构建肝细胞特异性基因敲除小鼠并建立MASH模型
验证肝细胞SIRT3、DsbA-L和cGAS在MASH中的作用。
将SIRT3 fl/fl、DsbA-L fl/fl、cGAS fl/fl与Alb-Cre小鼠杂交获得肝细胞特异性敲除小鼠,给予CDAHFD、MCD或GAN饮食诱导MASH。
The SIRT3-DsbA-L-TFAM axis restrains cGAS-driven metabolic dysfunction-associated steatohepatitis in male mice.
包含肝细胞特异性敲除/敲入小鼠、多种饮食MASH模型、原代肝细胞及AAV过表达,并有蛋白互作与突变功能验证
肝细胞特异性SIRT3敲除(SIRT3LKO)雄性小鼠 肝细胞特异性DsbA-L敲除(DsbA-LLKO)雄性小鼠 肝细胞特异性cGAS敲除(cGASLKO)及SIRT3/cGAS双敲除雄性小鼠 原代小鼠肝细胞及HepIR细胞系
SIRT3LKO、DsbA-LLKO和cGASLKO小鼠分别给予CDAHFD 8周、MCD 8周或GAN 28周饮食 AAV经尾静脉注射3×10^11 vg/mouse,随后CDAHFD喂养12周 原代肝细胞用0.2 mM PA和0.4 mM OA处理24 h,或用ABT-737 10 μM处理16–24 h DsbA-L乙酰化位点Lys165、Lys167、Lys177突变为精氨酸(K3R)或谷氨酰胺(K3Q) cGAS抑制剂RU.521(5 μM)或STING抑制剂C176(5 μM)预处理2 h
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证肝细胞SIRT3、DsbA-L和cGAS在MASH中的作用。
将SIRT3 fl/fl、DsbA-L fl/fl、cGAS fl/fl与Alb-Cre小鼠杂交获得肝细胞特异性敲除小鼠,给予CDAHFD、MCD或GAN饮食诱导MASH。
确定SIRT3或DsbA-L缺失对MASH病理特征的影响。
通过H&E、Oil Red O、Sirius red染色、血清ALT检测、MAS评分及炎症和纤维化基因/蛋白表达分析。
验证SIRT3或DsbA-L缺失是否通过mtDNA释放激活cGAS-STING。
在肝组织或原代肝细胞中检测cGAS、STING、p-TBK1、p-IRF3表达,并通过细胞分级和RT-qPCR定量胞质mtDNA。
明确SIRT3调控DsbA-L乙酰化的关键赖氨酸残基。
构建DsbA-L赖氨酸突变为精氨酸的突变体,检测乙酰化水平,并构建K3R和K3Q突变体。
确定DsbA-L去乙酰化是否增强TFAM与mtDNA结合。
通过Co-IP检测DsbA-L与TFAM互作,Biotin-LSP pull-down检测TFAM与LSP DNA结合,RT-qPCR检测mtDNA含量。
确定DsbA-L去乙酰化是否介导SIRT3对MASH的保护作用。
向SIRT3LKO小鼠尾静脉注射表达GFP、WT、K3R或K3Q DsbA-L的AAV,CDAHFD喂养12周后评估脂质积累、纤维化和cGAS信号。
确定cGAS激活是否介导SIRT3缺失诱导的MASH。
构建SIRT3/cGAS双敲除小鼠,CDAHFD喂养8周,检测ALT、脂质积累、纤维化、炎症基因和cGAS通路蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM Alpha培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 药物处理 | RU.521 | -- | -- |
| C176 | -- | -- | |
| ABT-737 | -- | -- | |
| 烟酰胺 | -- | -- | |
| Western blot | cGAS抗体 | CST | 31659s |
| STING抗体 | CST | 13647 | |
| p-TBK1抗体 | CST | 5483 | |
| TBK1抗体 | CST | 3013 | |
| p-IRF3抗体 | CST | 4947 | |
| IRF3抗体 | CST | 4302 | |
| TNFα抗体 | Abcam | 6671 | |
| TGFβ抗体 | Santa Cruz | 52893 | |
| αSMA抗体 | Santa Cruz | 32251 | |
| FASN抗体 | CST | 3180 | |
| ACC抗体 | CST | 3662s | |
| COL1A2抗体 | Santa Cruz | 393573 | |
| FN抗体 | Santa Cruz | 8422 | |
| p-P65抗体 | CST | 3033 | |
| P65抗体 | CST | 4767 | |
| Sirt3抗体 | CST | 5490 | |
| TFAM抗体 | Abcam | 138351 | |
| 乙酰化赖氨酸抗体 | CST | 9441s | |
| HA抗体 | CST | 3724 | |
| GAPDH抗体 | CST | 5174 | |
| Actin抗体 | Sigma | A3854 | |
| Co-IP | Sirt3抗体 | CST | 5490 |
| HA抗体 | CST | 3724 | |
| 免疫荧光 | Sirt3抗体 | Santa Cruz | sc-365175 |
| 抗8-OHdG抗体 | Bioss | bs-1278R | |
| Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Invitrogen | A-11034 | |
| Alex Fluor 568山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A-11031 | |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Roche | 11684817910 |
| 油红O染色 | 油红O | Sigma-Aldrich | O-0625 |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| Protein A/G琼脂糖珠 | GE Healthcare Life Sciences | -- | |
| BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ATP测定 | ATP测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 耗氧分析 | XF 24分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 定点突变 | Quick-Change定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | -- |
| RNAi构建 | pSIREN-RetroQ载体 | BD Biosciences | -- |
| RNA-Seq | VAHTS Universal V6 RNA-seq文库构建试剂盒 | -- | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| MASH动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、饮食类型及喂养时间(CDAHFD 8周、MCD 8周、GAN 28周) 阅读提示:Methods中Mouse studies小节 |
| AAV过表达实验 | AAV注射剂量(3×10^11 vg/mouse)、注射途径(尾静脉)、注射时年龄(8周龄)及CDAHFD喂养时间(12周) 阅读提示:Methods中Mouse studies小节 |
| 原代肝细胞处理 | PA和OA浓度(0.2 mM PA、0.4 mM OA)、处理时间(24 h)、ABT-737浓度(10 μM)及处理时间(16–24 h) 阅读提示:Fig. 1b、Fig. 2e、Fig. 2h图注及Results相关段落 |
| 抑制剂处理 | RU.521浓度(5 μM)、C176浓度(5 μM)及预处理时间(2 h) 阅读提示:Fig. 2e图注 |
| DsbA-L乙酰化位点突变 | 突变位点Lys165、Lys167、Lys177及突变类型(精氨酸K3R或谷氨酰胺K3Q) 阅读提示:Fig. 3f–i图注及Results相关段落 |
| 胞质mtDNA定量 | 细胞分级方法及RT-qPCR normalization策略(全细胞总DNA CT值归一化) 阅读提示:Methods中Cellular fractionation and quantification of cytosolic mtDNA小节 |