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修饰蛋白质组学之糖基化鉴定

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  • 2026年01月06日
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    糖基化是在酶的控制下在蛋白质或脂质上附加糖类的过程,起始于内质网,结束于高尔基体。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,并在糖基转移酶和糖苷酶的剪切、加工下形成各种类型的糖链。

    糖基化蛋白质组学的核心任务是利用组学的手段,从全局上去寻找发生糖基化修饰的位点,解析糖链的结构,鉴定完整的糖肽,探索糖蛋白在生命活动中扮演的角色和生物学功能。

    一、技术特点:

    (1)采用亲水作用色谱在肽段层面富集完整N-糖肽,提高了富集效率;

    (2)采用二甲基标记定量技术,提高定量的准确性;

    (3)利用自主开发的GPSeeker软件,可实现对完整N-糖肽的定性和定量分析。

     

    二、适用范围:

    (1)N-糖基化修饰的糖链结构解析(适用甘露糖型、复合型、杂合型N-糖链);

    (2)寻找疾病相关蛋白糖基化修饰规律;

    (3)分析糖蛋白糖链和糖结合蛋白相互作用的关联性;

    (4)探讨糖类相关基因和糖结合蛋白基因调控机制;

    (5)助力抗体药物质量评价。

     

    三、实验流程:

    图片

    四、需提供:

    1、需鉴定的样品;

    2、样品信息:需详细说明样品物种、来源、含量、状态及其他基本信息。

     

    五、结果交付:

    (1)实验报告一份,含具体实验流程及糖蛋白质组学鉴定及定量结果(生物信息学分析)。

    (2)生物信息学分析内容包括:

    ①糖蛋白、N-糖基化修饰位点、完整N-糖肽的数目、完整N-糖肽的定量信息、位点糖链的糖型及结构。

    ②鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布;

    ③糖蛋白的GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;

    ④糖蛋白Domain预测;

    ⑤糖蛋白亚细胞定位;

    ⑥糖蛋白蛋白网络互作预测。

     

    六、实验周期:

    自送样起40-60个工作日。

    图片

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