评估Nevadensin对HCC细胞活力的影响
确定Nevadensin对HCC细胞是否具有细胞毒性作用。
用不同浓度Nevadensin(0、12.5、25、50 µM)处理Hep3B和HepG2细胞24小时,使用CCK-8法检测细胞存活率。
Activating the Hippo pathway by nevadensin overcomes Yap-drived resistance to sorafenib in hepatocellular carcinoma.
包含细胞活力、凋亡、细胞周期、EdU、Western blot、RT-PCR、RNAseq等多个体外实验层级,并明确验证了机制和联合用药效果。
HepG2细胞系 Hep3B细胞系
药物处理浓度:Nevadensin浓度(12.5、25、50 µM)及处理时间24小时,需核对。 索拉非尼浓度:单药筛选浓度(0.25-6 µM),联合用药浓度3 µM,需核对。 YAP降解验证:使用MG132(10 µM)处理,确认蛋白酶体依赖性降解,需核对。 RNAseq处理条件:Hep3B细胞用25 µM nevadensin处理24小时,需核对。 凋亡检测:Annexin V-FITC/PI双染,需核对。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Nevadensin对HCC细胞是否具有细胞毒性作用。
用不同浓度Nevadensin(0、12.5、25、50 µM)处理Hep3B和HepG2细胞24小时,使用CCK-8法检测细胞存活率。
探究Nevadensin抑制细胞活力是否通过诱导凋亡。
使用Hoechst33258染色和流式细胞术检测凋亡;Western blot检测Cleaved Caspase-3、-9和PARP水平。
验证Nevadensin是否通过阻滞细胞周期抑制增殖。
用流式细胞术分析细胞周期分布,EdU染色检测增殖,Western blot检测周期蛋白Cyclin B1, CDK4, CDK6。
探索Nevadensin抑制HCC的分子机制。
Hep3B细胞经25 µM Nevadensin处理24小时,进行RNAseq,分析差异表达基因和KEGG通路。
验证Nevadensin是否激活Hippo通路及其上下游分子。
Western blot检测MST1/2、LATS1/2、Merlin、YAP的磷酸化水平;用蛋白酶体抑制剂MG132处理确认YAP降解。
探究Nevadensin是否能增敏索拉非尼的抗HCC作用。
单独或联合处理Nevadensin(12.5 µM)和索拉非尼(3 µM),检测细胞活力、凋亡和YAP靶基因表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 试剂 | 新穿心莲内酯 | Nature Standard | 3807 |
| MG132 | MedChem Express | HY-13259 | |
| 索拉非尼 | MedChem Express | HY-10201 | |
| 抗体 | YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 14074T |
| 磷酸化YAP抗体 | Cell Signaling Technology | 13619T | |
| MST1抗体 | Cell Signaling Technology | 3682T | |
| 磷酸化MST1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 49332S | |
| LATS1抗体 | Cell Signaling Technology | 3477T | |
| 磷酸化LATS1抗体 | Cell Signaling Technology | 8654S | |
| Merlin抗体 | Cell Signaling Technology | 12888T | |
| 磷酸化Merlin抗体 | Cell Signaling Technology | 13281S | |
| Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9611S | |
| Cleaved Caspase-9抗体 | Cell Signaling Technology | 20750S | |
| Cleaved PARP抗体 | Cell Signaling Technology | 5625S | |
| CDK6抗体 | Cell Signaling Technology | 13331 | |
| 抗兔IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 抗鼠IgG抗体 | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| CDK4抗体 | proteintech | 11026-1-AP | |
| Cyclin B1抗体 | proteintech | 28603-1-AP | |
| β-actin抗体 | ZSGB-Bio | TA-09 | |
| 细胞周期检测 | DNA含量定量检测试剂盒(细胞周期) | Solarbio | CA1510 |
| 凋亡检测 | Hoechst 33258 | Solarbio | IH0060 |
| 细胞活力检测 | CCK-8细胞增殖细胞毒性检测试剂盒 | Solarbio | CA1210 |
| RT-PCR | PrimeScript™ RT试剂盒(带gDNA Eraser) | TaKaRa | -- |
| FastStart通用SYBR Green Master (ROX) | Roche | 04710436001 | |
| EdU检测 | Cell-Light EdU Apollo 488体外试剂盒 | RiboBio | C10310-1 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(HepG2、Hep3B)来源、培养基(DMEM+10% FBS)、培养条件(37°C,5% CO2)。 阅读提示:Materials and methods, Cell culture |
| 药物处理 | Nevadensin处理浓度(12.5、25、50 µM)和时间(24小时);索拉非尼浓度(单药筛选0.25-6 µM,联合用药3 µM);MG132浓度(10 µM)和时间。 阅读提示:Results sections and figure legends (Fig. 1B, 5B, 4F) |
| 细胞活力检测 | 种子密度:5×10^3 cells/well;CCK-8孵育时间:2小时;检测波长:A450。 阅读提示:Materials and methods, Cell viability assays |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色;Hoechst 33258染色(1:100稀释,37°C 30分钟)。 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry and Hoechst 33258 staining assay |
| 细胞周期检测 | 细胞固定(70%冰乙醇,1小时)、PI染色;流式分析。 阅读提示:Materials and methods, Flow cytometry |
| 蛋白质印迹 | 蛋白上样量30 µg;一抗、二抗及稀释比例需根据抗体说明书;ECL显色。 阅读提示:Materials and methods, Western blot analysis |
| RT-PCR | 引物序列(GAPDH, CTGF, ITGAV, ITGB5, SMAD7);反应条件(95°C 5 min; 95°C 15s, 60°C 60s, 40循环);内参基因GAPDH。 阅读提示:Materials and methods, Real-time PCR |
| RNAseq | 细胞处理(25 µM Nevadensin, 24 h);测序平台(BGI Genomics);数据分析参考基因组(hg19, mm10)。 阅读提示:Materials and methods, RNAseq and data analysis |