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上海中科新生命生物科技有限公司
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蛋白修饰位点分析
· 产品定义
基于LC-MS/MS分析能够准确测定蛋白质或多肽分子质量这一特性,从而检测蛋白质或者多肽上位点发生何种修饰。可检测修饰类型如下: 磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化、戊二酰化、琥珀酰化、单甲基化、二甲基化、三甲基化。
· 技术路线
· 技术优势
1. 可一次性扫描三种常规修饰类型;
2. 分析不局限于常规PTM,可根据确定的氨基酸位点和修饰类型进行个性化靶向修饰分析。
· 数据分析
部分数据分析结果展示
· 推荐应用领域
1. 磷酸化:信号转导、细胞周期、生长发育及癌症机理等;
2. 糖基化:蛋白质折叠、更新以及免疫应答等;
3. 乙酰化:基因表达调控、细胞凋亡、细胞代谢、蛋白质稳定性以及神经退行性病变等;
4. 泛素化:细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA修复以及信号转导等;
5. 甲基化:染色质结构及转录调控等;
6. 丙酰化 / 丙二酰化 / 戊二酰化 / 琥珀酰化:主要存在于线粒体和细菌中,与代谢过程密切相关。
· 送样建议(特殊样本可)
· 参考文献
1. Nod factor receptor complex phosphorylates GmGEF2 to stimulate ROP signaling during nodulation.2021. Current Biology.(10.834) 【客户文献】
磷酸化位点分析助力揭示根瘤共生信号转导的新机制
2. O-GlcNAcylation and stablization of SIRT7 promote pancreatic
cancer progression by blocking the SIRT7-REGγ interaction. 2022. Cell Death and Differentiation (IF 15.828) 【客户文献】
O-GlcNAc糖基化修饰协助揭示肿瘤进展调控机制
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文献和实验1. Nod factor receptor complex phosphorylates GmGEF2 to stimulate ROP signaling during nodulation.2021. Current Biology.(10.834) 【客户文献】
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2. O-GlcNAcylation and stablization of SIRT7 promote pancreatic
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Bartlett 等人分析了 178 个酶(有结构报道)及他们的催化残基特征,并总结成文。催化残基定义:1. 直接参与催化,比如作为亲核试剂的残基.2. 对另外一个直接参与催化的残基或者水分子施加影响的残基(例如静电或者酸碱作用)。3. 稳定过渡态中间体的残基。4. 对底物或者辅因子施加影响,从而辅助催化。比如极化作用。平均每个酶有 3.5 个催化残基。残基的分布频率及所在的二级结构特征在所有催化残基中,有 65% 的残基是带电氨基酸(H, R, K, E, D),有 27% 的残基是极性氨
【求助】请教关于xbaI酶切位点甲基化的问题(看了这么多帖子,都好象没分析到位啊)
2012hunanjob 在xbaI酶切位点上:T^CTAGA碱基对应的是AGATC^T,因为质粒是双链,所以在质粒的xbaI酶切位点上中间肯定有GATC,所以说:我觉得理论上只要是dam+细菌提出来的质粒,xbaI酶切位点都受甲基化影响而切不开.但是我见过别人也是用dam+菌扩增过质粒,用xbaI也可以切开它的酶切位点~~~所以我就迷糊了,请各位大侠们多多指点,小弟在此感激不尽了~~~ 2012hunanjob 顶,有没有
相关专题 几个常用蛋白质分析网站,分享一下! 1.从氨基酸组成辨识蛋白质 ExPASy:http://www.expasy.ch/tools/ PROSEARCH:http://www.embl-heidelberg.de/prs.html 2.预测蛋白质的物理性质:等电点、分子 量、酶切特性、疏水性、电荷分布等 ExPASy:http://www.expasy.ch
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