体外药效评价
评估TBMS1对HSFs增殖、迁移和肌成纤维细胞活化的影响
使用CCK-8测定IC50,并检测不同浓度TBMS1处理48小时后HSFs活力;通过Transwell和伤口愈合实验检测迁移;通过胶原凝胶收缩实验和免疫荧光检测α-SMA表达。
Targeted ferroptosis of myofibroblasts by tubeimoside I attenuates hypertrophic scar formation.
包含体外细胞实验(增殖、迁移、凋亡、铁死亡检测)、机制验证(通路抑制剂/激活剂、基因敲低)及兔耳体内模型,多个证据层级且含功能与机制验证。
增生性瘢痕成纤维细胞(HSFs) 正常皮肤成纤维细胞(NSFs) 兔耳增生性瘢痕模型
TBMS1处理HSFs的浓度(IC50为4.3 μM,后续实验采用4 μM) TBMS1处理时间(多为48小时) 铁死亡抑制剂ferrostatin-1(1 μM)的验证作用 PI3K/AKT通路激活剂740Y-P(30 μM)的逆转作用 兔耳模型中TBMS1注射剂量(40 μM和400 μM)及时间(第14天开始,每7天一次,共28天)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TBMS1对HSFs增殖、迁移和肌成纤维细胞活化的影响
使用CCK-8测定IC50,并检测不同浓度TBMS1处理48小时后HSFs活力;通过Transwell和伤口愈合实验检测迁移;通过胶原凝胶收缩实验和免疫荧光检测α-SMA表达。
验证TBMS1是否通过诱导铁死亡抑制HSFs活性
通过RNA-seq和GSEA分析差异基因富集通路;检测铁死亡相关基因表达;使用铁死亡抑制剂ferrostatin-1、凋亡抑制剂Z-VAD-FMK和坏死性凋亡抑制剂necrosulfonamide处理,检测细胞活力;检测ROS、MDA、Fe2+、GSH/GSSG、Fe2+/Fe3+比值。
阐明TBMS1诱导铁死亡的分子机制,特别是PI3K/AKT/NRF2通路的作用
Western blot检测PI3K/AKT通路蛋白和NRF2、SLC40A1、GPX4表达;使用PI3K/AKT激活剂740Y-P处理,检测其对TBMS1作用的影响;通过siRNA敲低SLC7A11和使用ML385抑制NRF2,检测GPX4表达。
在兔耳HS模型中验证TBMS1的抗纤维化效果
建立兔耳HS模型,局部注射TBMS1,观察瘢痕外观和组织学变化;通过H&E、Masson染色评估瘢痕面积和SEI;qRT-PCR检测纤维化相关基因表达;免疫组化检测CD31和VEGF表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 胎牛血清 | BI, Israel | -- |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | InCELLGene, United States | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning, NY | -- |
| 胶原凝胶收缩实验 | 胶原悬液 | Cell Biolabs, San Diego, CA | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC凋亡检测试剂盒 | BioLegend, San Diego, CA, United States | -- |
| 细胞周期检测 | 细胞周期与凋亡分析试剂盒 | UElady, Suzhou, China | -- |
| 流式分析 | 流式细胞仪 | BD Biosciences, Franklin Lakes, NJ | -- |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Proteintech | 67735-1-Ig |
| α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| 二抗Alexa Fluor 488 | Invitrogen | -- | |
| 二抗Alexa Fluor 594 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白质定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime, Shanghai, China | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore, Billerica, United States | -- |
| ECL Western blot底物 | -- | -- | |
| PI3K抗体 | Proteintech | 20584-1-AP | |
| AKT抗体 | Proteintech | 10176-2-AP | |
| p-AKT抗体 | Proteintech | 66444-1-Ig | |
| III型胶原抗体 | Proteintech | 22734-1-AP | |
| I型胶原抗体 | Proteintech | 14695-1-AP | |
| α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| MMP2抗体 | Proteintech | 10373-2-AP | |
| MMP9抗体 | Proteintech | 10375-2-AP | |
| NRF2抗体 | Proteintech | 16396-1-AP | |
| SLC40A1抗体 | Proteintech | 26601-1-Ig | |
| GPX4抗体 | Proteintech | 30388-1-Ig | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| ROS检测 | DCFH-DA | Beyotime Biotechnology, China | S0033S |
| MDA检测 | MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng, Nanjing, China | A003-1-2 |
| 铁离子检测 | 亚铁离子比色检测试剂盒 | Elabscience, Wuhan, China | E-BC-K881-M |
| 总铁比色检测试剂盒 | Elabscience, Wuhan, China | E-BC-K880-M | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen, Carlsbad, United States | L3000075 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen, Carlsbad, CA, United States | -- |
| RNA-seq | QiaQuick PCR纯化试剂盒 | Qiagen, Venlo, Netherlands | -- |
| Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Gene Denovo Biotechnology Co., Guangzhou, China | -- | |
| qRT-PCR | RNA Simple总RNA提取试剂盒 | Invitrogen | -- |
| PrimeScript RT Master Mix | Yeasen, China | -- | |
| SYBR Premix EX Taq | Takara, China | -- | |
| 药物处理 | 土贝母苷甲 | MCE | HY-N0890 |
| Ferrostatin-1 | MCE | HY-100579 | |
| Necrosulfonamide | MCE | HY-100573 | |
| 740Y-P | MCE | HY-P0175 | |
| Z-VAD-FMK | MCE | HY-16658B | |
| Erastin | MCE | HY-15763 | |
| ML385 | MCE | HY-100523 | |
| 动物实验 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞处理 | TBMS1处理HSFs的浓度(IC50为4.3 μM,后续实验采用4 μM)和处理时间(48小时) 阅读提示:参见Results部分'TBMS1 inhibited HSF proliferation'及图1图注 |
| 铁死亡验证 | 抑制剂浓度:ferrostatin-1 (1 μM)、Z-VAD-FMK (10 μM)、necrosulfonamide (1 μM);检测指标包括ROS、MDA、Fe2+、GSH/GSSG、Fe2+/Fe3+ 阅读提示:参见Results部分'TBMS1 induced HSF ferroptosis'及图4图注 |
| 机制验证 | 740Y-P浓度30 μM;ML385浓度5 μM;siRNA敲低SLC7A11序列;Erastin浓度5 μM 阅读提示:参见Results部分'TBMS1-induced ferroptosis is regulated via PI3K/AKT pathway'及图5、图6图注 |
| 动物实验 | 兔耳HS模型建立方法(伤口大小、数量);TBMS1给药剂量(40 μM和400 μM)和给药时间(第14天开始,每7天一次,共28天);对照组DMSO注射 阅读提示:参见Materials and methods部分'animal model'及Results部分'TBMS1 ameliorated HS in rabbits'及图7图注 |