• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购
        点赞
        收藏
        wx-share
        分享

        【共享】三大miRNA表达谱平台的比较

        丁香园论坛

        3319
        摘要:生物通 www.ebiotrade.com
          对于富含miRNA的样品,如大部分组织样品,TaqMan和miRCURY平台都很有可能产生好的结果。然而,在对低丰度miRNA样品(如血浆样品)进行图谱分析时,miRCURY平台的高灵敏度和线性似乎更胜一筹。
        生物通报道 为准确评估血浆中的miRNA水平,来自丹麦的研究人员对市场上常用的三个miRNA表达谱平台进行了比较。该研究成果发表在近期的《BMC Genomics》上。
        近几年来,microRNA(miRNA)的研究持续升温。在临床上,miRNA有潜力成为癌症的生物标志物。尽管miRNA在组织中很丰富,但它们在血浆中还是很稀少的。据报道,血浆中的总RNA水平大约在6-300 ng/ml,而miRNA只占了极小的一部分。因此,对于血浆中的miRNA定量,我们需要一个高灵敏度且在低浓度范围内有着线性表现的平台。
        基于这一目的,丹麦Aarhus University Hospital-Skejby的研究人员评估了三个常用的miRNA定量平台的性能。这三个平台分别为:Affymetrix的GeneChip miRNA 2.0 Array,Exiqon的miRCURY Ready-to-Use PCR, Human panel I+II V1.M以及ABI的TaqMan Human MicroRNA Array v3.0。利用加标有不同比例的174个合成miRNA的血浆样品,研究小组评估了三个平台的特异性、准确性、灵敏度和线性。
        他们发现,基于qRT-PCR的平台足够灵敏,能重复检测以人类血浆中丰度水平存在的miRNA,而芯片平台则不行。于是他们继续评估了这两个qRT-PCR平台的性能。结果表明,对于高水平的miRNA,两个qRT-PCR平台在特异性、重复性和回收率上都表现不错。而对于低水平的miRNA,miRCURY平台则表现出比TaqMan平台更好的灵敏度和线性。
        在TaqMan分析过程中,他们为改善灵敏度,还增加了预扩增步骤,但让人奇怪的是,TaqMan的灵敏度仍不敌miRCURY,这可能说明预扩增步骤在提高灵敏度的作用不如想象中的好。生物通 www.ebiotrade.com
        作者认为,对于富含miRNA的样品,如大部分组织样品,TaqMan和miRCURY平台都很有可能产生好的结果。然而,在对低丰度miRNA样品(如血浆样品)进行图谱分析时,miRCURY平台的高灵敏度和线性似乎更胜一筹。(生物通 薄荷)
        原文检索生物通 http://www.ebiotrade.com/newsf/2011-9/2011921174930908.htm
        Evaluation of two commercial global miRNA expression profiling platforms for detection of less abundant miRNAs
        BMC Genomics 2011, 12:435 doi:10.1186/1471-2164-12-435
        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序