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简单多肽、蛋白及生物工程制品分析
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本实验室以生物质谱技术为基础,主要研究方向为蛋白质组学,包括蛋白质的表达、定量、翻译后修饰等方法学及应用研究。
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糖修饰蛋白质结构分析及糖蛋白质组检测
基于亲水作用色谱(HILIC),对强亲水性和极性物质有特异的吸附作用,可与样品中具有糖基化修饰的肽段或糖链特异性结合,实现对样本中糖基化肽段和糖链特异性富集的目的。糖基化肽段富集完成后,可利用液相色谱-串联质谱、MALDI-TOF质谱等,对样品进行检测,解析糖链结构信息。
应用领域:
1.不同实验条件下糖基化蛋白质组变化及信号通路分析;
2.筛选候选糖蛋白标志物;
3.单个糖蛋白质的糖含量分析,糖链结构确认及定量分析。


技术优点:
1.独特的HILIC富集结合条件,可特异性富集细胞、组织、
单个糖蛋白质酶解混合物中的糖肽或糖链;
2.可开展糖修饰变化的定量比较分析。
可选仪器:
QExactive HF、Orbitrap Fusion
分析流程
样品经Trypsin 酶切后脱盐,用HILIC富集糖基化肽段,
经PNGF酶切之后分离糖链和糖肽,糖肽经液相色谱-串
联质谱分析获得糖基化位点信息、采用MALDI-TOF获得
糖链结构信息,Mascot等软件对质谱数据进行定性、定
量分析。
可选数据分析
- 糖链的鉴定与定量分析;
- 糖修饰位点确认分析
- 完整糖肽结构鉴定及定量;
样品要求
蛋白提取物:≥2mg
细胞:≥107
组织:动物组织≥100mg,植物组织≥100 mg
参考文献
1. Xinyuan Zhao, Cheng Ma, Huanhuan Han, Jing Jiang, Fang Tian, Jifeng Wang, Wantao Ying*, Xiaohong Qian*.Comparison and optimization of strategies for a more profound profiling of the sialylated N-glycoproteomics in human plasma using metal oxide enrichment. Analytical and Bioanalytical Chemistry.2013, 405(16): 5519-5529
2.Qichen Cao, Cheng Ma, Haihong Bai, Xianyu Li, Hui Yan, Yan Zhao, Wantao Ying* and Xiaohong Qian*. Multivalent Hydrazide-Functionalized Magnetic Nanoparticles for Glycopeptide Enrichment and Identification. Analyst.2014, 139: 603-609
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文献和实验进行全面审查。因此,本概述仅涉及当今蛋白质研究中研究的少数最常见类型的 PTM。此外,更多的重点放在磷酸化、糖基化和泛素化,因此这些 PTM 在各自的 PTM 专页中进行了更详细的描述。1、Phosphorylation:可逆的蛋白质磷酸化,主要发生在丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸残基上,是目前研究得最深入的翻译后修饰之一。磷酸化在细胞周期、生长、凋亡和信号转导等过程中起着重要的调控作用。在以下示例中,使用蛋白免疫印迹分析评价分别用表皮生长因子 (EGF) 和血小板衍生生长因子 (PDGF) 刺激血清
-!P-[S|T]-!P (!P 不是脯氨酸)“这样的特征,也有些少见的 N-X-C基序或非保守序列。综合FASP及亚细胞糖基化位点定位分析揭示,这些糖基化位点一般都朝向胞外区或朝向ER腔、高尔基体、溶酶体或者过氧化物酶体。那些与发育、器官特定功能或者疾病相关的蛋白上有过多的糖基化修饰位点。 该研究的发现,是蛋白质组学中的一个重大进展,因为研究结果有助于人们理解人体内的生理生化过程。此外,对于了解疾病发生机制也有重要作用。科学家们一直在寻找细胞的蛋白质上哪些位点的修饰与疾病
。 这些位点都带有” N-!P-[S|T]-!P (!P 不是脯氨酸)“这样的特征,也有些少见的 N-X-C基序或非保守序列。综合FASP及亚细胞糖基化位点定位分析揭示,这些糖基化位点一般都朝向胞外区或朝向ER腔、高尔基体、溶酶体或者过氧化物酶体。那些与发育、器官特定功能或者疾病相关的蛋白上有过多的糖基化修饰位点。 该研究的发现,是蛋白质组学中的一个重大进展,因为研究结果有助于人们理解人体内的生理生化过程。此外,对于了解疾病发生机制也有重要作用。科学家们一直在寻找细胞的蛋白质上哪些位点
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