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- 2026年04月29日
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一、技术简介：
Label-free（蛋白质非标记定量技术）是通过LC-MS/MS技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用稳定同位素标签，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。二、实验流程：
蛋白质样本—实验预判—Trypsin—LC-MS/MS—蛋白质定性定量—数据分析（*包括蛋白质定量、SDS-PAGE测试、酶解和质谱分析，对样本质量及样本之间的平行性进行初步判断） 。三、技术优势：
1、无需昂贵的同位素标签做内部标准，实验耗费低； 2、对样本的操作少，从而使其最接近原始状态； 3、不受样品条件的限制，克服标记定量技术在对多个样本进行分析方面的缺陷； 4、对实验操作稳定性、重复性要求高，要求至少做三次生物重复。四、应用方向：
1、农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等；
2、 畜牧业：肉类及乳品质研究，致病机理研究等；
3、 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等；
4、生物医药：药物作用机理，药效评价，药物开发等；
5、微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；
6、海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等；
7、 生物能源、环境科学领域：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危定风险评估研究等；
8、食品营养：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。
五、数据分析：
1、蛋白质鉴定结果统计表；
2、蛋白质定量结果统计表；
3、GO功能注释统计表；
4、KEGG通路注释统计表；
5、蛋白质表达火山图；
6、差异表达蛋白质聚类分析；
7、差异表达蛋白质GO注释分析；
8、差异表达蛋白质KEGG通路分析；
9、KEGG通路图详细展示；
10、差异表达蛋白质构建蛋白质互作网络图。
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文献和实验本节课程介绍了label-free定量蛋白质组学技术的原理及应用。主要包括：（1）以MS数据为例，系统介绍label-free技术进行蛋白质定量的技术流程和原理。（2）介绍免费的label-free分析套件—Maxquant和Perseus。（3）以免疫沉淀（IP）数据为例，展示label-free进行蛋白质互作定量的应用。（4）以数据为例，展示label-free在外泌体蛋白定量分析中的应用。
Label-Free Proteomics of Serum
In this chapter we describe a method to analyze human serum with the goal of discovering disease-related changes in the serum proteome. The methodology is based on the removal of the six most abundant serum proteins by immunoaffinity
定量蛋白质组学分析 定量蛋白质组学分析（Quantitative Proteomics）是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白，结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能，同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记（Label）和非标记的（Label Free）定量策略。 定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括：Label Free定量蛋白组分析、SILAC与免疫
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