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NadPrep®️ 甲基化文库
企业认证
NadPrep Methyl Library Preparation Kit (for Illumina®)
纳昂达(南京)
-20℃
NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒(for Illumina®)是针对 Illumina® 高通量测序平台开发的双链 DNA 甲基化测序文库构建试剂盒。
本试剂盒可用于构建全基因组甲基化测序文库,结合纳昂达科技的液相杂交捕获系列产品,可实现靶向甲基化测序文库富集。
文库产出及转化效率
图 1. 不同转化方式的建库表现。A.文库产出,B. 不同投入量 λ DNA C 碱基转化效率及 C. 插入片段分布。利用 NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 (for Illumina®) 搭配 NadPrep® Methyl UDI Adapter Module (for Illumina®) 分别采用酶学 (EM) 和重亚硫酸盐(BS) 方法转化后构建文库。
注:A & B 样本为人类基因组 DNA (Promega, G1471);C 样本为人甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo,D5014-1),经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%,10%,50% 和 100%),投入量均为 50 ng。
捕获表现
图 2. 不同转化方式的捕获表现。A. 捕获数据比对率和中靶率, B. 靶区域覆盖度,C. 覆盖均一性和一致性及 D. GC 偏好性。利用 NadPrep® 甲基化文库构建试剂盒 (for Illumina®) 搭配 NadPrep® Methyl UDI Adapter Module (for Illumina®) 分别采用酶学和重亚硫酸盐方法转化后构建文库,以甲基化 demo Panel (60 K) 进行杂交捕获,Novaseq 6000,PE 150 测序,按照 reads 数计算。
注:样本为人甲基化阳性对照 100% Methylated DNA (zymo, D5014-2) 和阴性对照 0% Methylated DNA (zymo, D5014-1),经不同比例混合以模拟不同甲基化水平 (0%,10%,50% 和 100%),投入量均为 50 ng。
甲基化水平准确率
图 3. NadPrep® 不同甲基化水平样本经不同方式转化的甲基化靶向测序表现。A. 经酶学转化的靶区域 CpG 甲基化水平;B. 经重亚硫酸盐转化的靶区域 CpG 甲基化水平及 C.不同甲基化水平样本的实际检测结果。利用 NadPrep® 甲基 化文库构建试剂盒 (for Illumina®) 搭配 NadPrep® Methyl UDI Adapter Module (for Illumina®)分别采用酶学和重亚硫酸盐方法转化后构建文库,以甲基化 demo Panel (60 K) 进行杂交捕获,Novaseq 6000,PE 150 测序。
类别
产品
详情
货号
甲基化建库模块
NadPrep® Methyl Library Preparation Module (for Illumina®), 24 rxn
24 rxn
1002141
NadPrep® Methyl Library Preparation Module (for Illumina®), 96 rxn
96 rxn
1002142
甲基化接头模块
NadPrep® Methyl UDI Adapter Kit Set A1 (for Illumina®), 24 rxn
1003311
NadPrep® Methyl UDI Adapter Kit Set B1 (for Illumina®), 96 rxn
1003321
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