体外细胞模型验证TMED2的表达和功能
检测TMED2在口腔癌细胞中的表达水平,并评估其对增殖、迁移和侵袭的影响。
通过RT-qPCR检测人正常口腔上皮细胞(HOEC)和口腔癌细胞系(Tca-8113、TSCCa)中TMED2的mRNA水平;采用shRNA敲低TMED2,通过EdU实验、Transwell实验和克隆形成实验检测细胞增殖、迁移、侵袭和克隆形成能力。
Relationship between transmembrane emp24 domain containing 2 expression and tumor stem cell characteristics in oral cancer.
包含细胞实验(增殖、迁移、侵袭、克隆形成、干细胞标志物)、体内异种移植瘤模型、TCGA数据分析,以及TMED2与GALNT7的功能和机制验证。
口腔癌细胞系Tca-8113 口腔癌细胞系TSCCa 人正常口腔上皮细胞CP-H203 BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
TMED2敲低或过表达及GALNT7过表达对口腔癌细胞的影响 细胞实验中的分组(sh-NC、sh-TMED2、OE-vector、OE-GALNT7) 异种移植瘤模型中,每组10只小鼠,皮下接种Tca-8113细胞(6×10^6)至右腋窝 肿瘤体积测量时间(每7天)和处死时间(接种后第28天) 统计方法(方差分析和独立样本t检验,P<0.05)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
检测TMED2在口腔癌细胞中的表达水平,并评估其对增殖、迁移和侵袭的影响。
通过RT-qPCR检测人正常口腔上皮细胞(HOEC)和口腔癌细胞系(Tca-8113、TSCCa)中TMED2的mRNA水平;采用shRNA敲低TMED2,通过EdU实验、Transwell实验和克隆形成实验检测细胞增殖、迁移、侵袭和克隆形成能力。
探究TMED2是否直接调控GALNT7的表达,以及GALNT7过表达对口腔癌细胞功能的影响。
通过RT-qPCR和Western blot检测TMED2敲低后GALNT7的表达变化;通过共转染实验(sh-NC+OE-vector、sh-NC+OE-GALNT7、sh-TMED2+OE-vector、sh-TMED2+OE-GALNT7)检测GALNT7过表达对细胞增殖、迁移和侵袭的影响。
检测TMED2和GALNT7对口腔癌细胞干细胞标志物表达及克隆形成能力的影响。
通过RT-qPCR检测干细胞标志物(SOX2、OCT4、CD24、Nanog、MYC、BMI1)的mRNA水平;通过Western blot检测蛋白水平;通过软琼脂克隆形成实验评估克隆形成能力;通过TCGA数据库分析TMED2和GALNT7与预后的关系。
在异种移植瘤模型中验证TMED2和GALNT7对肿瘤生长、肺转移和增殖标志物表达的影响。
将Tca-8113细胞皮下注射至裸鼠右腋窝,分为三组(Control+sh-NC+OE-vector、Control+sh-NC+OE-GALNT7、Control+sh-TMED2+OE-vector),记录肿瘤形成时间,每7天测量肿瘤体积,第28天处死,收集肿瘤和肺组织,进行H&E染色、Ki67免疫组化,并通过qRT-PCR和Western blot检测干细胞标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Solarbio | C3260 |
| 胎牛血清 | Solarbio | S9030 | |
| 细胞转染 | 脂质体2000 | Thermo Fisher Scientific | 12566014 |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Solarbi | R1100 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Solarbio | RP1105 |
| qRT-PCR | SYBR Green试剂 | Thermo Fisher Scientific | A46012 |
| 蛋白提取 | 细胞裂解液 | Solarbio | R0010 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore Corporation | IPVH00010 |
| TMED2抗体 | Abcam | ab251705 | |
| GALNT7抗体 | Abcam | ab254971 | |
| SOX2抗体 | Abcam | ab92494 | |
| OCT4抗体 | Abcam | ab181557 | |
| Nanog抗体 | Abcam | ab109250 | |
| GAPDH抗体 | Abcam | ab8245 | |
| HRP标记二抗 | Abcam | ab6721 | |
| 增强化学发光试剂 | Biosharp Life Science | BL520B | |
| Image Quant LAS4000成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| EdU实验 | EdU溶液 | Jiangsu Kaqi Biotechnology Co., Ltd. | KGA331 |
| DAPI染色液 | Solarbio | D8200 | |
| 荧光显微镜 | Olympus Corporation | CX41-32RFL | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning Costar | -- |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 结晶紫 | Solarbio | C8470 | |
| 显微镜 | Olympus Corporation | CKX41 | |
| 克隆形成实验 | 结晶紫 | Solarbio | G1065 |
| CCK-8实验 | CCK-8溶液 | Solarbio | CA1210 |
| 酶标仪 | Molecular Devices | SpectraMax | |
| 免疫组化 | Ki67抗体 | Abcam | ab15580 |
| 牛血清白蛋白 | Solarbio | SW3015 | |
| 二抗 | Proteintech | SA00004-2 | |
| 统计分析 | GraphPad Prism 8软件 | GraphPad Software, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | 细胞系来源(CP-H203、CL-0235、CL-0230);培养基(高糖DMEM)和血清浓度(10% FBS);转染试剂(Lipofectamine 2000)及DNA量(文中未明确说明);转染后孵育时间(12h后换无血清培养基,继续培养24h)。 阅读提示:见Methods中的'Cell culture'和'Cell transfection'部分。 |
| 体外功能实验 | EdU实验细胞密度(1×10^5/孔);Transwell实验细胞密度(1×10^5/孔)和侵袭实验是否包被Matrigel;克隆形成细胞密度(1×10^3/皿)和培养时间(14天);CCK-8细胞密度(4×10^3/孔)和孵育时间(1.5h)。 阅读提示:见Methods中的'EdU assay'、'Transwell migration assay'、'Colony formation assay'和'CCK-8'部分。 |
| 分子表达检测 | qRT-PCR内参基因(β-actin)和引物序列(Table 1);Western blot抗体稀释比(TMED2 1:500, GALNT7 1:1000等);蛋白提取后检测时间(48h)。 阅读提示:见Methods中的'qRT-PCR'和'Western blot'部分,以及Table 1。 |
| 体内异种移植瘤模型 | 动物品系、性别、年龄(雄性BALB/c裸鼠,4-6周龄);细胞注射数量(6×10^6)和部位(右腋窝);分组(三组);肿瘤体积测量频率(每7天)和处死时间(第28天);样本量(每组n=10)。 阅读提示:见Methods中的'Establishment of xenograft tumor models'部分。 |