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NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 是基于亚硫酸氢盐转化原理针对 DNA 样本开发的甲基化转化试剂。该转化 模块基于磁珠纯化的方案可在 2 hr 内将未甲基化的胞嘧啶高效转化为尿嘧啶,且利于自动化开展;同时可衔接纳昂达 NadPrep® 双链 甲基化文库构建方案和 NadPrep® 单链甲基化文库构建方案,支持在多种类型的起始样本中灵活选择。
产品特色
- 兼容多类型样本且支持宽泛的投入量范围
- 胞嘧啶转化率高效稳定
- 卓越的 5mC 和 5hmC 检测灵敏度
- 操作便捷利于自动化开展
亚硫酸氢盐转化流程

*接头连接产物示意图以 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) 为例。
产品表现
文库产出及转化效率

图 1. 不同投入量样本的文库产出及转化效率。人类男性基因组 DNA 标准品 (Promega, G1471) 利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 和 NadPrep® DNA Methyl Bisulfite Conversion Module 构建文库,Illumina Novaseq 6000, PE 150 测序。A. 文库产出;B. 转化效率。
捕获表现

图 2. 不同甲基化水平样本的捕获表现。50 ng 不同甲基化水平的模拟样本利用 NadPrep® Methyl Library Preparation Module 搭配 NadPrep® Methyl Stubby Adapter (UDI) Module (with 10 nt Index) 经亚硫酸氢盐转化后构建文库,以甲基化 demo Panel (60 K) 进行杂交捕获,Illumina Novaseq 6000, PE 150 测序,On- target 按照 reads 数计算。A. 捕获数据比对率和中靶率;B. 靶区域覆盖度;C. Fold 80 base penalty;D. 去重后平均测序深度。
注:样本为人甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1),经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%, 50% 和 100%)。Vendor Q* 和 Vendor Z* 分别为:Vendor Q* 和 Vendor Z* 亚硫酸氢盐转化模块。
甲基化水平准确率

图 3. 不同甲基化水平样本的甲基化靶向测序表现。A. 理论甲基化水平与实际检测到的甲基化水平的比较;B. 靶区域 CpG 甲基化水平。
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NadPrep® DNA 甲基化亚硫酸氢盐转化模块
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