评估糖尿病视网膜病变中O-GlcNAc修饰水平
确定O-GlcNAc修饰是否在DR中升高及其细胞定位。
通过ELISA检测PDR患者玻璃体液中UDP-GlcNAc水平;通过western blot和免疫荧光检测STZ和OIR小鼠视网膜中O-GlcNAc修饰的蛋白水平。
Protein O-GlcNAcylation coupled to Hippo signaling drives vascular dysfunction in diabetic retinopathy.
研究包含细胞实验、动物模型(STZ和OIR)、患者样本和组学分析,并进行了基因敲除和功能验证。
人类视网膜毛细血管内皮细胞(HRCECs) 人类视网膜微血管内皮细胞(HRMECs) 小鼠STZ诱导的糖尿病视网膜病变模型 小鼠氧诱导视网膜病变模型
STZ模型:雄性成年(8周龄)小鼠,连续5天腹腔注射链脲佐菌素(50 mg/kg) OIR模型:P7小鼠暴露于75%氧气5天,P12回到室内空气,P17分析 细胞实验:HRCECs(第1-6代)在含5% FBS、1%生长补充剂和1%抗生素的内皮细胞培养基中培养 高糖处理:25 mM葡萄糖,低糖对照5.5 mM 抑制剂处理:PUGNAc(25 μM)或OSMI-1(15 μM)处理24小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定O-GlcNAc修饰是否在DR中升高及其细胞定位。
通过ELISA检测PDR患者玻璃体液中UDP-GlcNAc水平;通过western blot和免疫荧光检测STZ和OIR小鼠视网膜中O-GlcNAc修饰的蛋白水平。
确定增加O-GlcNAc修饰是否促进血管功能障碍。
使用PUGNAc(OGA抑制剂)处理HRCECs和HRMECs,进行BrdU掺入、主动脉环出芽、TER等实验;利用siRNA敲低OGT验证。
确定内皮细胞中Ogt缺失是否减轻糖尿病诱导的血管损伤。
使用OgtΔEC和OgtiΔEC小鼠,通过STZ和OIR模型诱导DR,分析血管渗漏、细胞覆盖率、无细胞毛细血管等。
确定YAP/TAZ是否被O-GlcNAc修饰以及修饰位点。
通过质谱分析鉴定YAP的O-GlcNAc位点;构建突变体验证位点对O-GlcNAc修饰和下游信号的影响。
确定O-GlcNAc修饰是否通过影响YAP S397磷酸化来调节其稳定性和活性。
通过western blot检测pYAP-S397水平,通过CHX追踪实验分析YAP稳定性,通过Co-IP检测YAP与β-TRCP的相互作用。
确定内皮细胞中YAP/TAZ敲除是否减轻DR病理。
使用Yap/TaziΔEC小鼠,在STZ和OIR模型中分析血管渗漏、细胞覆盖率、无细胞毛细血管、新生血管面积等。
确定YAP的T383和S397位点在O-GlcNAc介导的DR病理中的功能必要性。
使用AAV-BR1递送YAP-WT、YAP-T383A、YAP-S397A到内皮细胞,在OIR和STZ模型中评估血管新生和细胞覆盖率。
确定OSMI-1和Super-TDU是否减轻DR血管病变。
在STZ和OIR模型中给予OSMI-1或Super-TDU(单独或EXOSuper-TDU),评估血管渗漏、新生血管和细胞覆盖率。
确定YAP/TAZ是否调节HBP通路和O-GlcNAc修饰。
通过RNA-seq分析siYAP/TAZ处理的HRCECs的转录组,通过western blot检测O-GlcNAc水平,通过qRT-PCR验证HBP酶的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 内皮细胞培养基 | ScienCell | 1001 |
| 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | HyClone | SH30243.01 | |
| 药物处理 | PUGNAc | Sigma Aldrich | A7229 |
| OSMI-1 | Sigma Aldrich | SML1621 | |
| 免疫沉淀 | 抗Flag M2磁珠 | Sigma-Aldrich | M8823 |
| 免疫印迹 | 抗O-GlcNAc抗体 | Abcam | 2739 |
| 抗pYAP-S397抗体 | Cell Signaling Technology | 13619 | |
| 抗Flag抗体 | Proteintech | 66008-4ig | |
| 抗OGT抗体 | Ptm-biolab | PTM-5497 | |
| 抗OGA抗体 | Cell Signaling Technology | 60406 | |
| 抗GFPT1抗体 | Abcam | 125069 | |
| 抗β-TRCP抗体 | Cell Signaling Technology | 4394 | |
| 抗泛素抗体 | Cell Signaling Technology | 3936 | |
| 抗β-Actin抗体 | Abclonel | AC004 | |
| 免疫荧光 | 抗CD31抗体 | BD Biosciences | 557355 |
| 抗YAP/TAZ抗体 | Cell Signaling Technology | 8418 | |
| Alexa Fluor 594偶联的异凝集素GS-IB4 | Invitrogen | I21413 | |
| 抗Desmin抗体 | Abcam | 15200 | |
| 抗TER119抗体 | R&D | MAB1125 | |
| 血管渗漏实验 | FITC偶联葡聚糖 | Sigma-Aldrich | FD70S |
| Alexa Fluor 555尸胺 | Invitrogen | A30677 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | 13778150 |
| 靶向YAP/TAZ的siRNA | Dharmacon Research | M-012200-00-0005 | |
| 动物实验 | 链脲佐菌素 | Sigma Aldrich | S0130 |
| 组织处理 | Trilogy缓冲液 | Sigma-Aldrich | 920P-06 |
| 免疫荧光 | 荆豆凝集素I | Vector Labs | FL-1061-2 |
| 含DAPI的Vectashield封片剂 | Vector Laboratories | H-1200 | |
| 组织处理 | OCT包埋剂 | Sakura | -- |
| 细胞实验 | EdU | US EVERBRIGHT INC. | E6032 |
| YF® 488 Click-iT EdU染色试剂盒 | US EVERBRIGHT INC. | C6033 | |
| DAPI | Invitrogen | D1306 | |
| 主动脉环实验 | Opti-MEM培养基 | Thermo Scientific | 31985070 |
| 基质胶 | Corning | 354230 | |
| 脉络膜出芽实验 | M199培养基 | Corning | 11150067 |
| 鬼笔环肽 | Solarbio | CA1610 | |
| 纤维蛋白凝胶珠出芽实验 | Cytodex 3微载体珠 | GE Healthcare | -- |
| 纤维蛋白原 | Calbiochem | -- | |
| 凝血酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 抑肽酶 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 脑内皮细胞分离 | 胶原酶/分散酶 | Roche | 10269638001 |
| 脱氧核糖核酸酶I | Roche | 4716728001 | |
| 髓鞘去除磁珠 | Miltenyi | 130-096-733 | |
| CD31磁珠 | Miltenyi | 130-097-418 | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | SIGMA | 101254514 |
| 逆转录 | mRNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K1622 |
| qRT-PCR | SYBR Green预混液 | TRANS | AQ601 |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | -- | -- |
| 4-羟基他莫昔芬 | -- | -- | |
| 体外O-GlcNAc修饰实验 | UDP-GlcNAc | -- | -- |
| 蛋白质纯化 | 3×Flag肽 | Absin | -- |
| 免疫组织化学 | Super-TDU肽 | ChinaPeptides | -- |
| Super-TDU-CP05肽 | ChinaPeptides | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞类型(HRCECs、HRMECs),培养基(ScienCell ECM),药物浓度(PUGNAc 25 μM,OSMI-1 15 μM),高糖处理(25 mM葡萄糖),缺氧(1% O2) 阅读提示:Methods - Cell culture, Results - 图1和图2 |
| STZ小鼠模型 | 小鼠品系(C57BL/6J,雄性,8周龄),STZ剂量(50 mg/kg/天,连续5天),给药途径(腹腔注射),糖尿病持续时间 阅读提示:Methods - Streptozotocin mouse model |
| OIR模型 | 小鼠品系(C57BL/6J),暴露条件(75% O2,P7-P12),返回室内空气后时间点(P17),分析时间 阅读提示:Methods - Oxygen-induced retinopathy in mice |
| 内皮特异性基因敲除小鼠 | 基因型(Ogtfl/fl, Cdh5-Cre,Ogtfl/fl, Cdh5-(PAC)-CreERT2,Yapfl/fl;Tazfl/fl, Cdh5-(PAC)-CreERT2),Cre诱导方法(他莫昔芬或4-OHT),剂量和时间 阅读提示:Methods - Mice |
| 血管通透性分析 | 示踪剂类型(FITC-dextran 70 kDa,Alexa Fluor 555 cadaverine),注射途径(心内/静脉),浓度和体积,循环时间 阅读提示:Methods - Analyses of vascular leakage |
| 蛋白免疫印迹和免疫沉淀 | 抗体(anti-O-GlcNAc, anti-pYAP-S397等)浓度,裂解缓冲液成分,免疫沉淀条件(抗Flag M2磁珠) 阅读提示:Methods - Immunoprecipitation and immunoblotting |
| RNA-seq | 细胞处理(PUGNAc 25 μM或siYAP/TAZ),葡萄糖浓度(25 mM),处理时间,测序平台和分析方法 阅读提示:Methods - RNA sequencing and data analyses |