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Umibio,专注于外泌体研究!
外泌体是什么?
外泌体(Exosome)是由细胞内多泡体与细胞膜融合后,释放到细胞外的一种直径约30~150nm的膜性囊泡。学术界主流观点认为外泌体的产生过程为:细胞膜内陷形成内体,然后再形成多泡体(MVB),最后分泌到细胞外成为外泌体。研究表明,所有类型哺乳动物细胞在培养过程中都可以分泌产生外泌体。外泌体是细胞分泌的膜性囊泡;外泌体是由活细胞分泌的一种亚细胞成分,由磷脂双分子及其携带的膜性分子组成;其主要成分为蛋白质、酶、mRNA、miRNA、DNA片段和脂质等。
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外泌体miRNA测序
外泌体microRNA(miRNA)测序是利用高通量测序平台,对样本中富集到的18-32 nt的小RNA片段进行测序,对获得的有效数据进行序列长度分布统计,将筛选后的高质量序列分类注释,获得样品中包含的各组分及表达量信息,实现small RNA序列的鉴定、靶基因分析和功能注释等多项分析。

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文献和实验案例:通过深度测序分析乳腺癌中 microRNA 的序列和表达 背景: microRNAs 调控很多对肿瘤发生非常重要的基因。乳腺癌中很多 microRNAs 是下调的,但系统的乳腺癌中 microRNA 的表达分析还没有被报道。 目的: 利用 Illumina HiSeq2000 测序平台对不同类型乳腺癌组织和细胞进行测序,分析其 microRNAs 表达差异。 结果:通过对 11 个正常乳腺组织,17 个非转移
了来自结肠直肠癌(CRC)患者和健康人血清外泌体中的 miRNA 表达有明显的差异。 作者先通过外泌体 miRNA 测序(4 个 CRC 患者和 2 个健康人)观察外泌体的 miRNA 差异表达,选取了 29 个下调 miRNAs 和 9 个上调 miRNAs 作为候选标志物。 再使用 RT-qPCR(165 个 CRC 患者和 153 个健康人)进一步验证,最后发现与健康人相比,早期 CRC 患者外泌体 miR-99b-5p 和 miR-150-5p 的表达水平显著降低,术后外泌体 miR-99b-5
,也算是分数较高的了。就标题来看,不难发现,这四篇文章的共同点都是关于外泌体(exosomes)的研究,这个是近几年兴起的热点。 外泌体之所以火热,是因为它包含了 miRNA 和蛋白等分子,可以运送到受体细胞,调节各种生理过程。 就目前的研究来看,几乎所有的细胞都分泌外泌体,而且外泌体参与众多生理病理过程,尤其是肿瘤方面。以外泌体为研究背景或者研究对象,是目前很常见的研究思路。 上面的四篇文章,第一篇是从临床病例开始的,后面几篇则是从生信挖掘开始的。 接下来就说说临床数据、生信分析和外泌体如何完美结合
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