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液相杂交捕获AAV整合位点检测

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  • 珠海
  • 2026年01月07日
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      珠海舒桐医疗科技有限公司

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      液相杂交捕获AAV整合位点检测

    液相杂交捕获检测技术基于碱基互补配对原理,通过设计和合成特异性核酸探针,针对AAV质粒和宿主基因组中的整合区域进行靶向捕获。首先,根据客户提供的AAV质粒设计合成针对AAV质粒全长的特异性探针,待检测的DNA样本需先构建预文库。随后,将预文库与探针进行液相杂交并使用链霉亲和素磁珠进行捕获,从而富集含有AAV序列和宿主基因组序列的整合片段。最后,通过PCR扩增进一步增强整合位点的信号强度并构建最终的测序文库[3]。

    相比于仅关注ITR区域的传统方法,该方法采用AAV质粒全长制备特异性探针的检测策略能够更全面地捕捉到AAV的整合情况,进一步提高了AAV整合位点检测的全面性和灵敏度[3]。

    图片54.png

    图1. 液相杂交捕获检测AAV病毒载体整合流程示意图

     

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