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- 详细信息
- 技术资料
- 库存:
43
- 保质期:
2 年
- 供应商:
上海西格
- 保存条件:
-20°C
- 规格:
50T
描述:
该试剂盒采用独特的裂解液,可快速可靠的从动物组织、细胞、细菌、病毒、全血、血清、血浆、体液、病毒液、棉拭孖等样品中纯化出高纯度的 DNA。可直接用于限制性酶切反应、PCR、文库构建、Southern 杂交等多种分子生物学实验。

操作方法:
(一)RNA 含量较高的动物组织、细胞、细菌样本的提取方法
(1) 样品组织悬液的制备:动物组织用研钵研磨:将动物组织研磨粉碎,并取 40~60 mg 加入到 1.5ml EP 管中,加入 280 μl 无菌水,漩涡震荡 10s混合均匀,打开管盖加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液和 5 μl 的 RnaseA,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除RNA。动物组织用钢珠研磨:取 50~80 mg 组织加入到 400 μl 无菌水,在研磨仪上研磨 1min。在 1.5 ml EP 管底部加入 50 μl 的Buffer AP4 裂解液,并在管盖上加入 5 μl 的 RnaseA,取 280 μl 研磨好的组织悬液到 1.5 ml EP 管中,漩涡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。悬浮的细胞(104~108 个)或细菌(106~1011 个):在 1.5 ml EP 管底部加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液,并在管盖上加入5 μl 的 Rnase A,直接吸取 280 μl 样品到上述 EP 管中,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。细胞或细菌沉淀:可用 280 μl 无菌水重悬细胞和细菌沉淀,并加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液和 5 μl 的 RnaseA,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。
(2)RNA 消化完毕后,向上述溶液中加入 20 μl 的蛋白酶 K,漩涡 10s 混合均匀,并置于 56℃水浴锅(或室温条件下)中消化 5min。
(3)消化完毕后,向上述溶液中加入 500 μl 的 Buffer LB5,漩涡混合 15s 后,13000rpm 最高转速离心 2min。将上清液倒入到吸附柱中。
(4)13000rpm 离心 1min,弃过柱液。向吸附柱中加入 500 μl 的 Washing Buffer,13000rpm 离心 15s。弃过柱液,并重复此步骤一次。
(5)将吸附柱重新放回离心机,13000rpm 空离心 2min,将残留的乙醇彻底甩干。
(6)将吸附柱芯放入到 1.5 ml 收集管中,向吸附柱芯中加入 60~150 μl DNA Elution Buffer,室温放置 1min,13,000rpm离心 2min,洗脱液即为基因组 DNA,冷冻保存。
(二)RNA 含量较低的样本(全血、血清、血浆、体液、病毒液、棉拭孖浸泡液等)的提取方法在 1.5 ml EP 管底部预先加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液,在管盖上加入 20 μl 的蛋白酶 K,直接吸取 280 μl 的液体样本到 Buffer AP4 裂解液中。上下颠倒,并漩涡混合 10s,使得样品、Buffer AP4 裂解液、蛋白酶 K 混合均匀,并置于 56℃水浴锅中(或室温)消化 5min。按照上述步骤(3)-(6)进行上柱、漂洗、洗脱操作。
PCR反应条件优化:
1、变性温度和时间:
20min全能基因组DNA提取试剂盒保证模板DNA解链完全是保证整个PCR扩增成功的关键。加热90~95°C, 30~60s,再复杂的DNA 分子也可变性为单链。温度过高或高温持续时间过长,可对Taq酶活性和dNTP分子造成损害。
2、复性温度和时间:
PCR扩增特异性取决于复性过程中引物与模板的结合。复性温度越高,产物特异性越高。复性温度越低,产物特异性越低。需根据引物的Tm值具体设定。
3、延伸温度和时间:
一般位于Taq酶最适作用温度70~75°C之间。引物小于16个核苷酸时,过高的延伸温度不利于引物与模板的结合,可以缓慢升温到70~75°C。延伸反应时间,可根据待扩增片段的长度而定,小于1kb, 1min足够;大于1kb需加长延伸时间。Taq酶可根据1kb/min增加时间。这里需要注意,延伸时间过长可能出现非特异扩增。因此需要设置恰到好处的延伸时间。
4、循环数:
其他参数选定后,PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度。理论上说20〜25次循环后,PCR产物的积累即可达到最大值,实际操作中由于每步反应的产率不可能达到100%,因此不管模板浓度是多少,20~30次是比较合理的循环次数。循环次数越多,非特异扩增增加。
PCR的特点:
特异性强:使用两对引物进行扩增提高了特异性,第一轮PCR中由外引物错配产生非特异性产物,同时在第二轮PCR中内引物与错误片段配对扩增的概率极低,降低了扩增多个靶位点的可能性。
灵敏度高:进行两轮PCR扩增,可以执行更多的循环,从低拷贝样本中扩增得到足量的产物,克服了单次扩增平台期限制,提高PCR的灵敏度。
降落PCR与温度梯度PCR的区别:
降落PCR与温度梯度PCR都是对反应体系中的退火温度进行优化,但两者在原理上有所不同。
温度梯度PCR是为了找到最适的退火温度,设置不同的退火温度进行多管PCR,将其分别放置在PCR仪中的不同温度模块进行反应,最终找到最适的退火温度,并进一步以此退火温度进行普通PCR扩增。
降落PCR是为了提高反应的特异性,通过设计一系列不断降低的退火温度,在同一PCR管内进行PCR扩增,最终获得大量的特异性扩增产物。
与温度梯度PCR相比,降落PCR更有优势。温度梯度PCR需要多次反应或多管反应找到最适的退火温度,之后还需以找到的最适退火温度再次进行PCR,才能得到较好的扩增效果,操作比较繁琐。降落PCR只需一次反应就可以获得很好的扩增效果,避免了对每对引物进行最适退火温度的优化和测定工作。
降落PCR适用于不确定引物的最适Tm值,或引物扩增效果不佳时,不了解目的模板同源性程度,使用降落PCR可以快速、特异的得到目的扩增片段。根据不同实验的需要,降落PCR还可与其它PCR方法同时使用,如实时定量降落PCR、竞争降落PCR等。
公司正在出售的产品:
该试剂盒采用独特的裂解液,可快速可靠的从动物组织、细胞、细菌、病毒、全血、血清、血浆、体液、病毒液、棉拭孖等样品中纯化出高纯度的 DNA。可直接用于限制性酶切反应、PCR、文库构建、Southern 杂交等多种分子生物学实验。

操作方法:
(一)RNA 含量较高的动物组织、细胞、细菌样本的提取方法
(1) 样品组织悬液的制备:动物组织用研钵研磨:将动物组织研磨粉碎,并取 40~60 mg 加入到 1.5ml EP 管中,加入 280 μl 无菌水,漩涡震荡 10s混合均匀,打开管盖加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液和 5 μl 的 RnaseA,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除RNA。动物组织用钢珠研磨:取 50~80 mg 组织加入到 400 μl 无菌水,在研磨仪上研磨 1min。在 1.5 ml EP 管底部加入 50 μl 的Buffer AP4 裂解液,并在管盖上加入 5 μl 的 RnaseA,取 280 μl 研磨好的组织悬液到 1.5 ml EP 管中,漩涡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。悬浮的细胞(104~108 个)或细菌(106~1011 个):在 1.5 ml EP 管底部加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液,并在管盖上加入5 μl 的 Rnase A,直接吸取 280 μl 样品到上述 EP 管中,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。细胞或细菌沉淀:可用 280 μl 无菌水重悬细胞和细菌沉淀,并加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液和 5 μl 的 RnaseA,漩涡震荡 10s 混合均匀,室温消化 5min,以去除 RNA。
(2)RNA 消化完毕后,向上述溶液中加入 20 μl 的蛋白酶 K,漩涡 10s 混合均匀,并置于 56℃水浴锅(或室温条件下)中消化 5min。
(3)消化完毕后,向上述溶液中加入 500 μl 的 Buffer LB5,漩涡混合 15s 后,13000rpm 最高转速离心 2min。将上清液倒入到吸附柱中。
(4)13000rpm 离心 1min,弃过柱液。向吸附柱中加入 500 μl 的 Washing Buffer,13000rpm 离心 15s。弃过柱液,并重复此步骤一次。
(5)将吸附柱重新放回离心机,13000rpm 空离心 2min,将残留的乙醇彻底甩干。
(6)将吸附柱芯放入到 1.5 ml 收集管中,向吸附柱芯中加入 60~150 μl DNA Elution Buffer,室温放置 1min,13,000rpm离心 2min,洗脱液即为基因组 DNA,冷冻保存。
(二)RNA 含量较低的样本(全血、血清、血浆、体液、病毒液、棉拭孖浸泡液等)的提取方法在 1.5 ml EP 管底部预先加入 50 μl 的 Buffer AP4 裂解液,在管盖上加入 20 μl 的蛋白酶 K,直接吸取 280 μl 的液体样本到 Buffer AP4 裂解液中。上下颠倒,并漩涡混合 10s,使得样品、Buffer AP4 裂解液、蛋白酶 K 混合均匀,并置于 56℃水浴锅中(或室温)消化 5min。按照上述步骤(3)-(6)进行上柱、漂洗、洗脱操作。
| 货号 | 产品名称 | 规格 |
| XG-P3115 | 20min全能基因组DNA提取试剂盒 | 50T |
PCR反应条件优化:
1、变性温度和时间:
20min全能基因组DNA提取试剂盒保证模板DNA解链完全是保证整个PCR扩增成功的关键。加热90~95°C, 30~60s,再复杂的DNA 分子也可变性为单链。温度过高或高温持续时间过长,可对Taq酶活性和dNTP分子造成损害。
2、复性温度和时间:
PCR扩增特异性取决于复性过程中引物与模板的结合。复性温度越高,产物特异性越高。复性温度越低,产物特异性越低。需根据引物的Tm值具体设定。
3、延伸温度和时间:
一般位于Taq酶最适作用温度70~75°C之间。引物小于16个核苷酸时,过高的延伸温度不利于引物与模板的结合,可以缓慢升温到70~75°C。延伸反应时间,可根据待扩增片段的长度而定,小于1kb, 1min足够;大于1kb需加长延伸时间。Taq酶可根据1kb/min增加时间。这里需要注意,延伸时间过长可能出现非特异扩增。因此需要设置恰到好处的延伸时间。
4、循环数:
其他参数选定后,PCR循环次数主要取决于模板DNA的浓度。理论上说20〜25次循环后,PCR产物的积累即可达到最大值,实际操作中由于每步反应的产率不可能达到100%,因此不管模板浓度是多少,20~30次是比较合理的循环次数。循环次数越多,非特异扩增增加。
PCR的特点:
特异性强:使用两对引物进行扩增提高了特异性,第一轮PCR中由外引物错配产生非特异性产物,同时在第二轮PCR中内引物与错误片段配对扩增的概率极低,降低了扩增多个靶位点的可能性。
灵敏度高:进行两轮PCR扩增,可以执行更多的循环,从低拷贝样本中扩增得到足量的产物,克服了单次扩增平台期限制,提高PCR的灵敏度。
降落PCR与温度梯度PCR的区别:
降落PCR与温度梯度PCR都是对反应体系中的退火温度进行优化,但两者在原理上有所不同。
温度梯度PCR是为了找到最适的退火温度,设置不同的退火温度进行多管PCR,将其分别放置在PCR仪中的不同温度模块进行反应,最终找到最适的退火温度,并进一步以此退火温度进行普通PCR扩增。
降落PCR是为了提高反应的特异性,通过设计一系列不断降低的退火温度,在同一PCR管内进行PCR扩增,最终获得大量的特异性扩增产物。
与温度梯度PCR相比,降落PCR更有优势。温度梯度PCR需要多次反应或多管反应找到最适的退火温度,之后还需以找到的最适退火温度再次进行PCR,才能得到较好的扩增效果,操作比较繁琐。降落PCR只需一次反应就可以获得很好的扩增效果,避免了对每对引物进行最适退火温度的优化和测定工作。
降落PCR适用于不确定引物的最适Tm值,或引物扩增效果不佳时,不了解目的模板同源性程度,使用降落PCR可以快速、特异的得到目的扩增片段。根据不同实验的需要,降落PCR还可与其它PCR方法同时使用,如实时定量降落PCR、竞争降落PCR等。
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