建立脓毒症模型并评估TMEM173对凝血和生存的影响
验证TMEM173在脓毒症凝血激活和致死中的作用
使用CLP、大肠杆菌或肺炎链球菌感染小鼠模型,比较WT、Tmem173−/−、cGAS−/−、Tmem173Mye−/−、Tmem173T−/−等小鼠的生存率、DIC指标(血小板、纤维蛋白原、PT、APTT、D-二聚体)、组织纤维蛋白沉积、血浆F3及组织损伤标志物。
TMEM173 Drives Lethal Coagulation in Sepsis.
包含体外细胞模型、多种基因敲除小鼠模型、三种脓毒症模型及患者样本,并进行了功能验证和机制验证。
THP1细胞系及基因敲除/突变THP1细胞 原代小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDM) 原代人外周血单核细胞来源巨噬细胞(HPBM) 脓毒症小鼠模型(CLP、大肠杆菌或肺炎链球菌感染) 细菌脓毒症患者PBMC和血浆样本
小鼠模型:Tmem173−/−、Tmem173Mye−/−、Tmem173T−/−、cGAS−/−、Ifnar1−/−、Irf3−/−、GsdmdI105N/I105N等,每组生存分析n=10,其他检测n=5 细菌感染:大肠杆菌(Serovar O1:K1:H7)或肺炎链球菌(CIP 104225)以25 MOI感染细胞24小时;小鼠腹腔注射1×10^9 CFU 药物处理:TUDCA(200 mg/kg)、2-APB(20 mg/kg)、U73122(30 mg/kg)、抗F3抗体(10 mg/kg)等在CLP后2、24、48、72小时腹腔注射 CLP模型:8-10周龄C57BL/6J小鼠,22-26 g,雌雄各半,盲肠结扎后22G针穿刺一次,皮下注射1 mL林格液 患者样本:40例细菌脓毒症患者,根据ISTH评分分为DIC组(n=24)和非DIC组(n=16)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证TMEM173在脓毒症凝血激活和致死中的作用
使用CLP、大肠杆菌或肺炎链球菌感染小鼠模型,比较WT、Tmem173−/−、cGAS−/−、Tmem173Mye−/−、Tmem173T−/−等小鼠的生存率、DIC指标(血小板、纤维蛋白原、PT、APTT、D-二聚体)、组织纤维蛋白沉积、血浆F3及组织损伤标志物。
确定I型干扰素通路是否参与TMEM173介导的凝血
比较Ifnar1−/−和Irf3−/−小鼠与WT小鼠在CLP后的生存和DIC指标;检测IFNα/IFNβ或细菌感染对单核/巨噬细胞F3释放的影响;敲除或敲低Tmem173、Tbk1、Irf3后检测IFNβ和F3释放。
明确TMEM173是否通过内质网应激和钙信号促进F3释放
检测细菌感染后内质网应激标志物mRNA表达;使用内质网应激抑制剂TUDCA或4PBA;检测胞质钙水平;使用钙螯合剂BAPTA-AM、ITPR1敲低或抑制剂2-APB;免疫共沉淀检测TMEM173与ITPR1相互作用;使用thapsigargin和tunicamycin诱导内质网应激。
确定内质网钙泵ATP2A2在TMEM173介导的F3释放中的作用
敲低Atp2a1、Atp2a2、Atp2a3、Zdhhc1、Stim1,检测胞质钙、F3和IFNβ释放;在TMEM173-V155M和N154S突变细胞中过表达Atp2a2或敲低Tmem173,检测F3和IFNβ释放。
确定GSDMD活化是否为TMEM173-钙信号下游触发F3释放的关键环节
检测细菌感染后GSDMD-N生成;使用CASP8抑制剂Z-IETD-FMK、Casp1−/−Casp11−/−细胞;转染GSDMD突变体(GSDMD-N、GSDMD-C、D275A);使用PLCG1抑制剂U73122;在GsdmdI105N/I105N小鼠和抗F3抗体处理小鼠中评估生存和凝血指标。
评估TMEM173-GSDMD通路在临床脓毒症中的相关性
检测40例细菌脓毒症患者PBMC中TMEM173和GSDMD mRNA及蛋白水平,分析其与SOFA评分、DIC评分、炎症因子及死亡率的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| Western blot | 抗GSDMD-N抗体 | Cell Signaling Technology | 36425 |
| 抗GSDMD抗体 | Cell Signaling Technology | 96458 | |
| 抗TMEM173抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗磷酸化TMEM173抗体 | Cell Signaling Technology | 19781 | |
| Immunoprecipitation | 抗ITPR1抗体 | Abcam | ab5804 |
| Western blot | 抗ACTB抗体 | Cell Signaling Technology | 3700 |
| 抗γ-H2AX抗体 | Cell Signaling Technology | 9718 | |
| 抗切割CASP1抗体 | Cell Signaling Technology | 4199 | |
| 抗CASP1抗体 | Cell Signaling Technology | 2225 | |
| 抗CASP11抗体 | Cell Signaling Technology | 14340 | |
| 抗切割CASP8抗体 | Cell Signaling Technology | 9496 | |
| 抗CASP8抗体 | Cell Signaling Technology | 9746 | |
| Animal treatment | 抗F3抗体(单克隆大鼠IgG2c;克隆#355220) | R&D systems | MAB3178 |
| Western blot | HRP标记抗小鼠IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 |
| HRP标记抗兔IgG二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| Cell treatment | 牛磺熊去氧胆酸 | Sigma-Aldrich | 580549 |
| 2-氨基乙氧基二苯硼酸 | Sigma-Aldrich | 100065 | |
| 4-苯基丁酸 | Santa Cruz Biotechnology | 1821-12-1 | |
| Animal treatment | 亚胺培南西司他丁 | Merck | 0006-3514-58 |
| Cell treatment | U73122 | Sigma-Aldrich | 662035 |
| BAPTA-AM | Sigma-Aldrich | 196419 | |
| Z-IETD-FMK | Selleck Chemicals | S7314 | |
| 毒胡萝卜素 | Sigma-Aldrich | T9033 | |
| 衣霉素 | Sigma-Aldrich | T7765 | |
| Cell lysis | 细胞裂解液(10X) | Cell Signaling Technology | 9803 |
| Western blot | SDS上样缓冲液(2X) | Thermo Fisher Scientific | LC2676 |
| SuperSignal West Pico化学发光底物 | Thermo Fisher Scientific | 34580 | |
| SuperSignal West Femto最高灵敏度底物 | Thermo Fisher Scientific | 34095 | |
| Immunoprecipitation | RIPA裂解液 | Cell Signaling Technology | 9806 |
| Cell lysis | 磷酸酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | P0044 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Promega | G6521 | |
| Bacterial culture | 营养琼脂 | Becton Dickinson | 213000 |
| 脑心浸液琼脂 | Becton Dickinson | 211065 | |
| Cell culture | 杜尔贝科改良 Eagle 培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11995073 |
| RPMI 1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | 11875119 | |
| 胎牛血清 | Millipore | TMS-013-B | |
| 1%青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15070-063 | |
| RT-qPCR | SsoFast EvaGreen预混液 | Bio-Rad | 172-5204 |
| Western blot | TBST缓冲液 | Cell Signaling Technology | 9997 |
| 5%脱脂奶粉 | Cell Signaling Technology | 9999 | |
| Immunoprecipitation | Protein A琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 9863 |
| ELISA | 人IFNβ ELISA试剂盒 | R&D systems | DIFNB0 |
| 小鼠IFNβ ELISA试剂盒 | R&D systems | 42400-1 | |
| 人F3 ELISA试剂盒 | R&D systems | DCF300 | |
| 小鼠F3 ELISA试剂盒 | Abcam | ab214091 | |
| 人纤维蛋白ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS265263 | |
| 小鼠纤维蛋白ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS706338 | |
| 人D-二聚体ELISA试剂盒 | Abcam | ab196269 | |
| 小鼠D-二聚体ELISA试剂盒 | MyBioSource | MBS723281 | |
| 人TNF ELISA试剂盒 | R&D Systems | DTA00D | |
| 人IL1A ELISA试剂盒 | R&D Systems | DLA50 | |
| 人IL1B ELISA试剂盒 | R&D Systems | DLB50 | |
| 人IL6 ELISA试剂盒 | R&D Systems | D6050 | |
| 人HMGB1 ELISA试剂盒 | IBL International | ST51011 | |
| RT-qPCR | iScript cDNA合成试剂盒 | Bio-Rad | 1708890 |
| Protein quantification | BCA蛋白定量试剂盒 | Cell Signaling Technology | 7780 |
| RNA extraction | RNeasy Plus试剂盒 | QIAGEN | 74134 |
| Calcium measurement | Fura-2钙流检测试剂盒 | Abcam | ab176766 |
| Monocyte isolation | EasySep小鼠单核细胞分离试剂盒 | STEMCELL Technologies | 19861 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠脓毒症模型(CLP) | 小鼠品系、年龄、体重、性别比例;CLP手术细节(结扎位置、穿刺针规格、复苏液);药物剂量和给药时间 阅读提示:Methods“Animal Model of Sepsis”小节及图1、图6图注 |
| 细菌感染细胞模型 | 细菌菌株和MOI(25 MOI);感染时间(24小时);细胞类型和培养条件 阅读提示:Methods“Bacterial Strains and Culturing Conditions”及“Cell Culture”小节;图2、图3图注 |
| GSDMD切割和F3释放检测 | Western blot抗体稀释比例(1:1000);ELISA试剂盒;细胞处理条件(抑制剂浓度、处理时间) 阅读提示:Methods“Western Blot Analysis”和“Biochemical and Coagulation Assay”小节;图5图注 |
| 患者样本分析 | 患者纳入和排除标准;DIC评分标准;样本采集时间;PBMC分离和检测方法 阅读提示:Methods“Patient Samples”小节;图7图注和表S1 |
| 钙流检测 | Fura-2检测试剂盒;细胞刺激条件;荧光比值计算方式 阅读提示:Methods“Measurement of Intracellular Calcium”小节;图3、图4图注 |