16S/ITS/18S扩增子测序

· 产品定义

扩增子测序是指对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段PCR产物进行高通量测序，突破传统微生物不可培养的缺点，获得环境样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与环境相关性等信息。

 

· 技术路线

 

· 技术优势

1. 样本处理经验丰富：粪便、内容物、土壤、水体、淤泥、发酵物等样本

2. 测序灵活：多种测序策略，可满足16S/18S/ITS不同高变区域的研究需求

3. 平台优、数据质量高：基于优质的Illumina NovaSeq测序平台，数据质量高

4. 分析内容丰富：可选择与各种代谢组学产品进行组学联合分析

 

· 数据分析

 

· 部分数据分析结果展示

 

· 推荐组合产品

1. 16S+代谢组：环境/宿主表型变化的微生物互作研究

2. 16S+宏基因组：环境/宿主微生物群落结构和功能潜能研究

3. 16S+代谢组+转录组：宿主和微生物的协调响应机制研究

 

· 推荐应用领域

1. 生理/病理机制：肠道/口腔/皮肤/生殖等微生物群落的影响机制

2. 植物共生胁迫：土壤根际微生物与植物的互作机制

3. 精准医学：肠道微生物及多组学疾病标志物

4. 药物研发：基于肠道微生物作用机制的药物研发

5. 环境能源：环境、土壤、水体微生物群落研究

 

· 送样建议(特殊样本可)

 

· 项目案例

文献名称：Depression and anxiety in patients with active ulcerative colitis: crosstalk of gut microbiota, metabolomics and proteomics

发表期刊：《Gut Microbes》（IF=10.245）

合作单位：江苏省中医院

文章摘要：溃疡性结肠炎（UC）患者通常并发精神障碍，肠道微生物群失衡和代谢紊乱被认为在UC或精神障碍中起重要作用，然而其多组学特征仍然知之甚少。在这项前瞻性观察性研究中纳入240名中国人群，使用16S rRNA测序、液相色谱/质谱分析了人群的肠道菌群、血清代谢组和蛋白质组；并研究了候选代谢物对结肠炎小鼠抑郁样行为的预防作用。总体上，58%的活动性UC患者患有抑郁症，50%患有焦虑症。与无抑郁/焦虑的UC患者相比，有抑郁/焦虑的UC患者的粪便微生物群落丰富度和多样性较低，乳酸杆菌属、月形单胞菌属、链球菌属和肠球菌属较多，而普氏菌属_9和毛螺菌属较少。大多数代谢物（例如，甘鹅去氧胆酸盐）在血清中增加，而少数代谢物（包括2′-脱氧-D-核糖和L-酸）减少，伴随着免疫球蛋白的普遍减少，并且这些变化的细菌、代谢物和蛋白高度相关。预防性给药2′-脱氧-D-核糖和L-酸可显著降低结肠炎小鼠的抑郁样行为，并减轻其结肠、血液和大脑中的炎性细胞因子水平。本研究确定了一个与活动性UC患者抑郁和焦虑相关的综合多组学网络，它由一组特定的肠道微生物群、代谢物和蛋白质组成，它们是UC和抑郁/焦虑患者临床干预的潜在目标。