验证TIGAR在脓毒症中的表达和功能
检测TIGAR在脓毒症小鼠中的表达变化,并评估髓系Tigar敲除对脓毒症的影响
通过Western blot检测脓毒症小鼠血液和脾脏F4/80+细胞中TIGAR表达;构建髓系特异性Tigar敲除小鼠(MacKO),采用LPS注射或CLP诱导脓毒症,监测临床评分和生存率,检测炎症因子水平。
Disruption of TIGAR-TAK1 alleviates immunopathology in a murine model of sepsis.
包含细胞、动物模型和患者样本等多层级证据,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠骨髓源性巨噬细胞(BMDM) RAW264.7细胞 HEK293细胞 小鼠脓毒症模型(LPS诱导和CLP诱导)
雄性C57BL/6J小鼠,8周龄,LPS剂量10 mg/kg腹腔注射 CLP模型:盲肠结扎穿刺,19号针头穿刺两次 5Z-7-OX剂量5 mg/kg腹腔注射,于LPS或CLP前1小时给药 BMDM分化:RPMI 1640培养基,含10 ng/ml mMCSF,培养7天 LPS刺激浓度100 ng/ml,刺激时间0-12小时不等
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测TIGAR在脓毒症小鼠中的表达变化,并评估髓系Tigar敲除对脓毒症的影响
通过Western blot检测脓毒症小鼠血液和脾脏F4/80+细胞中TIGAR表达;构建髓系特异性Tigar敲除小鼠(MacKO),采用LPS注射或CLP诱导脓毒症,监测临床评分和生存率,检测炎症因子水平。
确定TIGAR是否促进巨噬细胞的促炎反应
在BMDM和RAW264.7细胞中,通过Tigar敲除或TIGAR过表达,检测LPS或TNF-α刺激后促炎因子的表达和分泌。
探究TIGAR促进炎症的分子机制是否涉及NF-κB信号通路
通过Western blot检测IKK和p65的磷酸化、IκB-α降解以及p65核转位,并使用NF-κB抑制剂BAY11-7082验证其作用。
确定TIGAR是否直接结合TAK1并促进其激活
通过Co-IP和免疫荧光验证内源性和外源性TIGAR与TAK1的结合及共定位;检测Tigar敲除或过表达对TAK1磷酸化的影响;使用TAK1抑制剂5Z-7-OX和Takinib验证TAK1在TIGAR介导的炎症中的作用。
探究TIGAR是否通过影响TRAF6促进TAK1泛素化
检测TIGAR对TAK1泛素化(尤其K63连接)的影响,以及TIGAR对TAK1-TRAF6复合物形成的作用,并使用TRAF6显性负突变体验证。
确定TIGAR中负责与TAK1结合并促进TAK1激活的精确氨基酸序列
通过截短突变体和点突变体(Mut1、Mut2、Mut3)评估TIGAR与TAK1的结合能力以及对TAK1泛素化的影响;并结合分子动力学模拟预测结合模式。
验证TIGAR(包括其磷酸酶活性非依赖功能)在体内对脓毒症的作用
构建髓系特异性CD11b启动子驱动的慢病毒,在Tigar KO小鼠中回补野生型TIGAR、磷酸酶失活突变体(TMU)或TAK1结合缺陷突变体(Mut2),然后进行CLP诱导脓毒症,评估生存率、临床评分和炎症水平。
评估5Z-7-OX通过阻断TIGAR-TAK1结合对脓毒症的治疗作用
在HEK293细胞中验证5Z-7-OX抑制TIGAR-TAK1结合和TRAF6-TAK1复合物形成;在小鼠CLP脓毒症模型中,腹腔注射5Z-7-OX,检测临床评分、生存率和炎症因子水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 脓毒症诱导 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4516 |
| CLP手术麻醉 | 异氟烷 | -- | -- |
| TAK1抑制剂治疗 | 5Z-7-氧杂泽烯醇 | Sigma-Aldrich | O9890 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| RPMI 1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| BMDM分化 | 重组小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | R&D | 416-ML |
| 细胞裂解 | 细胞裂解液 | Beyotime | P0013 |
| Co-IP | 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 04693132001 |
| 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | sc-2003 | |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 | |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Roche | 0490684001 | |
| Super Signal最大灵敏度底物 | Thermo Fisher Scientific | 34096 | |
| ChemiDoc XRS+成像系统 | Bio-Rad | -- | |
| RNA提取 | RNAiso Plus试剂 | TaKaRa | -- |
| RT-qPCR | AceQ qPCR SYBR Green预混液 | Vazyme Biotech | Q131-02 |
| ABI QuantStudio 6系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 流式细胞术 | APC抗CD11b抗体 | BD Pharmingen | 553312 |
| PE抗CD45抗体 | BD Pharmingen | 553081 | |
| ELISA | 小鼠TNF-α ELISA试剂盒 | eBioscience | BMS6005 |
| 小鼠CCL2 ELISA试剂盒 | eBioscience | BMS6007-3 | |
| 小鼠CCL8 ELISA试剂盒 | eLabscience | CSB-E07458m | |
| 一氧化氮检测 | Griess试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| ROS检测 | 2',7'-二氯二氢荧光素二乙酸酯 | Beyotime | -- |
| 体外激酶实验 | TAK1-TAB1激酶系统 | Promega | V4089 |
| 通用激酶检测试剂盒 | Abcam | ab138879 | |
| 纯化的TIGAR蛋白 | ProteinTech | Ag17661 | |
| 免疫荧光 | DAPI封片剂 | Southern Biotech | 0100-20 |
| 免疫组化 | ABC染色系统 | Santa Cruz | sc-2018 |
| 细胞核分离 | 核质分离试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 78833 |
| 细胞分离 | 磁珠(用于F4/80+细胞分离) | Invitrogen | -- |
| 抗体 | 抗TIGAR抗体 | Abcam | ab189164 |
| 抗p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| 抗TAK1抗体 | Santa Cruz | sc-166562 | |
| Alexa Fluor 555标记驴抗小鼠IgG | Thermo Fisher Scientific | A-31570 | |
| Alexa Fluor 488标记驴抗兔IgG | Thermo Fisher Scientific | A-21206 | |
| 抗Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 14793 | |
| 抗TAK1抗体(用于免疫共沉淀) | Cell Signaling Technology | 5206 | |
| 抗TRAF6抗体 | Thermo Fisher Scientific | PA5-29622 | |
| 抗Flag抗体 | Sigma-Aldrich | F1804 | |
| 抗HA抗体 | Thermo Fisher Scientific | 26183 | |
| 抗His抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA1-21315 | |
| 抗TIGAR抗体 | Santa Cruz | sc-166290 | |
| 抗磷酸化TAK1抗体 | Thermo Fisher Scientific | MA5-15073 | |
| 抗磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 2697 | |
| 抗IKKα/β抗体 | Santa Cruz | sc-7607 | |
| 抗IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4814 | |
| 抗磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| 抗HOIP抗体 | Bethyl | A303-560A | |
| 抗SHARPIN抗体 | Abcam | ab197853 | |
| 抗HOIL-1抗体 | Santa Cruz | sc-365523 | |
| 抗HA抗体 | Roche | 11867423001 | |
| 抗HA抗体 | Thermo Fisher Scientific | 26183 | |
| 抗泛素抗体 | Millipore | MAB1510 | |
| 抗K63泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 5621 | |
| 抗His抗体 | ProteinTech | 66005-1-Ig | |
| 抗Myc抗体 | Cell Signaling Technology | 2278 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | ProteinTech | 11224-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Kangchen Tech | KC-5G4 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Santa Cruz | sc-47778 | |
| 抗Lamin B1抗体 | ProteinTech | 66095-1-Ig |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系、性别、年龄、LPS剂量、CLP手术细节、给药时间 阅读提示:Methods:Animal models |
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基成分、LPS浓度和刺激时间 阅读提示:Methods:Cell culture |
| BMDM分化 | M-CSF浓度、分化时间、培养基更换时间点 阅读提示:Methods:Cell culture |
| 炎症因子检测 | ELISA试剂盒类型、样本来源、检测时间点 阅读提示:Methods:Analysis of metabolic parameters |
| 机制研究 | 抗体信息、Co-IP条件、泛素化检测方法、突变体构建 阅读提示:Methods:Co-IP, Western blot |