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ac4C-seq(ac4C a
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目前ac4C在人和酵母物种中的Writers已经鉴定出来,但是和m6A类似的Reader或Erasers蛋白还没有相关报道。随着研究的开展,这些蛋白会逐一鉴定出来,并形成完整的修饰调控机制。
与meRIP-seq类似,acRIP-seq只要换成识别ac4C的商业化抗体,就可以针对ac4C饰进行研究。
acRIP-seq的实验原理如下图所示:首先通过polyA捕获mRNA,或者通过rRNA剔除去掉rRNA,然后将获得的RNA打成100nt左右的小片段;之后使用ac4C特异性抗体进行免疫共沉淀,含有ac4C修饰的RNA片段被富集并回收;进而对回收的RNA进行文库构建、高通量测序和生物信息学分析,通过peak分析鉴定出ac4C修饰的位点。
您只需要提供足量的组织/细胞或RNA,我们将根据物种、RNA起始量为您推荐合适的acRIP实验方案~
Peak在mRNA上的分布
目前ac4C修饰模式报道相对较少,现有研究显示人mRNA的ac4C主要在CDS区5’端和5’UTR分布
Motif分析
上:实测结果 下:Cell文献结果
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