临床样本验证补体旁路途经激活
评估糖尿病肾病患者肾组织中补体旁路途经的激活程度及其与临床指标的相关性
对DN患者、MCD患者和健康对照的肾活检组织进行免疫组化染色检测Bb、CFB、C3a、C5a、C5b-9沉积,并进行半定量分析和相关性分析;用双重免疫荧光染色确定CFB的细胞定位。
Deficiency of CFB attenuates renal tubulointerstitial damage by inhibiting ceramide synthesis in diabetic kidney disease.
包含患者肾活检组织染色、Cfb基因敲除小鼠模型、体外细胞实验(HK-2、TCMK-1)及转录组和脂质组学等多层次证据,并进行了功能验证和机制研究。
链脲佐菌素联合高脂饮食诱导的Cfb敲除糖尿病小鼠 人肾小管上皮细胞系HK-2 小鼠肾小管上皮细胞系TCMK-1 HEK293T细胞
糖尿病小鼠模型:Cfb–/–小鼠和WT小鼠,链脲佐菌素(60 mg/kg,连续5天)腹腔注射和高脂饮食(D12492)诱导 HK-2细胞高糖处理:葡萄糖浓度30 mmol/L,处理24小时 siRNA转染效率:siCFB转染效率70%-80% 神经酰胺补充:C2-神经酰胺浓度20 μmol/L CERS抑制:FB1浓度20 μmol/L
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估糖尿病肾病患者肾组织中补体旁路途经的激活程度及其与临床指标的相关性
对DN患者、MCD患者和健康对照的肾活检组织进行免疫组化染色检测Bb、CFB、C3a、C5a、C5b-9沉积,并进行半定量分析和相关性分析;用双重免疫荧光染色确定CFB的细胞定位。
评估Cfb基因敲除对糖尿病小鼠肾损伤的影响
通过STZ和高脂饮食诱导Cfb–/–小鼠和WT小鼠糖尿病,检测肾功能、组织病理、炎症因子、ER应激、氧化应激和凋亡指标。
探索Cfb缺失影响糖尿病肾病的潜在分子机制
对小鼠肾皮质进行转录组测序和脂质组学分析,发现神经酰胺合成相关基因和代谢物变化。
在高糖条件下观察CFB敲低对肾小管上皮细胞损伤和神经酰胺合成的影响
HK-2细胞转染siCFB,高糖刺激后检测炎症因子、凋亡、ER应激、氧化应激标志物及神经酰胺水平。
验证CFB敲低的保护作用是否通过降低神经酰胺实现
在siCFB转染的HK-2细胞中给予外源性C2-神经酰胺,观察细胞损伤指标是否恢复。
验证CFB是否通过上调ceramide synthases介导肾小管上皮细胞损伤
HK-2细胞过表达CFB,并用FB1抑制CERS,检测凋亡、ER应激、氧化应激和神经酰胺水平。
阐明CFB调控神经酰胺合成的具体分子机制
检测CFB敲低对NF-κB信号通路的影响,通过Co-IP、ChIP和荧光素酶报告实验验证NF-κB p65调控CERS3转录。
验证CFB对细胞因子分泌、神经酰胺合成和NF-κB信号的作用是否依赖补体旁路途经激活
HK-2细胞同时过表达CFB和敲低C3,检测下游分子变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫组化/免疫荧光 | Bb抗体 | Quidel | A227 |
| CFB抗体 | Abcam | ab192577 | |
| C3a抗体 | Abcam | ab36385 | |
| 免疫组化 | C3c抗体 | Hycult Biotech | HM1078-100UG |
| 免疫组化/免疫荧光 | C5a抗体 | Abcam | ab11878 |
| 免疫组化 | C5aR抗体 | Abcam | ab117579 |
| 免疫组化/免疫荧光 | C5b-9抗体 | Abcam | ab55811 |
| 免疫组化 | 二抗(抗小鼠) | ZSBIO | PV-9005 |
| DAB显色液 | ZSBIO | -- | |
| 免疫荧光 | PECAM-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-53411 |
| 整合素α8抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365798 | |
| Synaptopodin抗体 | R&D Systems | MAB8977 | |
| AQP-1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-25287 | |
| CD28K抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-365360 | |
| CD68抗体 | Abcam | ab955 | |
| AF488标记的驴抗兔IgG | Jackson ImmunoResearch | 711-545-152 | |
| Cy3标记的驴抗小鼠IgG | Jackson ImmunoResearch | 715-165-150 | |
| 细胞免疫荧光 | 神经酰胺抗体 | Millipore Sigma | C8104 |
| AF488标记的山羊抗小鼠IgM μ链 | Abcam | ab150121 | |
| 组织染色 | PAS染色试剂盒 | BASO | BA-4080B |
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | MilliporeSigma | S0130 |
| 柠檬酸钠缓冲液 | Solarbio | -- | |
| 高脂饮食 | Keao Xieli | D12492 | |
| 生化检测 | 小鼠白蛋白ELISA试剂盒 | Bethyl Laboratories | -- |
| 肌酐检测试剂盒 | BioAssay Systems | DICT-500 | |
| 转录组学 | mirVana miRNA提取试剂盒 | Ambion, Thermo Fisher Scientific | -- |
| 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- | |
| TruSeq链式mRNA文库制备试剂盒 | Illumina | -- | |
| HiSeq 2500测序仪 | Illumina | -- | |
| 脂质组学 | Q Exactive Orbitrap质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| UltiMate 3000超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 凋亡检测 | 比色法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche Diagnostics | -- | |
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 青霉素/链霉素 | MilliporeSigma | -- | |
| 最低必需培养基 | Gibco, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| DMEM培养基 | 未明确说明 | -- | |
| 药物处理 | C2-神经酰胺 | MilliporeSigma | -- |
| 伏马菌素B1 | MilliporeSigma | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen, Thermo Fisher Scientific | -- |
| PCR | RNAprep pure RNA提取试剂盒 | Tiangen Biotech | -- |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| SYBR Green预混液 | Applied Biosystems, Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Western blot | GRP78抗体 | Proteintech | 11587-1-AP |
| CHOP抗体 | Proteintech | 15204-1-AP | |
| p-Nrf2抗体 | Abcam | ab76026 | |
| Cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9661 | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242 | |
| p-p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033 | |
| IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 4814 | |
| p-IκBα抗体 | Cell Signaling Technology | 9246 | |
| IKBKB抗体 | Proteintech | 15649-1-AP | |
| Histone H3抗体 | Proteintech | 17168-1-AP | |
| β-tubulin抗体 | Cell Signaling Technology | 2128 | |
| HRP标记的二抗 | Proteintech | SA00001-1和SA00001-2 | |
| ELISA | 人补体C3a ELISA试剂盒 | Qiaoyi Biotechnology | -- |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| SOD检测 | 总超氧化物歧化酶检测试剂盒(WST-8法) | Beyotime Biotechnology | -- |
| Co-IP | Pierce交联磁珠免疫共沉淀试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 抗CFB抗体 | Quidel | -- | |
| 抗IgG抗体 | Proteintech | -- | |
| ChIP | SimpleChIP酶法染色质免疫沉淀试剂盒 | Cell Signaling Technology | -- |
| 启动子活性检测 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
| 细胞转染 | pCMV-CFB质粒 | GenScript | -- |
| LV-CFB慢病毒 | GeneChem | -- | |
| siCFB小干扰RNA | RIBIO | -- | |
| siC3小干扰RNA | RIBIO | -- | |
| siCfb小干扰RNA | RIBIO | -- | |
| 细胞培养 | HK-2细胞系 | ATCC | -- |
| TCMK-1细胞系 | Fuheng Biotechnology | -- | |
| HEK293T细胞系 | Procell Life Science & Technology | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类肾活检样本 | 患者纳入标准(DN诊断依据RPS 2010标准),排除其他肾病;健康对照来源(肾癌患者远离肿瘤的肾组织)及数量 阅读提示:Methods: Human renal biopsies |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6J背景),Cfb敲除小鼠的确认(DNA电泳650bp vs 750bp),糖尿病诱导方案(STZ剂量60 mg/kg,连续5天,高脂饮食(D12492)),分组及样本量 阅读提示:Methods: Animal model; Supplemental Figure 2 |
| 细胞培养与处理 | HK-2细胞培养条件(DMEM/F12, 10% FBS),高糖刺激浓度(30 mmol/L)和时间(24小时),siRNA转染效率(70%-80%) 阅读提示:Methods: Cell culture; Supplemental Figure 4 |
| 神经酰胺回补实验 | C2-神经酰胺浓度(20 μmol/L)及对照(C2-二氢神经酰胺) 阅读提示:Results: CFB knockdown alleviates PTEC damage via downregulating ceramide levels under HG conditions; Methods |
| CERS抑制实验 | FB1浓度(20 μmol/L),CFB过表达效率(2-3倍 mRNA) 阅读提示:Results: Fumonisin B1 can rescue CFB-mediated PTEC damage; Methods |