HEBER-seq，开启exRNA液体活检新时代！

近年，液体活检在肿瘤早筛、肿瘤用药、疗效评估和复发监测方面的取得了重要进展。在多种体液游离的胞外RNA（extracellular RNA）作为一种新型液体活检标志物，大部分源自胞外囊泡EVs，包括miRNA、lncRNA、mRNA等RNA类型，这些分子有望用于肿瘤、心脑血管疾病、感染性疾病的早期诊断和用药指导。

表观生物自主研发针对exRNA的测序技术——HEBER-seq（High Efficiency Barcoded Extracellular RNA sequencing，基于标签磁珠的exRNA测序），只需低至200 μL血浆样本，结合我司开发的深度学习算法构建诊断模型，可以深入挖掘测序所得的mRNA、longRNA中的生物标志物，开启exRNA液体活检新篇章，促进精准医学发展。

 

技术流程图

HEBER-seq与传统EVs longRNA-seq技术流程对比

 

技术应用

技术优势

1. 样本要求量低，适用样本类型丰富

2. 无需富集胞外囊泡，减少过程损失，灵敏度高

3. 自动化高通量建库，缩短一半以上时间，快捷高效

4. 充分发挥深度学习算法的优势，多靶点提高诊断性能

 

送样要求

样本类型：

1. 血浆 ≥200 μL/样本

2. 尿液 ≥5 mL/样本

3. 脑脊液 ≥500 μL/样本

4. 其他体液样本需评估

建议样本量：正常人100个VS 患者100个以上

 

分析内容

1. 去接头污染，去低质量reads 和测序质量评估

2. 参考基因组比对

3. 全基因组reads 分布图谱

4. mRNA表达差异分析

5. 差异基因KEGG、GO 分析

6. 差异lncRNA 分析

 

高级分析

1. 组织特异性分析

2. WGCNA分析/GSEA分析

3. 建立疾病诊断/预后评估模型

4. IPA通路分析

 

分析内容示例

图1. 血浆样本exRNA 在gene body上的reads分布图

 

图2. GSEA分析

 

图3. 脑脊液样本exRNA的KEGG分析

 

图4. Coeff模型分析

 

图5. ROC分析 training数据集

 

图6. GSEA分析