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一、为什么要进行蛋白质组全谱分析?
蛋白质组(Proteome)指由一个物种或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。蛋白质全谱分析目的在于鉴定样本中尽可能多的肽和蛋白质混合物的组分。基于质谱技术的全谱分析,可为蛋白高通量的定量和修饰分析提供参考信息。
科沿有道可以对复杂样本进行蛋白种类分析,并进行相应的生物信息分析包括蛋白质的鉴定、GO分类和代谢通路的分析等,为蛋白质组学提供有力工具。

二、目前可进行蛋白质组全谱分析的物种有哪些?
只要物种在蛋白质组数据库中存在足够多的数据、基因组已知或 EST(或转录组)数据足够丰富,均可进行蛋白质组全谱分析。对以上条件均不满足的物种,可在进行蛋白质组全谱分析的同时,做一个基因组或转录组测序,以便为蛋白质组全谱分析提供支持。因此,理论上,所有的物种均可进行蛋白质组全谱分析。
三、全谱分析中不同分析类型的优缺点?
1)SDS‐PAGE‐LC‐MS/MS分析通过电泳技术对样品中的蛋白质进行分离,对分子量在10KDa~100KDa的蛋白质分离效果好、分辨率高。但是,对分子量小于 10KDa 和大于 100KDa的蛋白质、低丰度蛋白、极端酸碱性蛋白、疏水蛋白(如膜蛋白)的分离则存在一些难以克服的困难;
2)HPLC‐LC‐MS/MS分析通过HPLC对样品中的蛋白质进行分离,分离效能高、灵敏度高、应用范围广、分析速度快,此分离方法在对酸碱性、疏水性的蛋白质分离效果优于SDS‐PAGE分离。HPLC的缺点是存在“柱外效应”,被分离物质的任何扩散和滞留都会显著地导致色谱峰的加宽,产生假阳性。
四、应该如何选择全谱分析方法?
若待分析对象中包含内在膜蛋白等极性较强的疏水性蛋白质和分子量较大(>100KDa)或较小(<10KDa)的蛋白质时,建议采用 HPLC‐LC‐MS/MS分析法。若待分析对象不以膜蛋白等极性较强的疏水性蛋白质为主且分子量多集中于10~100KDa范围时,建议采用SDS‐PAGE‐LC‐MS/MS分析法。
五、全谱分析一般能鉴定到多少种蛋白?
这取决于分析样品的复杂程度、数据库完善度、蛋白含量和蛋白质组分离程度等。如植物来源的样本中蛋白质种类和数量通常比动物来源的样本多,动物组织样本中蛋白质种类和数量比其血液样本多。通常情况下,全谱分析可以鉴定到1000~3000种蛋白。
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文献和实验PCR 过程中免不了遇到各种问题,如扩不出目的条带、有非特异性条带、空白对照出现扩增产物、扩增产物跑胶弥散或拖尾、高保真 PCR 出现突变等等。今天师兄就带大家来聊一聊 PCR 的常见问题应该如何解决。 PCR 实验包括反应体系的配置和反应程序,反应体系中有模板、引物、dNTP、酶、buffer、Mg2+,反应程序又包括预变性、变性、退火、延伸和彻底延伸。那么在 PCR 出现问题时主要是从反应体系的各个组分和反应程序上来进行调节优化。 Q1: 实验组无扩增条带 A1
沉淀。 5、开封后的 ECS 试剂有沉淀出现是否可以继续使用? 答:沉淀物如果是结晶状,建议 56 度水浴摇晃混匀。如果结晶消失,则可以继续使用,少量沉淀不影响提取效果。 6、试剂提取试剂盒加溶液 B后无豆花状固体,此时是否可以继续实验? 答:不可以,必须明确在看到豆花状沉淀,溶液变透明后才可进行下一步操作。此时需要继续加入溶液B,并在37度水浴加热,溶液看到豆花状沉淀。 7、如何选择血浆和脐带血样本进行外泌体研究? 答:血清和脐带血都是常见的外泌体样本来源。由于血液在高压过程中会受到剧烈
service pack更新? 不要执行该操作。除非美国应用生物系统公司代表通知您更新操作系统,否则请不要更新控制定量 PCR 仪的计算机的操作系统。新版本的 Microsoft Windows 操作系统有可能与SDS 软件存在冲突,并导致仪器不能正常运行。如果您希望安装 service pack(更新包)以更新操作系统,应查看随 SDS 软件提供的版本说明,避免兼容性问题。 5、应该备份哪些数据? 应该定期备份您的实验数据,备份频率推荐每周一次,用光盘刻录。同时您也应该备份定量
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