cGAS-ISG15-RAGE轴重编程坏死性凋亡微环境并促进头颈癌淋巴转移

cGAS-ISG15-RAGE axis reprogram necroptotic microenvironment and promote lymphatic metastasis in head and neck cancer

作者信息Jingyuan Li, Jun Tan, Tao Wang, Shan Yu, Guangliang Guo, Kan Li, Le Yang, Bin Zeng, Xueying Mei, Siyong Gao, Xiaomei Lao, Sien Zhang, Guiqing Liao, Yujie Liang
PMID38926796
发布时间2024-06-26
DOI10.1186/s40164-024-00531-5

实验完整度

包含体外细胞模型、Dox诱导瘤内坏死性凋亡模型、患者样本分析、RNA-seq、蛋白质组学、分子 docking、功能验证和临床队列,多层级验证机制。

主要模型

SCC25/FaDu细胞系TSZ诱导坏死性凋亡模型 Dox诱导瘤内坏死性凋亡异种移植模型 HNSCC患者肿瘤组织(队列N=108)

重点核对

TSZ处理浓度及时间(24h/48h) Dox诱导条件(1μg/ml,8-12h) RAGE抑制剂FPS-ZM1浓度(10μM,1mg/kg) 坏死性凋亡抑制剂Nec-1使用条件 患者样本p-MLKL和RAGE表达评分标准

摘要

背景 肿瘤细胞在肿瘤发生过程中经常进化出对坏死性凋亡的抵抗性,以克服各种生存压力。然而,我们先前的研究表明,坏死性凋亡在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中普遍存在,并通过损伤相关分子模式(DAMPs)诱导坏死周围肿瘤细胞的迁移和侵袭,从而促进肿瘤进展和不良生存。这提示了一种替代策略,即癌症通过重编程促侵袭的坏死性凋亡微环境(NME)来应对坏死性凋亡压力。在此,我们旨在解析坏死性凋亡细胞如何塑造NME并影响HNSCC进展。 方法 我们使用先前建立的细胞坏死性凋亡模型和新建立的Dox诱导的瘤内坏死性凋亡模型来研究坏死性凋亡如何影响HNSCC进展。通过RNA-seq分析坏死周围肿瘤细胞的转录组变化,并在小鼠和患者样本的NME中进行验证。通过无标记蛋白质组学技术分析凋亡、坏死和坏死性凋亡之间DAMPs组成的差异,然后鉴定并验证坏死性凋亡特异性DAMPs。使用分子对接模拟ISG15的潜在受体,并通过体外实验进一步验证。然后通过敲低坏死性凋亡ISG15的释放和RAGE抑制剂FPS-ZM1阻断ISG15-RAGE轴,并测试对肿瘤进展的影响。最后,我们在HNSCC患者队列中进一步验证了我们的发现。 结果 坏死性凋亡通过释放肿瘤类型依赖的DAMPs,在驱动肿瘤细胞侵袭和淋巴转移中发挥关键作用。机制上,坏死性凋亡DAMPs通过NF-κB和STAT3信号传导诱导坏死周围EMT。此外,坏死性凋亡与cGAS-STING信号的内在协调导致产生一组干扰素刺激基因(ISGs)作为HNSCC依赖的坏死性凋亡DAMPs。其中,ISG15在重编程NME中发挥重要作用。我们随后确定RAGE是细胞外ISG15的新受体。阻断ISG15的释放或ISG15-RAGE相互作用均显著阻碍了坏死性凋亡驱动的EMT和HNSCC的淋巴转移。最后,临床病理分析显示NME中ISG15高表达。广泛坏死性凋亡和肿瘤细胞RAGE高表达与HNSCC患者的肿瘤进展和不良生存相关。 结论 我们的数据揭示了先前未知的cGAS-ISG15-RAGE依赖的坏死性凋亡微环境重编程,该重编程将坏死性凋亡压力转化为侵袭力,促进HNSCC细胞播散。通过证明坏死性凋亡-cGAS协调产生ISG15的程序性及其通过RAGE的下游信号传导,我们阐明了ISG15在HNSCC进展中的独特作用。靶向这些机制可能具有恢复瘤内生存压力和预防HNSCC淋巴转移的治疗潜力。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
坏死性凋亡如何通过塑造微环境影响HNSCC进展?
核心机制
坏死性凋亡细胞通过释放mtDNA激活cGAS-STING,诱导ISG15等ISGs产生并释放,ISG15通过受体RAGE激活NF-κB和STAT3信号,重编程微环境促进EMT和淋巴转移。
主要证据
Dox诱导瘤内坏死性凋亡模型、RNA-seq、蛋白质组学、分子对接、siRNA/shRNA敲低、RAGE抑制剂、临床样本分析。
研究意义
靶向cGAS-ISG15-RAGE轴可能恢复瘤内生存压力,预防HNSCC淋巴转移。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

体外坏死性凋亡模型验证

验证TSZ诱导HNSCC细胞坏死性凋亡并确认DAMPs促进迁移侵袭。

使用TSZ处理SCC25和FaDu细胞,检测细胞死亡、磷酸化RIP1/MLKL,收集DAMPs处理细胞进行Transwell实验。

2

Dox诱导瘤内坏死性凋亡模型

在体内验证坏死性凋亡对淋巴转移的影响。

构建Dox诱导MLKL磷酸化突变的细胞系,接种裸鼠,Dox饮水诱导瘤内坏死性凋亡,观察淋巴转移。

3

转录组及蛋白质组学分析

分析坏死性凋亡DAMPs对细胞信号通路的影响及DAMPs组成。

对TSZ处理的SCC25细胞进行RNA-seq,对凋亡、坏死和坏死性凋亡DAMPs进行无标记蛋白质组学,并进行富集分析。

4

ISG15释放机制验证

证明坏死性凋亡通过mtDNA-cGAS-STING轴程序性释放ISG15。

检测坏死性凋亡时细胞质mtDNA释放、cGAS-STING激活、ISG15表达和释放,并用siRNA、抑制剂、EB耗竭mtDNA验证。

5

ISG15受体鉴定及功能验证

确定ISG15的受体并验证其介导的细胞功能。

通过分子对接预测RAGE为ISG15受体,用Co-IP、pull-down验证结合,用重组ISG15处理细胞检测信号通路和侵袭。

6

体内及临床验证

验证ISG15-RAGE轴在体内和临床样本中的作用。

使用Dox诱导模型结合ISG15敲低或RAGE抑制,观察淋巴转移;在HNSCC患者样本中分析p-MLKL、ISG15、RAGE表达及相关性。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
DMEM/F12培养基Gibco--
MEM培养基Gibco--
RPMI 1640培养基Gibco--
McCoy's 5a培养基----
L-15培养基----
胎牛血清Gibco--
氢化可的松Solaria--
胰岛素----
谷胱甘肽----
肿瘤坏死因子-αPeproTech--
Smac模拟物AT-406Selleck--
泛caspase抑制剂zVAD-fmkSelleck--
坏死性凋亡抑制剂Nec-1Selleck--
RIP3抑制剂GSK'872Selleck--
MLKL抑制剂坏死磺酰胺Selleck--
cGAS抑制剂G150Selleck--
STING抑制剂C-170Selleck--
NF-κB抑制剂BAY 11-7082MCEHY-13453
STAT3抑制剂StatticMCEHY-13818
RAGE抑制剂FPS-ZM1MCEHY-19370
His6标记ISG15重组蛋白R&D SystemUL-510
GST标记ISG15重组蛋白R&D SystemUL-600
人重组ISG15R&D SystemUL-601
人重组HMGB1Sino Biological--
RIPA裂解液Beyotime--
超滤离心管Millipore--
BCA蛋白定量试剂盒CWBIO--
PVDF膜Millipore--
Immobilon ECL超敏化学发光底物Millipore--
GeneGnome XRQ凝胶成像系统Syngene--
GAPDH抗体CWBIOCW0100M
p65抗体Cell Signaling Technology8242
磷酸化p65抗体Cell Signaling Technology3033
STAT3抗体Cell Signaling Technology9139
磷酸化STAT3抗体Cell Signaling Technology9145
磷酸化STAT5抗体Cell Signaling Technology9351
MMP-9抗体Cell Signaling Technology13667
E-钙粘蛋白抗体Cell Signaling Technology3195
N-钙粘蛋白抗体Cell Signaling Technology13116
波形蛋白抗体Cell Signaling Technology5741
ISG15抗体Cell Signaling Technology2758
IFIT1抗体Cell Signaling Technology1469
cGAS抗体Cell Signaling Technology83623
STING抗体Cell Signaling Technology13647
IRF3抗体Cell Signaling Technology11904
磷酸化STING抗体Cell Signaling Technology50907
磷酸化TBK1抗体Cell Signaling Technology5483
磷酸化IRF3抗体Cell Signaling Technology37829
磷酸化H2AX抗体Cell Signaling Technology9718
TLR2抗体Cell Signaling Technology12276
MLKL抗体Abcamab184718
磷酸化MLKL抗体Abcamab187091
IL-6抗体Abcamab233706
ISG15抗体Abcamab285367
CD11a抗体Abcamab52895
HMGB1抗体Abcamab79823
IFIT2抗体Santa Cruzsc-390724
IFIT3抗体Santa Cruzsc-393512
RAGE抗体Santa Cruzsc-365154
GST抗体Proteintech66001-2-Ig
His抗体Proteintech66005-1-Ig
基质胶BD Biosciences--
聚碳酸酯膜----
碘化丙啶BD Biosciences--
CytoFlex流式细胞仪Beckman Coulter--
RNAzol试剂Molecular Research Center--
NanoDrop2000分光光度计----
HiScript III逆转录预混液Vazyme--
ChamQ SYBR qPCR预混液Vazyme--
DAPI染色液----
抗荧光淬灭封片剂Beyotime--
LSM980激光扫描共聚焦显微镜ZEISS--
PE Operetta CLS高内涵成像系统PerkinElmer--
Trizol试剂Invitrogen--
SDT裂解缓冲液----
BCA蛋白定量试剂盒Bio-Rad--
胰蛋白酶Promega--
Q Exactive质谱仪Thermo Scientific--
Easy nLC液相色谱Proxeon Biosystems--
C18固相萃取柱Sigma--
Lipofectamine3000转染试剂----
RAGE siRNASanta Cruzsc-36374
阴性对照siRNASanta Cruzsc-37007
Protein A/G磁珠MCE--
EZ-Link Sulfo-NHS-SS-生物素Thermo Fisher Scientific--
His标签磁珠MCEHY-K0209
链霉亲和素磁珠MCEHY-K0208
培养细胞线粒体分离试剂盒Thermo Fisher Scientific--
Quick-gDNA DNA提取试剂盒Zymo Research--
PicoGreen荧光染料Lumiprobe--
MitoTracker红色线粒体染料Thermo Fisher Scientific--
Hoechst 33342荧光染料----
BALB/c裸鼠----
IVIS活体成像系统PerkinElmer--
Rosetta2020软件----
Pymol软件----
Ligplot软件----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
细胞培养
细胞系来源、培养基成分、FBS浓度、添加剂(如氢化可的松)
阅读提示:Methods - Cell culture and reagents
细胞死亡诱导
TSZ处理浓度、时间、顺序;Nec-1浓度;冻融循环次数
阅读提示:Methods - Induction of cell death
DAMPs收集
处理时间、换液时间、离心条件、是否浓缩
阅读提示:Methods - Collection of DAMPs
Transwell实验
细胞数、Matrigel稀释比例、迁移时间、染色方法
阅读提示:Methods - Transwell migration and invasion assay
体内坏死性凋亡模型
细胞混合比例、接种细胞量、Dox浓度、给药方式、FPS-ZM1剂量和给药频率
阅读提示:Methods - In vivo assay
蛋白质组学
样品制备、酶解条件、LC-MS/MS参数、MaxQuant参数
阅读提示:Methods - Label-free proteomic analysis
临床样本分析
患者纳入标准、随访时间、IHC评分标准
阅读提示:Methods - Patients' cohort and tissue samples