建立GSK3β缺失或敲低细胞模型
验证GSK3β在TLR3介导的细胞因子产生中的作用。
构建GSK3β shRNA稳定转染的RAW264.7细胞,使用Gsk3b-/- MEFs及GSK3β siRNA转染的BMDMs。
Glycogen synthase kinase 3β ubiquitination by TRAF6 regulates TLR3-mediated pro-inflammatory cytokine production.
采用RAW264.7、BMDM、MEF及Traf6-/-细胞等多模型,结合敲低/过表达、抑制剂、免疫共沉淀、体内外泛素化及位点突变等功能与机制验证。
RAW264.7巨噬细胞系(对照或GSK3β shRNA稳定转染) 小鼠原代骨髓来源巨噬细胞(BMDM) Gsk3b+/+与Gsk3b-/-小鼠胚胎成纤维细胞(MEF) Traf6+/+与Traf6-/- 3T3细胞
poly I:C刺激浓度10 μg/ml及处理时间(1 h、20 h或图中标注) SB216763使用浓度10 μM,预处理1 h MEFs中回补GSK3β WT、GSK3α或GSK3β K85A/K183R突变体 GSK3β K183R突变对TRAF6介导泛素化的抵抗及对细胞因子产生的影响 TRAF6(C70A)催化失活突变体对GSK3β泛素化的作用
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证GSK3β在TLR3介导的细胞因子产生中的作用。
构建GSK3β shRNA稳定转染的RAW264.7细胞,使用Gsk3b-/- MEFs及GSK3β siRNA转染的BMDMs。
明确GSK3β对TLR3下游细胞因子及MAPK/NF-κB通路的影响。
poly I:C刺激后,用real-time PCR、ELISA和western blot检测细胞因子mRNA/蛋白及ERK、p38、JNK、NF-κB p65磷酸化。
探究GSK3β调控TLR3信号的分子机制。
免疫共沉淀检测GSK3β与TRAF6、TAK1、TRIF等的结合;TLR3免疫沉淀检测信号复合体组装;GST pull-down和质粒转染验证三元复合体。
验证TRAF6为GSK3β的E3连接酶并鉴定泛素化位点。
体内外泛素化实验、突变体(K85R、K86R、K91R、K183R)分析、质谱鉴定修饰位点。
明确K183泛素化在TLR3信号中的功能重要性。
回补GSK3β WT或K183R突变体至Gsk3b-/- MEFs或HEK293-TLR3细胞,检测细胞因子mRNA、c-Fos及复合体组装。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素 | Hyclone | -- | |
| 链霉素 | Hyclone | -- | |
| 重组人巨噬细胞集落刺激因子 | R&D Systems | -- | |
| 嘌呤霉素 | Sigma | -- | |
| 质粒转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| siRNA转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 药物处理 | 聚肌胞苷酸 | Sigma | -- |
| SB216763 | Sigma | -- | |
| BAY 11-7085 | Sigma | -- | |
| PD98059 | Sigma | -- | |
| SB203580 | Sigma | -- | |
| Western blot | 磷酸化GSK3α/β (S21/S9)抗体 | Cell Signaling Technology | 9331 |
| 磷酸化ERK (T202/Y204)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 磷酸化JNK (T183/185)抗体 | Cell Signaling Technology | 9251 | |
| 磷酸化p38 (T180/Y182)抗体 | Cell Signaling Technology | 9215 | |
| 磷酸化p65 (S536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3031 | |
| GSK3β抗体 | Cell Signaling Technology | 9315 | |
| TAK1抗体 | Cell Signaling Technology | 4505 | |
| ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| JNK抗体 | Cell Signaling Technology | 9258 | |
| p38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690 | |
| p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| ATF2抗体 | Cell Signaling Technology | 9226 | |
| c-Jun抗体 | Cell Signaling Technology | 9165 | |
| TRAF6抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7221 | |
| c-Fos抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7202 | |
| HA抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7392 | |
| Myc抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-40 | |
| GST抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-138 | |
| TBP抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-204 | |
| 泛素抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-8017 | |
| β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-87778 | |
| α-微管蛋白抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-58666 | |
| GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-87724 | |
| GSK3α/β抗体 | Invitrogen | 44-610 | |
| RIP1抗体 | BD Pharmingen | 610459 | |
| Flag抗体 | Sigma | F3156 | |
| 辣根过氧化物酶标记二抗 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A琼脂糖 | Millipore | -- |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| ELISA | 小鼠IL-6、TNF-α和IL-10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- |
| RNA提取与逆转录 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | Superscript cDNA合成试剂盒 | Invitrogen | -- |
| 实时PCR | KAPA SYBR green FAST qPCR试剂盒 | Kapa Biosystems | -- |
| ABI 7300实时PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 体外泛素化 | GSK3β蛋白 | Invitrogen | PV3365 |
| 泛素化试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- | |
| 体外泛素化检测 | 辣根过氧化物酶标记链霉亲和素 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| GST pull-down | 谷胱甘肽-琼脂糖4B | GE Healthcare | -- |
| 荧光素酶实验 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 免疫沉淀 | 抗HA琼脂糖 | Thermo scientific | -- |
| 细胞转染 | Microporator MP-100电转仪 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| GSK3β敲低/缺失模型 | RAW264.7稳定转染GSK3β shRNA序列(5′-CATGAAAGTTAGCAGAGATAA-3′),筛选使用4 μg/ml嘌呤霉素2周;BMDMs转染GSK3β siRNA(5′-ACACGAAAGTGATTGGAAATT-3′)20 nM 36 h 阅读提示:Methods: Cell culture and transfection;Figure 1a;Supplementary Fig. 3 |
| poly I:C刺激与细胞因子检测 | poly I:C浓度10 μg/ml;mRNA检测刺激1 h,蛋白检测刺激20 h;real-time PCR以β-actin归一化;ELISA检测培养上清 阅读提示:Figure 1a,d;Methods: Real-time PCR analysis, Enzyme-linked immunosorbent assay |
| 抑制剂处理 | SB216763 10 μM预处理1 h;PD98059 10 μM、SB203580 10 μM、SP600125 25 μM、BAY 11-7085 10 μM均预处理1 h 阅读提示:Figure 1d;Figure 3e-h;Methods: Reagents and antibodies |
| 信号复合体免疫共沉淀 | poly I:C刺激10 min;使用抗TLR3抗体进行免疫沉淀;检测TRIF、RIP1、TRAF6、TAK1、TAB1、TAB2、GSK3β 阅读提示:Figure 4;Methods: Immunoprecipitation and western blot analysis |
| 泛素化位点与功能验证 | GSK3β K183R突变体;TRAF6 C70A突变体;体外泛素化体系含5 nM Flag-TRAF6、1 μM GSK3β、100 nM His-E1、1 μM His-E2、2.5 μM Bt-Ub 阅读提示:Figure 6c,f;Methods: In vitro ubiquitination assay;Supplementary Table 1 |