转录组测序（RNA-seq）

 

转录组测序（RNA sequencing）用于全面、快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本的表达集合。RNA-Seq 已经广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等领域。它为我们提供了更精细、更全面的细胞遗传信息，推动了生命科学领域的前进。

 

应用领域

 

技术服务优势

①项目质控严格

②全面的分析内容

 

部分分析结果

 

应用案例：借助RNA seq揭示增强巨噬细胞吞噬功能的新机制

先天免疫系统经过精密调节能够对外界的各种刺激快速做出反应，以维持内环境稳态。巨噬细胞是一种先天免疫细胞，在吞噬、抗原呈递和分泌细胞因子等方面发挥着重要作用。衣康酸（itaconate）是一种具有抑制细菌感染、细胞内病毒复制和巨噬细胞炎症的三羧酸循环代谢产物，在线粒体基质中由Irg1基因编码的Irg1酶催化顺乌头酸脱羧产生。然而，目前关于Irg1/itaconate轴是否参与调节巨噬细胞的吞噬作用及其潜在机制知之甚少。

为全面探索Irg1/itaconate轴对巨噬细胞功能的影响，首先在体外原代培养骨髓来源的巨噬细胞，并进行RNA-seq测序。通过GSEA分析，4-OI（衣康酸的代谢衍生物）促进吞噬作用相关的基因发生富集。作者进一步利用慢病毒在原代巨噬细胞中过表达Irg1（pSlenti-EF1-EGFP-P2A-Puro-CMV-Acod1-3×FLAG-WPRE）、提取Irg1-/-和同窝对照小鼠的原代巨噬细胞，并通过Time-lapse、Flow Cytometry和免疫荧光染色等方法，全面地证实Irg1/itaconate轴促进巨噬细胞吞噬功能的新作用，并揭示了Irg1/itaconate轴促进的吞噬功能几乎没有底物特异性。

作者在不同来源的巨噬细胞(小鼠骨髓来源的巨噬细胞、原代小胶质细胞和腹膜巨噬细胞)、不同的疾病模型(ICH和腹膜炎)中发现，Irg1/itaconate轴促进巨噬细胞的吞噬作用，并受共同的Keap1/Nrf2/CD36分子机制调控。这些发现填补了衣康酸在巨噬细胞吞噬作用的知识空白，也为开发基于巨噬细胞的细胞疗法或基于衣康酸疗法为治疗吞噬作用相关疾病提供了重要的研究基础。

图1 Irg1/itaconate轴促进巨噬细胞的吞噬功能（PMID：38324982）