外泌体分离与鉴定
确认高/低转移性肝癌细胞分泌外泌体的差异并验证外泌体身份。
超速离心法从等数量肝癌细胞条件培养基中分离外泌体,电镜和Nanosight分析形态、粒径和数量,免疫印迹检测HSP70、CD63、TSG101、CD9、CD81。
Tumor-derived exosomal miR-1247-3p induces cancer-associated fibroblast activation to foster lung metastasis of liver cancer.
含体外细胞模型、外泌体示踪、双荧光素酶、动物肺转移与移植瘤模型及患者血清和组织样本,并有功能与机制验证。
高/低转移性人肝癌细胞系(CSQT-2、HCC-LM3、HepG2、MHCC-97L、SMMC-7721) 人胚胎肺成纤维细胞MRC5 裸鼠尾静脉注射肺转移模型与皮下移植瘤模型 HCC患者血清、组织及原代CAFs/NFs
高/低转移性肝癌细胞系分组及等数量细胞来源外泌体的比较 外泌体鉴定标志物HSP70、CD63、TSG101、CD9、CD81及电镜/Nanosight粒径分析 miR-1247-3p mimic/inhibitor与B4GALT3 siRNA/过表达的功能回补实验 B4GALT3野生型与突变型结合位点双荧光素酶报告基因实验 裸鼠尾静脉注射SMMC-7721后每周两次注射等数量外泌体持续一个月的肺转移模型
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确认高/低转移性肝癌细胞分泌外泌体的差异并验证外泌体身份。
超速离心法从等数量肝癌细胞条件培养基中分离外泌体,电镜和Nanosight分析形态、粒径和数量,免疫印迹检测HSP70、CD63、TSG101、CD9、CD81。
验证肿瘤来源外泌体能否递送至成纤维细胞并诱导其活化。
DiO标记肿瘤来源外泌体、DiI标记MRC5,共聚焦观察递送;等量外泌体处理MRC5后检测迁移、伤口愈合、促炎基因表达和胶原收缩。
筛选介导成纤维细胞活化的外泌体miRNA并验证miR-1247-3p的作用。
外泌体miRNA芯片比较高低转移细胞,热图分析差异;mimic和inhibitor处理MRC5,检测促炎基因和迁移能力。
确定miR-1247-3p在成纤维细胞中的直接下游靶点。
生物信息学预测靶基因,双荧光素酶报告基因验证B4GALT3结合位点,qRT-PCR和免疫印迹检测B4GALT3表达,siRNA和过表达进行功能回补。
验证miR-1247-3p通过B4GALT3调控β1-integrin–NF-κB信号。
条件培养基或外泌体处理MRC5,免疫印迹检测p-NF-κB、IκBα、β1-integrin;β1-integrin敲低回补实验;CHX阻断蛋白合成后检测β1-integrin降解。
验证miR-1247-3p活化的成纤维细胞对肝癌细胞恶性表型的促进作用。
ELISA检测IL-6/IL-8分泌,条件培养基培养SMMC-7721后检测干性基因、成球、迁移、EMT和索拉非尼耐药,中和抗体阻断IL-6/IL-8;裸鼠皮下移植瘤实验。
验证高转移细胞来源外泌体对肝癌肺转移的促进作用。
尾静脉注射荧光素酶标记SMMC-7721细胞,随后每周两次静脉注射等数量不同肿瘤细胞来源外泌体持续一个月,再一个月后生物发光成像检测肺转移。
分析miR-1247-3p与肝癌肺转移及预后的相关性。
收集健康对照、无肺转移HCC和有肺转移HCC患者血清外泌体,检测miR-1247-3p;85例HCC组织芯片原位杂交评分,Kaplan-Meier生存分析;联合IHC检测AFP和α-SMA。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 原代细胞分离 | 肿瘤解离试剂盒 | Miltenyi Biotec | -- |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| Eagle最低必需培养基 | Wisent | -- | |
| Western blot | TSG101抗体 | Abcam | ab125011 |
| HSP70抗体 | Abcam | ab2787 | |
| 免疫组化 | α-SMA抗体 | Abcam | ab32575 |
| Western blot | Rab27A抗体 | Abcam | ab108983 |
| β1-integrin抗体 | Abcam | ab52971 | |
| CD9抗体 | Abcam | ab92726 | |
| CD81抗体 | Abcam | ab79559 | |
| 磷酸化NF-κB (S536)抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 总NF-κB抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4812 | |
| PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 9532 | |
| Cleaved Caspase3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| CD63抗体 | ABclonal Technology | A5271 | |
| B4GALT3抗体 | ABclonal Technology | A11939 | |
| β-actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 中和实验 | 抗IL-6中和抗体 | R&D Systems | -- |
| 抗IL-8中和抗体 | R&D Systems | -- | |
| 药物处理 | 索拉非尼 | TargetMol | -- |
| 胶原收缩实验 | I型大鼠尾胶原 | Corning | -- |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Laboratories | -- |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | Superscript III逆转录酶 | Invitrogen | -- |
| 实时定量PCR | SYBR Green PCR预混液 | TaKaRa | -- |
| 原位杂交 | hsa-miR-1247-3p miRCURY LNA检测探针 | Exiqon | -- |
| 外泌体分离 | 0.22 μm滤器 | Millipore | -- |
| Optima MAX-XP超速离心机 | Beckman Coulter | -- | |
| 外泌体鉴定 | Philips CM120 BioTwin透射电子显微镜 | FEI Company | -- |
| 外泌体定量 | NanoSight NS300 | Malvern Instruments Ltd | -- |
| 外泌体示踪 | DiO | Beyotime | -- |
| DiI | Beyotime | -- | |
| 共聚焦成像 | TCS SP8共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | -- |
| miRNA芯片 | Agilent人类miRNA 8*60 K V21.0芯片 | Agilent Technologies | -- |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶试剂盒 | Promega | -- |
| 动物活体成像 | IVIS Lumina系列III | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 外泌体分离与鉴定 | 细胞接种数量、无外泌体血清培养基培养48 h、0.22 μm过滤及超速离心参数 阅读提示:Methods中“Isolation and analysis of exosomes”小节 |
| 外泌体处理成纤维细胞 | 等量外泌体处理剂量、处理时间及MRC5细胞状态 阅读提示:Results“Tumor-derived exosomes regulate fibroblasts activation”及Fig. 1图注 |
| miR-1247-3p mimic/inhibitor功能实验 | mimic/inhibitor转染浓度、转染试剂及检测时间点 阅读提示:Methods“RNA interference and plasmids”及Supplementary Table 2、3 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 野生型与突变型B4GALT3结合位点序列、共转染比例及检测时间 阅读提示:Methods“Luciferase reporter assay”及Fig. 3c、d |
| 裸鼠肺转移模型 | SMMC-7721细胞注射数量1×10^6、尾静脉注射、外泌体每周两次持续一个月及观察终点 阅读提示:Methods“Animal studies”及Fig. 1h图注 |
| 临床样本分析 | 血清样本分组(25例健康对照、90例无肺转移HCC、20例肺转移HCC)及85例HCC组织芯片来源 阅读提示:Methods“Specimens and primary cells”及Fig. 6c、d |