IL-13Rα2单表达对GBM细胞增殖与侵袭的影响
确定IL-13Rα2单独是否影响GBM细胞增殖、迁移和侵袭。
构建Gli36.IL-13Rα2细胞,进行增殖、细胞周期、软琼脂集落形成、迁移和侵袭实验,并检测MMP-2和vimentin表达;同时进行颅内移植观察侵袭表型。
Interleukin-13 receptor alpha 2 cooperates with EGFRvIII signaling to promote glioblastoma multiforme.
含体外细胞模型、原代GBM样本、小鼠颅内/皮下移植瘤模型及组学数据分析,并进行了功能与机制验证。
人胶质瘤细胞系Gli36及其IL-13Rα2/EGFRvIII等基因工程衍生株 人胶质瘤细胞系U87MG、U251MG及U251-E6/E18四环素诱导株 Mayo Clinic原代GBM异种移植细胞系及患者来源原代GBM细胞 NOD/SCID和Balb-C nu/nu小鼠颅内/皮下移植瘤模型
Gli36等基因工程细胞中IL-13Rα2和/或EGFRvIII的表达验证及增殖、迁移、侵袭表型 IL-13Rα2敲低(siRNA终浓度3–10 nM)对U87MG、U251MG及原代GBM细胞增殖和迁移的影响 AG1478(10 μM)处理对EGFRvIII阳性及IL-13Rα2/EGFRvIII共表达细胞增殖抑制的差异 IL-13Rα2胞质尾缺失突变体与EGFRvIII的共免疫沉淀和PLA相互作用验证 颅内移植Gli36.IL-13Rα2/EGFRvIII与Gli36.EGFRvIII细胞的小鼠生存期比较
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定IL-13Rα2单独是否影响GBM细胞增殖、迁移和侵袭。
构建Gli36.IL-13Rα2细胞,进行增殖、细胞周期、软琼脂集落形成、迁移和侵袭实验,并检测MMP-2和vimentin表达;同时进行颅内移植观察侵袭表型。
验证内源性IL-13Rα2在GBM细胞迁移和增殖中的作用。
在U87MG和U251MG细胞中用siRNA敲低IL-13Rα2,检测迁移、侵袭和增殖,并检测IL-13和CHI3L1/YKL40刺激后的迁移。
确定EGFRvIII存在时IL-13Rα2是否促进增殖。
构建Gli36.IL-13Rα2/EGFRvIII细胞,检测增殖、细胞周期、软琼脂集落形成和迁移;在U87MG.EGFRvIII及原代GBM细胞中敲低IL-13Rα2检测增殖;进行颅内移植比较生存期。
阐明IL-13Rα2增强增殖的信号机制。
用抗磷酸酪氨酸抗体检测总酪氨酸磷酸化;用AG1478处理检测增殖和MEK/ERK;用Raf-1 RBD pull-down和ELISA检测Ras激活;免疫印迹检测c-RAF、MEK、ERK、STAT3、PI3K/AKT通路。
验证IL-13Rα2与EGFRvIII直接结合及关键结构域。
共免疫沉淀检测IL-13Rα2与EGFRvIII结合及Grb2招募;构建IL-13Rα2胞质尾缺失突变体和EGFRvIII DK/DY3突变体,进行增殖、共免疫沉淀和PLA实验。
验证IL-13Rα2的促增殖作用是否特异于EGFRvIII而非野生型EGFR。
使用四环素诱导的U251-E6(wtEGFR)和U251-E18(EGFRvIII)细胞,检测增殖、信号通路和共免疫沉淀;在颅内和皮下移植模型中比较肿瘤生长和生存期。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen Life Technologies | -- | |
| L-谷氨酰胺 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 遗传霉素 | Sigma | -- | |
| 嘌呤霉素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 杀稻瘟菌素 | -- | -- | |
| Zeocin | -- | -- | |
| 四环素 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8实验试剂盒 | Dojindo Laboratories | -- |
| Alamar Blue | Biosource International | -- | |
| 药物处理 | AG1478 | Sigma-Aldrich | -- |
| 迁移和侵袭实验 | Matrigel侵袭小室 | BD Biosciences | -- |
| Transwell迁移小室 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞因子刺激 | YKL-40/CHI3L1 | R&D Systems | -- |
| 白细胞介素-13 | Peprotech | -- | |
| 免疫印迹 | 抗IL-13Rα2抗体 | R&D Systems | AF146 |
| 抗EGFR克隆12抗体 | Thermo Scientific/NeoMarker | MS-400-P | |
| 抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 4267 | |
| 抗MMP2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-10736 | |
| 抗波形蛋白抗体 | Epitomics | 2862-1 | |
| 抗Grb2抗体 | BD Transduction Lab | G16720 | |
| 抗磷酸酪氨酸抗体(克隆4G10) | Upstate/Millipore | 05-321 | |
| 抗磷酸酪氨酸抗体(p-Tyr-102) | Cell Signaling Technology | 9416 | |
| 抗泛Ras抗体 | Calbiochem | OP-40 | |
| 抗C-Raf抗体 | BD Transduction Lab | R19120 | |
| 抗磷酸化C-Raf(Ser338)抗体 | Cell Signaling Technology | 9427 | |
| 抗MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9122 | |
| 抗磷酸化MEK1/2(Ser217/221)抗体 | Cell Signaling Technology | 9121 | |
| 抗p42/44 MAPK(ERK1/2)抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗磷酸化p42/44 MAPK(ERK1/2)(Thr-202/Tyr-204)抗体 | Cell Signaling Technology | 9101 | |
| 抗PTEN抗体 | Cell Signaling Technology | 9559 | |
| 抗PI3K p85α抗体 | Cell Signaling Technology | 4292 | |
| 抗磷酸化PI3K p85α(Y458)抗体 | Cell Signaling Technology | 4228 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 抗磷酸化AKT(Ser-473)抗体 | Cell Signaling Technology | 9271 | |
| 抗STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| 抗磷酸化STAT3(Ser-727)抗体 | Cell Signaling Technology | 9136 | |
| 抗磷酸化STAT3(Tyr705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9131 | |
| 抗TGFβ抗体 | Cell Signaling Technology | 3711 | |
| 抗Hsp70抗体 | System Biosciences | H53220 | |
| 抗泛肌动蛋白抗体 | Thermo Scientific/Neomarker | MS-1295-P | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | BD Biosciences | 556321 | |
| 抗微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-5286 | |
| 免疫组织化学 | IL-13Rα2抗体 | R&D Systems | AF146 |
| EGFR抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-13343 | |
| 免疫荧光 | AlexaFluor 594二抗 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| AlexaFluor 488二抗 | Invitrogen Life Technologies | -- | |
| 邻近连接实验 | Duolink原位PLA红色试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- |
| Ras激活实验 | Raf-1 RBD琼脂糖珠 | Cell Biolabs | STA-400 |
| Ras激活ELISA试剂盒 | Cell Biolabs | STA-440 | |
| RNA提取与qRT-PCR | TRIzol试剂 | QIAGEN | -- |
| RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| QuantiTect SYBR Green PCR试剂盒 | QIAGEN | -- | |
| CFX96 Touch实时PCR仪 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| 转染 | Lipofectamine转染试剂 | Invitrogen Life Technologies | -- |
| Lipofectamine RNAiMax转染试剂 | Invitrogen Life Technologies | -- | |
| jetPRIME转染试剂 | Polyplus Transfection | -- | |
| 细胞培养 | 星形胶质细胞生长培养基 | Lonza Bioscience | -- |
| ABM培养基 | Lonza | -- | |
| G418 | Life Technologies | -- | |
| 细胞周期分析 | RNase A | Sigma-Aldrich | -- |
| 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞增殖与迁移/侵袭实验 | IL-13Rα2 siRNA终浓度3–10 nM(依细胞类型而定);IL-13刺激20 ng/ml,YKL40刺激1 μg/ml,处理18 h 阅读提示:Methods中Gene silencing, migration, and invasion assays小节及Fig. 2c图注 |
| AG1478抑制实验 | AG1478浓度10 μM,处理24 h,血清饥饿条件 阅读提示:Methods中Cell proliferation assays小节及Fig. 4b图注 |
| 四环素诱导EGFRvIII/wtEGFR实验 | 四环素浓度1 μg/ml;U251-E6和U251-E18细胞维持于5 μg/ml Blasticidin和250 μg/ml Zeocin 阅读提示:Methods中Cell culture小节及Fig. 6a、6c图注 |
| 皮下移植瘤实验 | NOD/SCID小鼠6–8周龄雌性;U251-E6和U251-E18细胞5×10^6/只,n=4/组;doxycycline 0.2 mg/ml饮水预处理一周 阅读提示:Methods中Subcutaneous mouse xenograft小节 |
| 颅内移植瘤实验 | U251MG衍生细胞2×10^6/只;Gli36.IL-13Rα2细胞2×10^5/只;注射位点右侧纹状体 阅读提示:Methods中Intracranial U251-E6 and E18 mouse xenograft及Intracranial glioma mouse xenograft小节 |