构建ISG15敲除及回复细胞系
验证ISGylation在体内肺癌模型中对STING激动剂反应的影响
在LLC细胞中敲除ISG15,并回复表达ISG15-WT或非ISGylatable突变体ISG15-C2,然后植入C57BL/6小鼠,用diABZi处理
ISGylation prevents autophagic degradation of STING and promotes antitumor immunity in lung cancer.
包含体外细胞实验(HEK293T、H1299、LLC)、体内小鼠模型(LLC皮下移植瘤)、患者样本(组织芯片)及药物筛选,多层级功能与机制验证。
H1299人非小细胞肺癌细胞系 LLC小鼠Lewis肺癌细胞系 C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 肺癌患者组织芯片
STING ISGylation位点:K236、K338、K347、K370 ISG15-C2非ISGylatable突变体的使用 USP18作为去ISG化酶的活性依赖性(C64S突变体对照) TST对USP18的抑制活性(IC50=3.41 µM)及体内剂量 体内实验使用diABZi(3 mg/kg,每3天静脉注射)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证ISGylation在体内肺癌模型中对STING激动剂反应的影响
在LLC细胞中敲除ISG15,并回复表达ISG15-WT或非ISGylatable突变体ISG15-C2,然后植入C57BL/6小鼠,用diABZi处理
确定介导STING稳定性调控的关键赖氨酸残基
在HEK293T细胞中共表达STING、E1、E2和各种E3连接酶,筛选增强ISGylation的E3;通过构建STING-K0和单个赖氨酸回复突变体,检测各残基的ISGylation及对蛋白稳定性的影响
区分ISGylation是抑制自噬还是蛋白酶体途径的降解
使用自噬抑制剂CQ和蛋白酶体抑制剂MG132处理,检测STING蛋白水平变化;通过免疫共沉淀检测STING与p62/LC3的相互作用;使用共聚焦显微镜观察STING与LC3的共定位
验证STING四突变(4KR)导致的ISGylation缺失是否影响肿瘤生长和免疫浸润
将表达STING-WT或STING-4KR的LLC细胞植入C57BL/6小鼠,监测肿瘤生长,并通过流式细胞术分析肿瘤浸润免疫细胞
探讨USP18表达与STING水平及患者预后的临床关联
使用TCGA数据库进行Kaplan-Meier生存分析;对60对肺癌和癌旁组织进行IHC染色,评估USP18和STING表达并进行相关性分析
鉴定能够稳定STING的小分子USP18抑制剂,并验证其增强STING ISGylation和抗肿瘤作用
通过FRET-based酶学筛选17,280个小分子,获得TST;通过NMR-STD验证直接结合;细胞实验中检测TST对STING ISGylation和蛋白稳定性的影响;体内实验评估TST单用及与diABZi联用的抗肿瘤效果
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | HyClone | -- |
| RPMI 1640培养基 | HyClone | -- | |
| 胎牛血清 | Yeasen | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Basal media | -- | |
| 非必需氨基酸溶液 | Basal media | -- | |
| HEPES | Solarbio | -- | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo 2.0 发光细胞活力检测试剂盒 | Promega | G9241 |
| 转染 | Hieff Trans脂质体转染试剂 | Yeasen | 40802 |
| Western blot | 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F7425 |
| 抗Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 18583 | |
| 抗HA抗体 | Cell Signaling Technology | 3724 | |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抗ISG15抗体 | Invitrogen | 7H29L24 | |
| 抗IRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 4302 | |
| 抗pIRF3抗体 | Cell Signaling Technology | 79945 | |
| 抗LC3I/II抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| 抗p62抗体 | Cell Signaling Technology | 39749 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 20326 | |
| 抗K48-泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 8081 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 抗兔IgG-HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 抗小鼠IgG-HRP二抗 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD45-FITC抗体 | BioLegend | 103107 |
| 抗小鼠CD8a-APC抗体 | BioLegend | 100711 | |
| 抗小鼠NK1.1-PE抗体 | BioLegend | 156503 | |
| 药物处理 | diABZi | Selleck | S8796 |
| 丹参酮IIA磺酸钠 | Yeasen | 54516ES20 | |
| MG132 | Topscience | T2154 | |
| 氯喹 | Cell Signaling Technology | 14774 | |
| 蛋白质印迹 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche Diagnostics | 5892791001 |
| ExpressPlus PAGE凝胶,4-20% | GenScript | M00657 | |
| eBlot-L1系统 | GenScript | L00686 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag M2亲和凝胶 | Sigma-Aldrich | A2220 |
| RT-qPCR | TRIeasy总RNA提取试剂 | Yeasen | 19221ES60 |
| Hifair II第一链cDNA合成试剂盒 | Yeasen | 11119ES60 | |
| Hieff qPCR SYBR绿色预混液(无Rox) | Yeasen | 11201ES08 | |
| 免疫荧光 | 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 |
| 抗LC3I/II抗体 | Cell Signaling Technology | 3868 | |
| 荧光标记二抗 | Beyotime | A0468/A0423 | |
| 荧光显微镜 | Nikon | A1R | |
| 稳定细胞系构建 | pSPAX2 | Addgene | 12260 |
| 聚凝胺 | -- | -- | |
| RNA干扰 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher | L3000015 |
| ELISA | 人/小鼠IFN-β ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0033L |
| 流式细胞术 | 胶原酶D | Sigma-Aldrich | C5138 |
| 透明质酸酶 | Yeasen | 20426ES60 | |
| DNA酶I | Yeasen | 10608ES25 | |
| 红细胞裂解液 | Yeasen | 40401ES60 | |
| Attune NxT流式细胞仪 | Thermo Fisher | -- | |
| 组织芯片和免疫组化 | 肺癌组织芯片 | Biotechwell | ZL-LUC1601 |
| 免疫组化 | 抗USP18抗体 | Thermo Fisher | PA5-110555 |
| 抗STING抗体 | Cell Signaling Technology | 13647 | |
| 抑制剂筛选 | 肽-AMC底物 | Bachem Bioscience | 4027158 |
| 384孔黑色非结合板 | Corning | 3575 | |
| NMR-STD | Bruker Avance III-600 MHz谱仪 | Bruker Biospin | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外ISGylation实验 | 细胞系(HEK293T)、转染质粒(Flag-STING、UBE1L、UBCH8、HERC5、Myc-ISG15)、处理时间(24小时)、检测方法(免疫沉淀后Western blot) 阅读提示:参见Materials and methods中“ISGylation and ubiquitination”部分及图2图注 |
| 体内肺癌模型 | 小鼠品系(C57BL/6)、细胞系(LLC)、细胞接种量(5×10^6)、药物剂量(diABZi 3 mg/kg,TST 2.5/5/10 mg/kg)、给药途径(静脉注射)、给药频率(每3天)、肿瘤采集时间(第14天) 阅读提示:参见Materials and methods中“Xenograft animal model”部分及图1、图6图注 |
| 免疫细胞分析 | 流式抗体(CD45-FITC、CD8a-APC、NK1.1-PE)、组织消化酶(胶原酶D 1 mg/mL、透明质酸酶0.2 mg/mL、DNase I 0.1 mg/mL)、染色时间(室温20分钟) 阅读提示:参见Materials and methods中“Flow cytometry”部分及图1、4、6图注 |
| 蛋白质稳定性检测 | CHX浓度(100 µg/mL或50 µg/mL)、处理时间点、TST预处理浓度(50 µM)和时间(12小时) 阅读提示:参见Materials and methods中“Protein stability assay”部分及图6D,E图注 |