修饰蛋白质组学之糖基化鉴定

糖基化是在酶的控制下在蛋白质或脂质上附加糖类的过程，起始于内质网，结束于高尔基体。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质，和蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键，并在糖基转移酶和糖苷酶的剪切、加工下形成各种类型的糖链。

糖基化蛋白质组学的核心任务是利用组学的手段，从全局上去寻找发生糖基化修饰的位点，解析糖链的结构，鉴定完整的糖肽，探索糖蛋白在生命活动中扮演的角色和生物学功能。

一、技术特点：

（1）采用亲水作用色谱在肽段层面富集完整N-糖肽，提高了富集效率；

（2）采用二甲基标记定量技术，提高定量的准确性；

（3）利用自主开发的GPSeeker软件，可实现对完整N-糖肽的定性和定量分析。

 

二、适用范围：

（1）N-糖基化修饰的糖链结构解析（适用甘露糖型、复合型、杂合型N-糖链）；

（2）寻找疾病相关蛋白糖基化修饰规律；

（3）分析糖蛋白糖链和糖结合蛋白相互作用的关联性；

（4）探讨糖类相关基因和糖结合蛋白基因调控机制；

（5）助力抗体药物质量评价。

 

三、实验流程：

四、需提供：

1、需鉴定的样品；

2、样品信息：需详细说明样品物种、来源、含量、状态及其他基本信息。

 

五、结果交付：

（1）实验报告一份，含具体实验流程及糖蛋白质组学鉴定及定量结果（生物信息学分析）。

（2）生物信息学分析内容包括：

①糖蛋白、N-糖基化修饰位点、完整N-糖肽的数目、完整N-糖肽的定量信息、位点糖链的糖型及结构。

②鉴定结果特征分布：肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布；

③糖蛋白的GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释；

④糖蛋白Domain预测；

⑤糖蛋白亚细胞定位；

⑥糖蛋白蛋白网络互作预测。

 

六、实验周期：

自送样起40-60个工作日。