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糖基化是在酶的控制下在蛋白质或脂质上附加糖类的过程,起始于内质网,结束于高尔基体。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基形成糖苷键,并在糖基转移酶和糖苷酶的剪切、加工下形成各种类型的糖链。
糖基化蛋白质组学的核心任务是利用组学的手段,从全局上去寻找发生糖基化修饰的位点,解析糖链的结构,鉴定完整的糖肽,探索糖蛋白在生命活动中扮演的角色和生物学功能。
一、技术特点:
(1)采用亲水作用色谱在肽段层面富集完整N-糖肽,提高了富集效率;
(2)采用二甲基标记定量技术,提高定量的准确性;
(3)利用自主开发的GPSeeker软件,可实现对完整N-糖肽的定性和定量分析。
二、适用范围:
(1)N-糖基化修饰的糖链结构解析(适用甘露糖型、复合型、杂合型N-糖链);
(2)寻找疾病相关蛋白糖基化修饰规律;
(3)分析糖蛋白糖链和糖结合蛋白相互作用的关联性;
(4)探讨糖类相关基因和糖结合蛋白基因调控机制;
(5)助力抗体药物质量评价。
三、实验流程:

四、需提供:
1、需鉴定的样品;
2、样品信息:需详细说明样品物种、来源、含量、状态及其他基本信息。
五、结果交付:
(1)实验报告一份,含具体实验流程及糖蛋白质组学鉴定及定量结果(生物信息学分析)。
(2)生物信息学分析内容包括:
①糖蛋白、N-糖基化修饰位点、完整N-糖肽的数目、完整N-糖肽的定量信息、位点糖链的糖型及结构。
②鉴定结果特征分布:肽段长度、蛋白覆盖度分布、unique肽段分布;
③糖蛋白的GO功能分类、COG注释、Pathway通路注释;
④糖蛋白Domain预测;
⑤糖蛋白亚细胞定位;
⑥糖蛋白蛋白网络互作预测。
六、实验周期:
自送样起40-60个工作日。

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文献和实验注:如同时要求外泌体抽提、鉴定及蛋白质组学,请将样本要求量进行加和。 备注:请明确提供的样本体积。细胞上清及尿液,超过 50ml,每 50mL 算作一个 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。血清、血浆、关节液、脑脊液进行超速离心,每 5mL 算作 1 个样本,以此计算样本数,核算抽提周期。
分子结构内部的寡糖仍然是未修饰的高甘露糖型 N-糖链,但位于蛋白质表面的糖苷将成熟转变为复杂形式的 N-糖苷 [17] 。这种现象也同样发生在 O-糖苷上。因此,要鉴定植物糖蛋白的糖基化,不仅需要鉴定糖-蛋白连接及附着在糖蛋白上的寡聚糖的结构,而且还要确定其在蛋白分子骨架上的潜在糖基化位点的分布/定位。 本章的目的是向植物蛋白质组学工作者介绍一些工具和方法,用于确定所鉴定的蛋白是否为糖蛋白,类别以及蛋白骨架上糖苷侧链的位置。本章的最后部分将论述植物糖蛋白质组学中的糖蛋白鉴定方法。2. 材料
蛋白质组学多维蛋白质鉴定技术 面对1D―SDS和2D―PAGE技术在回收胶中质量极端(很大或很小)、疏水性很强或pH值很高的蛋白质时遭遇到的某些困难,Yates和其合作者(Wolters,Washburn和Yates,2001)发展了一种非基于凝胶的方法,即采用一种所谓的鸟枪法技术来鉴定尽可能多的蛋白质。多维蛋白质鉴定技术(multi-demensional protein identification technology,MuDPIT)的原理可以描述如下:将全部蛋白质复杂混合
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