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上海百趣生物医学技术有限公司
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NGM 2 Pro 代谢组学检测服务
新一代代谢组学NGM 2解决了代谢组学中物质鉴定不准确、鉴定数量少的问题,是代谢组学核心研究手段之一,可高效完成样本中代谢物的检测定性,即通过液质联用(Liquid Chromatograph Mass Spectrometer, LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。
由于代谢物的数量繁多,种类多样,目前为止没有一种方法可以将样本中全部的代谢物提取出来,NGM 2 Pro 为保证尽可能多的代谢物被检出,采取联合使用多种类型色谱柱的方式,全面覆盖非极性代谢物、极性代谢物、非极性脂质、极性脂质,进一步提升样本中物质的鉴定数量,为标志物筛选、机制研究提供更多的可能性。

技术优势
代谢物鉴定准确率翻倍提升,高达98% (Level 1)
队列间稳定检出物质高达60%(Level 1)
准确鉴定代谢物数量近10倍提升,高达800+ Level 1代谢物
可靠代谢物总体鉴定数量2000+
严格的6D质控
样本要求
样本要求
血清、血浆 200 μL/sample
尿液 200 μL/sample
组织 200 mg/sample
粪便、肠道内容物 200 mg/sample
细胞 、微生物1×10(7) cells/sample
培养液 200 μL/sample
生物学重复
样本数量: 植物和微生物n≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析
其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师
检测平台
Orbitrap Exploris 120, Thermo
常规项目周期
20个自然日起,含基础数据分析(从收到客户预付款并收到样品之日起)
应用方向
临床疾病:生物标志物寻找、治疗疗效监控、疾病分型
食品:食品营养学、临床营养学
畜牧:科学饲养、疾病防治、发育研究
药物:药物研发、毒副作用评价
中医药:治疗机理、作用靶点分析
环境毒理:暴露组学

技术路线

案例分析
▶ 通过知识驱动的多层代谢网络从已知到未知的代谢注释
Metabolite annotation from knowns to unknowns through knowledge-guided multi-layer metabolic networking
期刊: Nature communication
影响因子: 16.6
时间: 2022年
▶ 研究背景
基于液相色谱-质谱 (LC-MS) 的非靶向代谢组学可以检测样本中已知和未知的代谢物。 然而,未知代谢物的注释是非靶向代谢组学的主要挑战。
▶ 研究结果
在MetDNA2中,作者开发了一种方法,即知识驱动的多层网络技术(Knowledge-guided multi-layer networking, KGMN),以实现代谢组学中从已知到未知的全局代谢物注释。 KGMN方法集成了三层网络,包括基于知识的代谢反应网络、知识引导的MS/MS相似网络和全局代谢峰相关性网络。
▶ 结果展示
利用上述原理,MetDNA 2将已知代谢物的鉴定准确度从70%提升至95%以上,同时还可以注释到约 100-300 个未知代谢物。生物样本中代谢物的鉴定数量可以达到2000-5000. MetDNA 2可以实现有效的未知注释,并大大推进常见生物样品中经常出现的未知代谢物的发现,从而破译非靶代谢组学中的未知物质。

Fig. 使用化学标准品验证两个未知物:肌苷和肌苷 5'-硫酸盐
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