蛋白结合)、3' 端 2' - O - 甲基化修饰(提升体内稳定性);
- 其他长链 gRNA 定制:适配 Base Editing 的长链 sgRNA(如携带脱氨酶招募元件)、CRISPRa/i 的长链 gRNA(含转录激活 / 抑制结构域结合位点),可定制荧光标记(FAM/Cy5)或生物素标记,满足可视化追踪与蛋白互作研究需求。同时提供脱靶效应预测(针对长链 gRNA 潜在的额外结合位点)与序列优化建议,降低非特异性编辑风险。
3. 分级纯化工艺,保障长链 RNA 高纯度与低杂质
针对长链 RNA 分子量大、易吸附杂质的特性,采用 “磁珠预纯化 - 高效液相色谱(HPLC)- 超滤脱盐” 分级纯化策略:
- 磁珠预纯化:通过特异性核酸结合磁珠,高效去除未反应核苷酸、短片段 RNA(<50nt)及部分蛋白杂质;
- HPLC 纯化:采用离子交换柱(针对长链 RNA 的电荷特性优化洗脱梯度),精准分离完整长链 gRNA 与降解片段、DNA 模板、聚合酶等杂质,确保主峰纯度≥98%;
- 超滤脱盐:使用 30kDa 截留分子量超滤膜,去除 HPLC 洗脱液中的盐类与小分子杂质,同时浓缩样品,避免长链 RNA 因反复浓缩导致的降解。最终产品内毒素含量<0.05 EU/μg,RNase 残留<0.01 U/μg,满足细胞转染(尤其是干细胞、原代细胞)、动物体内引导编辑实验等高标准需求。
4. 全流程质控,聚焦长链 gRNA 功能有效性
建立针对长链 gRNA 的专项质控体系,覆盖 “合成 - 纯化 - 功能验证” 全流程:
- 结构完整性检测:采用毛细管电泳(CE)与琼脂糖凝胶电泳(高分辨率胶)双重验证,确保长链 gRNA 无明显降解(降解片段比例<10%),分子量与理论值偏差<2%;
- 浓度与纯度检测:通过 Qubit 荧光定量仪(选用 RNA 高灵敏度试剂盒)与 Nanodrop 检测,确保 A260/A280 比值 ,A260/A230 比值(无盐类与有机物污染);
- 功能活性验证:针对 pegRNA,通过体外引导编辑实验(In Vitro Prime Editing Assay),检测其与 Prime Editor 蛋白复合物的编辑效率(提供测序验证数据,编辑效率≥30%);针对其他长链 gRNA,通过体外切割实验或转录调控实验验证功能活性;
- 稳定性检测:通过 zeta 电位检测评估长链 gRNA 的胶体稳定性(电位绝对值≥15mV,避免储存中聚集),并提供 4℃、-20℃、-80℃储存条件下的稳定性数据(监测 1 个月内的完整性变化)。每批次产品提供详尽质检报告,批次间性能差异<5%,为实验结果的可重复性提供保障。
5. 灵活交付与增值服务,适配精准编辑科研节奏
配备长链 RNA 专项生产与质控团队,标准订单 5-7 个工作日内完成交付(pegRNA 等复杂结构长链 gRNA 需额外 1-2 个工作日),加急订单最快 3 个工作日出具产物;支持从 μg 级(科研小试,如细胞系编辑验证)到 mg 级(中试生产,如动物模型构建)的产量定制,可根据客户需求分批次交付(避免反复冻融影响长链 RNA 活性)。针对引导编辑高通量筛选项目,提供批量长链 gRNA 合成服务,并可提供混样、分装(按实验需求分至 96 孔 / 384 孔板)及与 Prime Editor 蛋白的预复合物制备服务,大幅提升实验效率。
三、服务规格与交付内容
1. 服务规格
| 服务项目 | 服务详情 |
| 合成类型 | pegRNA、长链 sgRNA(Base Editing/Crispra/i 用)、其他定制长链 gRNA |
| 合成长度 | 100-500nt(常规),支持>500nt 超长链 gRNA 定制(需提前评估可行性) |
| 修饰选项 | 5' 端:磷酸化、荧光标记(FAM/Cy3/Cy5)、生物素;3' 端:2' - O - 甲基化、荧光标记、生物素;全链修饰:假尿苷、m6A(提升稳定性与降低免疫原性) |
| 产量范围 | 1μg-50mg(可根据需求定制更大规模) |
| 适配系统 | Prime Editing、Base Editing(CBE/ABE)、CRISPRa/i、其他依赖长链 gRNA 的基因编辑系统 |
2. 检测项目
| 检测内容 | 周期 |
| Total Potein Residue | 一周 |
| Plasmid DNA Residue | 一周 |
| Endotoxin assay | 一周 |
| BioBurden | 两周 |
3. 交付内容
- 高纯度长链 gRNA 样本:无菌无酶低吸附离心管分装(避免长链 RNA 吸附管壁,10-200μL / 管),干冰运输,-80℃储存可稳定保存 6 个月以上(建议分装后避免反复冻融);
- 完整质检报告:根据客户需求可提供包含浓度 / 纯度数据、电泳图谱(CE 与琼脂糖凝胶)、功能活性验证结果(如 pegRNA 引导编辑效率测序报告)、修饰效率检测(如适用)、内毒素与 RNase 残留检测报告;
- 使用指南:涵盖长链 gRNA 溶解方法(推荐使用无酶水,避免剧烈震荡)、与编辑蛋白(如 Prime Editor、Base Editor)的孵育比例(如 1:1.5 molar ratio)、转染条件优化建议(针对长链 RNA 转染效率低的问题,提供转染试剂选择与浓度调整方案)、储存与稳定性说明;
- 原始数据文件:根据客户需求可提供包含电泳原始图谱、荧光定量数据、功能验证实验原始测序数据与分析结果,方便客户追溯与发表需求。
四、应用场景
1. 精准基因编辑基础研究
用于 Prime Editing 技术研究,通过合成高质量 pegRNA,实现靶基因的单碱基修复(如纠正致病点突变)、小片段插入(如标签序列)或缺失,助力基因功能解析(如研究特定氨基酸突变对蛋白功能的影响);用于 Base Editing 优化,通过长链 gRNA 携带新型脱氨酶或增强子元件,提升碱基编辑效率与编辑窗口,探索复杂基因调控机制。
2. 疾病模型精准构建
在动物模型(小鼠、大鼠、非人灵长类)或类器官模型构建中,通过长链 gRNA(如 pegRNA)介导的精准编辑,实现疾病相关基因突变的定点引入(如模拟人类遗传病的点突变)或矫正(如修复模型动物的致病突变),构建更贴近临床实际的疾病模型,用于药物筛选与治疗方案验证(如评估基因治疗药物对突变位点的修复效果)。
3. 基因治疗研发
针对单基因遗传病(如镰状细胞贫血、囊性纤维化),设计靶向致病突变的 pegRNA,与 Prime Editor 蛋白联合递送(如通过病毒载体或 LNP),实现体内靶基因的精准修复,避免传统 CRISPR-Cas9 导致的双链断裂与随机插入 / 缺失风险;用于 CAR-T 细胞精准改造,通过长链 gRNA 介导的基因编辑(如定点插入 CAR 基因、敲除免疫检查点基因),提升 CAR-T 细胞的抗肿瘤活性与安全性。
4. 合成生物学与工业生物技术
用于微生物(细菌、酵母)的精准代谢工程改造,通过长链 gRNA(如携带代谢通路调控元件)实现关键酶基因的定点突变(提升酶活性)或代谢节点的精准调控,构建高产菌株用于工业酶、生物燃料或药用化合物(如抗生素、抗体片段)的高效合成,推动合成生物学产业应用。
五、服务流程与技术支持
1. 服务流程
- 需求沟通:客户提供靶基因序列、编辑类型(单碱基替换 / 插入 / 缺失)、长链 gRNA 类型(如 pegRNA)、修饰需求及产量要求,技术团队提供序列设计方案(含 PBS/RT 区设计细节)、脱靶预测报告与方案报价;
- 序列确认与合成:客户确认序列后,启动长链专属 IVT 合成,全程监控转录过程(通过实时电泳监测产物完整性);
- 纯化与质控:完成合成后进行分级纯化,同步开展专项质控检测(含功能活性验证);
- 交付与售后:质检合格后,产品与报告同步交付,提供后续实验技术支持。
2. 技术支持
- 专业咨询:提供长链 gRNA 设计(尤其是 pegRNA 的 PBS/RT 区优化)、编辑系统选择(如 Prime Editor 版本适配)、转染方案设计等专业咨询,协助解决长链 RNA 转染效率低、编辑效率不稳定等问题;
- 问题解决:针对长链 gRNA 降解、编辑效率不达预期等问题,提供 troubleshooting 方案(如调整储存条件、优化序列结构、调整编辑蛋白比例);
- 定制化培训:为客户团队提供长链 gRNA 合成与应用相关培训,包括 IVT 原理、长链 RNA 纯化技术、引导编辑实验操作等,提升客户自主实验能力。
Long gRNA (e.g. pegRNA) IVT synthesis and purification 服务以 “长链适配、精准高效、稳定可靠” 为核心,通过专项技术优化与严格质控,为精准基因编辑领域提供高质量长链 gRNA 产品与专业服务,助力科研人员与企业突破长链 RNA 合成技术瓶颈,加速精准基因编辑技术在基础研究与临床转化中的应用。
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