
Xenium原位空间组学解决方案
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- Xenium的技术原理,其核心是基于Padlock探针的多轮荧光检测技术,它让脱胎于FISH技术的Xenium同时可检测基因数直接攀升500+!
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- 2025年07月16日
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- 详细信息
- 文献和实验
- 技术资料
- 提供商:
上海烈冰生物医药科技有限公司
- 服务名称:
Xenium原位空间组学
Xenium 更高分辨率的空间组学
01、原位洞察力
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揭示了细胞结构和功能之间的关系
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端到端原位平台,具有成像读数(不需要NGS)
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数百个具有亚细胞分辨率的RNA靶标
02、技术原理
Xenium的技术原理,其核心是基于Padlock探针的多轮荧光检测技术,它让脱胎于FISH技术的Xenium同时可检测基因数直接攀升500+!
1、样本准备
3、荧光探针杂交成像解码 数据可视化
03、解析Xenium技术方案的应用场景
使用Xenium Human Breast Panel的280个基因和33个附加基因(共313个)作为靶基因,研究人员选择乳腺导管原位癌组织连续切片,同时使用了Chromium单细胞、Visium空间技术和Xenium原位技术方案作对比,为我们详细展示了三种技术的高度互补性,以及Xenium方案在亚细胞空间分辨率上的强大优势。
04、Xenium经过验证和商品化的内容
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Human Breast 280 genes +100 可定制基因 | |
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Mouse Brain 247 genes +100 可定制基因 | |
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Human Brain 266 genes +100 可定制基因 | |
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Human Lung 289 genes +100 可定制基因 | |
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Human Skin 282 genes +100 可定制基因 | |
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Human Colon 325 genes +100 可定制基因 | |
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Human Multi-Tissue 377 genes +100 可定制基因 | |
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Mouse Multi-Tissue 379 genes +100 可定制基因 |
05、可视化易上手
- 形态学图像
- 细胞分割
- 每个细胞的转录本信息
- 无监督细胞聚类
强大的交互式本地可视化
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文献和实验,也可通过产生新的适应性突变来逃避治疗干预。与此同时,肿瘤细胞与微环境中的免疫细胞、基质细胞等通过复杂的信号交互进一步重塑生态位,持续推动肿瘤的进化进程。因此,深入解析肿瘤发生、发展与进化的分子机制,对于开发高特异性早期诊断标志物、精准预测疾病进展轨迹及制定个体化治疗策略具有至关重要的理论与临床价值。 接下来,我们将通过典型案例,阐述如何利用单细胞与空间组学技术解析肿瘤的发生、发展与进化过程。 案例一:空间原位分析构建食管癌单细胞多阶段空间动态演化图谱 发表期刊:Cancer Cell 影响
) 患者的成像质谱流式 (IMC) 数据集探究了 CAF 亚型的临床相关性,发现 s1-CAFs 与较短生存期的趋势相关 ,较高比例的 s4-CAFs 水平与较长的生存期显著相关。 研究意义 本研究运用 CosMx 和 MERSCOPE 平台对八种癌症类型中的癌症相关成纤维细胞(CAFs)进行了全面的空间转录组分析,并采用自有(Visium 和 COMET)与公共数据集(Xenium、CODEX 和 IMC)在独立空间组学平台进行验证,证实这些亚型在不同癌症类型和平台间具有保守性,并与特定肿瘤微环
亚群、Treg 亚群)表面或分泌的新型治疗靶点。 为个体化治疗(如基于 TIL 克隆状态选择免疫治疗、针对特定 CAF 亚群)提供理论依据。 单细胞测序技术极大地深化了我们对肿瘤复杂性、异质性和微环境互作的理解。然而,由于前处理的组织解离等步骤,它不可避免地「丢失」了细胞在原位组织中的空间位置信息,而这对于理解细胞间通讯、功能区域化(如免疫排斥区、侵袭前沿)和 TME 的三维组织结构至关重要。空间组学技术的兴起,正是为了弥补这一关键维度的缺失。 空间组学技术:描绘肿瘤微环境功能图谱
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