4D-泛素化修饰蛋白质组学

· 产品定义

蛋白泛素化修饰（Ubiquitination）常伴随泛素-蛋白酶体降解，引起蛋白稳定性变化，参与增殖凋亡、内吞、免疫等各种生物调控过程。其发生过程是通过一个三酶级联 (E1-E2-E3)反应，使得单或多个泛素分子连接到蛋白氨基酸（Lys）侧链上，并常伴随蛋白酶体降解，调控蛋白表达水平变化。发生泛素化修饰的赖氨酸共价连接泛素分子，即两个甘氨酸K-ε-GG残基，使分子量产生114.1 Da的质量偏移。利用质谱可准确测定分子量是否发生114.1Da的质量偏移，从而检测泛素化修饰肽段及位点。 4D-label free泛素化蛋白组学是基于timsTOF Pro质谱仪，通过数据依赖性采集-同步累积连续碎裂（ddaPASEF）扫描模式进行泛素化差异蛋白质组学分析。4D-label free修饰组，利用了离子淌度分离，能根据分子的形状、截面积属性，可有效区分修饰同分异构多肽，极大提高修饰的鉴定深度，以更少上样量、更快扫描速度，实现蛋白质组学在覆盖深度、灵敏度、通量方面的全面性提升。

 

· 技术路线

 

                  

· 技术优势

1. 4D技术加持，提高定量的准确性、鉴定深度，更加适合微量样本；

2. 克服标记定量蛋白质组学技术在样本数量上的限制，灵活方便；

3. 基于质谱平台（Bruker timsTOF pro），检测速度提升近一倍；

4. 经验丰富——超18年蛋白平台服务经验，拥有丰富的高水平项目文章；

5. 数据保证——采用进口金标抗体，数据结果稳定可靠；

6. 系统解决方案——提供修饰组学至验证、上下游联合分析，实现快捷”一站式”服务。

 

· 数据分析

 

· 推荐组合产品

蛋白表达水平全面解析：转录组+蛋白组+泛素化组。

 

· 推荐应用领域

1. 植物发育与抗逆；

2. 感染与免疫研究；

3. 衰老再生及退行性疾病。

 

· 送样建议(特殊样本可)

 

 

· 参考文献

1.The deubiquitinase USP6 affects memory and synaptic plasticity through modulating NMDA receptor stability.2019. Plos Biology.（IF 8.029）

采用泛素化修饰组学揭示人科动物特异基因USP6在智力进化中的功能

2.Genome-wide identification of U-box genes and protein ubiquitination under PEG-induced drought stress in potato. 2021. Physiologia Plantarum. (IF 4.50) 【客户文献】

Label free泛素化蛋白组学协助研究马铃薯抗干旱胁迫分子机制

3.Proteomic Analysis of Ubiquitinated Proteins in Rice (Oryza sativa) After Treatment With Pathogen-Associated Molecular Pattern (PAMP) Elicitors. 2019. Frontiers in Plant Science. (IF 5.753) 【客户文献】

Label free泛素化蛋白组学助力水稻防御机制研究

4.Rewiring of the ubiquitinated proteome determines ageing in C. elegans. 2021. Nature.(IF 49.962)

Label free泛素化蛋白组学发现抗衰老新机制