DKD患者和小鼠模型中IGFBP7表达与临床指标关联分析
验证IGFBP7在DKD中表达升高并与疾病进展相关。
检测DKD患者肾活检组织及血清IGFBP7水平,分析其与eGFR、UPE的相关性;在STZ诱导1型、HFD/STZ诱导2型和db/db 2型糖尿病小鼠中检测肾脏IGFBP7表达及血/尿IGFBP7与白蛋白尿的相关性。
Renal insulin-like growth factor binding-protein 7 is a critical promoter of progressive diabetic kidney disease.
含患者样本、多种DKD小鼠模型、细胞、类器官及转基因/条件敲除,并完成功能与机制验证
DKD患者肾活检组织和血清样本 STZ诱导1型DKD小鼠及HFD/STZ诱导2型DKD小鼠 db/db 2型糖尿病小鼠 HK2、mTEC、MPC5和SV40细胞
IGFBP7条件敲除(cKO)与转基因过表达在1型和2型DKD模型中的表型验证 STAT3在肾小管上皮细胞条件敲除及AAV介导的回复/敲低实验 LA(2.5 mg/kg,每周,10周)在STZ诱导1型DKD模型中的疗效验证 重组IGFBP7与STAT3及LA结合的SPR检测 肾小管类器官中高糖刺激后纤维化指标的检测
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证IGFBP7在DKD中表达升高并与疾病进展相关。
检测DKD患者肾活检组织及血清IGFBP7水平,分析其与eGFR、UPE的相关性;在STZ诱导1型、HFD/STZ诱导2型和db/db 2型糖尿病小鼠中检测肾脏IGFBP7表达及血/尿IGFBP7与白蛋白尿的相关性。
探究DKD中IGFBP7表达升高的细胞来源和表观遗传机制。
用不同浓度葡萄糖刺激mTEC、MPC5和SV40细胞,检测IGFBP7表达和分泌;在HK2细胞中检测H3K4me3修饰及MLL1/WDR5抑制剂对IGFBP7表达的影响;ChIP验证H3K4Me3在IGFBP7启动子的富集。
验证IGFBP7在体内是否促进DKD进展。
在IGFBP7 KO、肾小管特异性cKO、足细胞特异性cKO及转基因过表达小鼠中诱导1型或2型DKD,检测白蛋白尿、肾功能、组织病理、纤维化、脂质积累和线粒体结构。
明确IGFBP7是否通过抑制脂肪酸氧化损害线粒体功能。
在HK2细胞中过表达或敲低IGFBP7,结合高糖处理,检测OCR、FAO相关基因表达、PGC-1α和pAMPK水平;使用etomoxir抑制FAO;油红O染色检测脂质积累。
揭示IGFBP7促进DKD的分子机制。
通过IP-MS筛选IGFBP7结合蛋白,Co-IP、SPR、免疫荧光共定位和分子对接验证IGFBP7与STAT3结合;构建截短体定位结合域;检测IGFBP7对STAT3乙酰化、二聚化及SIRT2相互作用的影响。
验证STAT3是否介导IGFBP7的致病作用。
构建肾小管特异性STAT3 KO小鼠,在STZ或HFD/STZ诱导DKD中检测白蛋白尿和纤维化;在IGFBP7 cKO小鼠中AAV过表达STAT3,在IGFBP7转基因小鼠中敲低STAT3,观察表型逆转。
寻找靶向IGFBP7治疗DKD的小分子化合物并验证其效果。
虚拟筛选24,327种生物活性化合物,鉴定LA与IGFBP7结合并破坏IGFBP7-STAT3相互作用;在HK2细胞中检测抗纤维化作用;在STZ诱导1型和HFD/STZ诱导2型DKD小鼠中给予LA治疗,评估肾功能、纤维化和脂质沉积。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| OPT-MEM培养基 | -- | -- | |
| 基质胶 | Corning | -- | |
| 药物处理 | 链脲佐菌素 | Sigma | -- |
| D-葡萄糖 | Sigma | -- | |
| MM-102 | MCE | -- | |
| 乙莫克舍 | MCE | -- | |
| 左亚叶酸 | MCE | -- | |
| MG-132 | -- | -- | |
| Western blot | 抗IGFBP7抗体 | Abcam | ab171085 |
| 抗IGFBP7抗体 | Abcam | ab214262 | |
| 抗IGFBP7抗体 | Proteintech | 19961-1-AP | |
| 抗COL-1抗体 | Proteintech | 66761-1-Ig | |
| 抗αSMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 抗STAT3抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | Zen-Bio | R381552 | |
| 抗乙酰化STAT3抗体 | CST | #2523 | |
| 抗PGC-1α抗体 | Zen-Bio | R381615 | |
| 抗磷酸化AMPK抗体 | Abclonal | AP1441 | |
| 抗AMPK抗体 | Abclonal | A1229 | |
| 抗H3K4Me1抗体 | Abclonal | A22079 | |
| 抗H3K4Me3抗体 | Abclonal | A22146 | |
| 抗H3K27Ac抗体 | Abclonal | A22264 | |
| 抗组蛋白H3抗体 | Abclonal | A2348 | |
| 抗Plin2抗体 | Proteintech | 15294-1-AP | |
| 抗KIM-1抗体 | Proteintech | 30948-1-AP | |
| 抗NLRP3抗体 | Wanlei | WL02635 | |
| 抗TNFα抗体 | Proteintech | 60291-1-Ig | |
| 抗γH2AX抗体 | Zen-Bio | R381558 | |
| 抗WT-1抗体 | Abcam | ab267377 | |
| 抗Nephrin抗体 | Abcam | ab216341 | |
| 抗NFκB1抗体 | Proteintech | 10745-1-AP | |
| 抗HSPA5抗体 | Zen-Bio | R24618 | |
| 抗SIRT2抗体 | HuaBio | ET1611-72 | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 20543-1-AP | |
| 抗HA抗体 | Proteintech | 51064-2-AP | |
| 抗Myc抗体 | Proteintech | 60003-2-Ig | |
| 抗GFP抗体 | Abmart | M20004 | |
| 抗MDM2抗体 | Proteintech | 66511-1-Ig | |
| 抗β-actin抗体 | Bioss | bs-10966R | |
| 免疫荧光 | 荧光素标记LTL | Vector Laboratories | FL-1321 |
| 荧光素标记PNA | Vector Laboratories | FL-1071 | |
| 荧光素标记DBA | Vector Laboratories | FL-1031 | |
| Western blot | IRDye 800标记二抗 | Rockland Immunochemicals | -- |
| 组织学 | PAS染色试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 生化检测 | 肌酐检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| 血尿素氮检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | -- | |
| ELISA | IGFBP7 ELISA试剂盒 | Shanghai MLBIO Biotechnology | -- |
| 细胞培养 | 重组小鼠IGFBP7蛋白 | Novoprotein | CU51 |
| 动物实验 | FITC-菊粉 | Mannheim Pharma & Diagnostics GmbH | -- |
| 代谢检测 | XF24细胞外流量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 寡霉素 | -- | -- | |
| FCCP | -- | -- | |
| 鱼藤酮 | -- | -- | |
| 影像分析 | ImageXpress Micro 4高内涵成像系统 | Molecular Devices | -- |
| 显微镜检查 | Olympus IX83显微镜 | Olympus | -- |
| 电镜观察 | Jeol 1010透射电子显微镜 | Jeol | -- |
| 荧光检测 | SpectraMax i3x酶标仪 | Molecular Devices | -- |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质IP试剂盒 | Cell Signaling Technology | #9003 |
| qPCR | SYBR Green | Takara Bio | -- |
| Premix Ex Taq | Takara Bio | -- | |
| 蛋白免疫印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 免疫共沉淀 | 蛋白A/G磁珠 | Bio-linkedin | -- |
| 脂质组学 | UHPLC eNexera LC-30A液相色谱仪 | Shimadzu | -- |
| Q Exactive混合四极杆-轨道阱质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| SPR分析 | Biacore T200系统 | Cytiva | -- |
| Western blot | Li-Cor/Odyssey红外成像系统 | LI-COR Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | STZ诱导1型DKD:10周龄雄性C57BL/6小鼠,STZ 50 mg/kg连续5天腹腔注射,观察24周;HFD/STZ诱导2型DKD:8-10周龄雄性小鼠,HFD喂养4周后单侧肾切除,恢复1周后低剂量STZ 50 mg/kg连续3天腹腔注射,继续HFD喂养20周。 阅读提示:Methods 'Mouse models of diabetic kidney disease'及图2、图5图注 |
| 细胞高糖处理 | 高糖浓度30 mmol/L D-葡萄糖,正常糖5.6 mmol/L,甘露醇作为渗透压对照;处理时间未在Methods中统一明确,需查阅各图注。 阅读提示:Methods 'Cell culture and treatment'及图1、图3图注 |
| LA给药方案 | LA 2.5 mg/kg每周给药,持续10周(STZ诱导1型DKD);2型DKD模型给药方案文中未明确说明;db/db小鼠6月龄开始给药4周后停药。 阅读提示:Results 'LA acts as an IGFBP7 antagonist to alleviate the progression of DKD'及图7F、7J图注 |
| IGFBP7条件敲除与过表达 | Ksp-Cre和Nphs1-Cre品系来源、Cre+/IGFBP7fl/fl小鼠构建;AAV介导的过表达或敲低剂量与注射方式文中未明确说明。 阅读提示:Methods 'Mouse models of diabetic kidney disease'及补充图5、8、9 |
| STAT3在肾小管细胞中的功能验证 | S3cKO小鼠构建;AAV-STAT3过表达或敲低的剂量、时间及注射途径文中未明确说明。 阅读提示:Results 'Conditional STAT3 KO or knockdown in renal TECs eased DKD'及图5D、5K图注 |