CTSS表达与衰老相关性的鉴定
筛选并验证与衰老相关且可能影响认知的差异表达基因。
对年轻和年老小鼠海马进行转录组测序,鉴定差异表达基因,并通过免疫印迹和免疫荧光验证CTSS在神经元和小胶质细胞中的表达,同时检测老年人血清CTSS水平。
Neuronal cathepsin S increases neuroinflammation and causes cognitive decline via CX3CL1-CX3CR1 axis and JAK2-STAT3 pathway in aging and Alzheimer's disease.
包括细胞模型(BV2、HT-22)和动物模型(APP/PS1、AAV过表达/敲降)、转录组测序、FACS、免疫印迹、行为学及抑制剂干预等多层级验证。
C57BL/6J小鼠 APP/PS1转基因小鼠 BV2小胶质细胞系 HT-22海马神经元细胞系
神经元CTSS过表达/敲降的AAV注射及效率验证 小胶质细胞活化及M1/M2表型分析(FACS) CX3CL1-CX3CR1轴和JAK2-STAT3通路蛋白水平检测 LY3000328给药剂量及给药方式
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选并验证与衰老相关且可能影响认知的差异表达基因。
对年轻和年老小鼠海马进行转录组测序,鉴定差异表达基因,并通过免疫印迹和免疫荧光验证CTSS在神经元和小胶质细胞中的表达,同时检测老年人血清CTSS水平。
探究神经元CTSS过表达是否足以导致空间学习和记忆缺陷。
通过海马立体定位注射AAV在年轻小鼠神经元中过表达CTSS,利用Morris水迷宫评估空间学习和记忆能力。
验证降低神经元CTSS是否能改善年老小鼠的学习记忆缺陷。
通过AAV介导的shRNA在年老小鼠海马神经元中敲降CTSS,并进行MWM测试。
研究CTSS过表达是否加剧脑内炎症反应并影响小胶质细胞活化状态。
对CTSS过表达海马进行转录组测序,利用qRT-PCR验证炎症标志物,通过FACS和免疫荧光分析小胶质细胞数量及M1/M2表型。
确认CTSS通过CX3CL1-CX3CR1轴和JAK2-STAT3通路介导神经元-小胶质细胞串扰。
通过qRT-PCR、FACS、免疫印迹和免疫荧光检测CX3CL1、CX3CR1、p-JAK2、p-STAT3表达,并使用Transwell共培养体系验证分泌效应。
评估CTSS选择性抑制剂LY3000328对APP/PS1小鼠AD相关病理和行为缺陷的改善作用。
对8月龄APP/PS1小鼠海马慢性注射LY3000328或DMSO,进行MWM测试、免疫荧光和免疫印迹检测Aβ沉积、小胶质细胞和通路蛋白。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 神经元分离和培养 | 最低必需培养基 | Invitrogen | -- |
| 牛转铁蛋白 | Calbiochem | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 阿糖胞苷 | Sigma-Aldrich | -- | |
| B27培养基添加剂 | Invitrogen | -- | |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Gibco | -- |
| 免疫荧光 | 抗CTSS抗体 | Santa Cruz | sc-74429 |
| 抗NeuN抗体 | Millipore | Mab377 | |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab178846 | |
| 抗Iba1抗体 | Abcam | ab5076 | |
| 抗6E10抗体 | Biolegend | 803014 | |
| 抗β淀粉样蛋白1-42抗体 | Abcam | ab201060 | |
| 抗CX3CR1抗体 | Thermo Fisher | 14-7986-81 | |
| 抗CX3CR1抗体 | Abcam | ab308613 | |
| 抗CX3CL1抗体 | Thermo Fisher | 14-6093-81 | |
| 抗CREB抗体 | CST | 9197 | |
| 抗磷酸化CREB抗体 | CST | 9198 | |
| DAPI | CST | 4083 | |
| 免疫印迹 | RIPA裂解液 | CST | 9806 |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂 | Thermo Fisher | 78441 | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 81115-1-RR | |
| 抗JAK2抗体 | CST | 3230 | |
| 抗磷酸化JAK2抗体 | CST | 3771 | |
| 抗STAT3抗体 | CST | 9139 | |
| 抗磷酸化STAT3抗体 | CST | 9145 | |
| 抗组织蛋白酶B抗体 | Abcam | ab214428 | |
| 抗组织蛋白酶L抗体 | Santa Cruz | sc-390367 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| 一步法基因组DNA去除和cDNA合成预混液 | Takara | -- | |
| TB Green qPCR预混液 | Takara | -- | |
| 微体积分光光度计 | Thermo Fisher | -- | |
| RNA-seq | Illumina NovaSeq6000平台 | Illumina | -- |
| FACS | Percoll | GE Healthcare | -- |
| 抗CD11b抗体 | BioLegend | 101211 | |
| 抗CD45.2抗体 | BioLegend | 109823 | |
| 抗CX3CR1抗体 | BioLegend | 149005 | |
| 抗CD86抗体 | BioLegend | 105031 | |
| 抗CD206抗体 | BioLegend | 141705 | |
| 固定/透化试剂盒 | BioLegend | 426803 | |
| FACS Aria III流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| Transwell共培养 | Transwell培养板 | Corning | -- |
| 抑制剂给药 | LY3000328 | MedChemExpress | HY-15533 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与AAV注射 | 小鼠品系、月龄、性别、AAV滴度和注射坐标 阅读提示:见Methods 2.1和2.10,Figure 2和3的图注 |
| CTSS检测 | 抗体浓度、免疫印迹蛋白上样量(30μg)、qRT-PCR引物序列及内参 阅读提示:见Methods 2.6-2.9,Table 2 |
| 行为学测试 | MWM平台尺寸、水透明度、训练次数、探针测试时间;开放场测试时长 阅读提示:见Methods 2.11和2.12,Figure 2和3的图注 |
| 抑制剂处理 | LY3000328剂量(0.2mg/kg)、给药体积和频率、导管植入坐标 阅读提示:见Methods 2.18,Figure 6b,c |
| 小胶质细胞分析 | FACS门控策略(CD11b+CD45int)、抗体克隆号、单细胞悬液制备步骤 阅读提示:见Methods 2.14和2.15,Figure 4f-j |