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- RNA上目前发现存在着170多种不同类型的转录后修饰，并且所有已知的RNA种类都可以被修饰，其中rRNA和tRNA的修饰最多。mRNA上的主要修饰类型包括m6A、m1A和m5C，除这些主流修饰以外，mRNA上也存在ac4C修饰。ac4C修饰虽然很早在酵母中发现（如下图），但是关于它的研究相对于m6A等修饰来说总体偏少。近期有不少研究发现人细胞的mRNA上存在ac4C修饰，由Writer NAT10/THUMPD1负责催化形成，可以促进mRNA翻译效率和维持稳定性。
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- 2026年02月14日
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- 详细信息
- 文献和实验
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武汉康测科技有限公司
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ac4C-seq(ac4C acRIP)
~ac4C修饰~
目前ac4C在人和酵母物种中的Writers已经鉴定出来，但是和m6A类似的Reader或Erasers蛋白还没有相关报道。随着研究的开展，这些蛋白会逐一鉴定出来，并形成完整的修饰调控机制。
与meRIP-seq类似，acRIP-seq只要换成识别ac4C的商业化抗体，就可以针对ac4C饰进行研究。
acRIP-seq的实验原理如下图所示：首先通过polyA捕获mRNA，或者通过rRNA剔除去掉rRNA，然后将获得的RNA打成100nt左右的小片段；之后使用ac4C特异性抗体进行免疫共沉淀，含有ac4C修饰的RNA片段被富集并回收；进而对回收的RNA进行文库构建、高通量测序和生物信息学分析，通过peak分析鉴定出ac4C修饰的位点。
您只需要提供足量的组织/细胞或RNA，我们将根据物种、RNA起始量为您推荐合适的acRIP实验方案~
Peak在mRNA上的分布
目前ac4C修饰模式报道相对较少，现有研究显示人mRNA的ac4C主要在CDS区5’端和5’UTR分布
Motif分析
上：实测结果 下：Cell文献结果
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文献和实验
conformation capture sequencing (4C-seq), a high-throughput version of the 3C technique that combines the 3C-on-chip (4C) protocol with next-generation Illumina sequencing. The method is presented for use in mammalian cell lines, but can be adapted to use
兰州大学第一医院李汛团队首次揭示胃癌演进中mRNA乙酰化修饰新机制
的细胞及动物实验结果揭示 NAT10 蛋白可以促进胃癌细胞 EMT 及体内转移。机制研究方面，团队利用 acRIP 技术构建了 NAT10 蛋白相关的胃癌细胞 ac4C 修饰图谱，并鉴定出 NAT10 介导的 mRNA ac4C 修饰的下游调控靶标 — COL5A1。 图 2. motif 图示敲降胃癌细胞基因中出现经典的 ac4C 修饰 motif（第一行）；在敲降胃癌细胞的 NAT10 基因表达之后，没有 ac4C 相关的 motif（第二行）。 图 3. IGV 基因峰图可见，与对照
Syntheses of DNA Duplexes That Contain a N4C‐Alkyl‐N4C Interstrand Cross‐Link
that Contain a Single N4C‐Alkyl‐N4C Interstrand Cross‐Link Basic Protocol 1: Synthesis of an N4C‐Ethyl‐N4C Cross‐Linked Duplex Basic Protocol 2: Purification of the Cross‐Linked Duplex Commentary
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