细胞培养与谷氨酰胺剥夺
验证谷氨酰胺缺乏对膀胱癌细胞PD-L1表达的影响
将T24和TCCSUP细胞培养在低谷氨酰胺或无谷氨酰胺培养基中,检测PD-L1的mRNA和蛋白水平变化。
Immunosuppression Induced by Glutamine Deprivation Occurs via Activating PD-L1 Transcription in Bladder Cancer.
包括体外细胞实验(T24、TCCSUP)、体内异种移植模型、ChIP、Western blot、qPCR、免疫荧光、T细胞共培养实验等多种验证。
T24膀胱癌细胞系 TCCSUP膀胱癌细胞系 BALB/c裸鼠异种移植模型 CD3+ T细胞共培养体系
T24和TCCSUP细胞在低谷氨酰胺或谷氨酰胺缺乏培养基(50、25、0 mg/L;对照:300 mg/L)中培养 谷氨酰胺剥夺时间点:T24细胞3-48小时,TCCSUP细胞3-72小时 信号通路抑制剂浓度:AZD9291(4 μM)、U0126(T24:8 μM,TCCSUP:20 μM)、SCH772984(T24:1 μM,TCCSUP:0.25 μM)、SP600125(20 μM) 体内异种移植模型:T24细胞(7×10^6)注射于BALB/c裸鼠背部,瘤内注射PBS或谷氨酰胺(1.5 g/L,20 μl/部位,每3天一次,共6次) T细胞共培养:T24/TCCSUP细胞与CD3+ T细胞共培养15小时,PMA/Iono刺激5小时,ELISA检测IFN-γ
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证谷氨酰胺缺乏对膀胱癌细胞PD-L1表达的影响
将T24和TCCSUP细胞培养在低谷氨酰胺或无谷氨酰胺培养基中,检测PD-L1的mRNA和蛋白水平变化。
探究谷氨酰胺缺乏是否激活EGFR/MEK/ERK/c-Jun信号通路
通过Western blot和免疫荧光检测谷氨酰胺缺乏后pEGFR、pMEK、pERK、pc-Jun的蛋白水平。
验证c-Jun是否直接结合PD-L1增强子区域以调控PD-L1转录
ChIP实验检测谷氨酰胺缺乏条件下c-Jun与PD-L1增强子的结合富集情况,并使用MEK/ERK/c-Jun抑制剂处理后观察富集变化。
验证抑制EGFR/MEK/ERK/c-Jun通路是否逆转PD-L1上调
使用EGFR抑制剂AZD9291、MEK抑制剂U0126、ERK抑制剂SCH772984、c-Jun抑制剂SP600125处理T24和TCCSUP细胞,检测通路蛋白和PD-L1水平。
验证补充谷氨酰胺能否逆转谷氨酰胺缺乏引起的PD-L1上调及通路激活
谷氨酰胺缺乏处理后再更换为正常培养基,检测PD-L1和通路蛋白水平。
验证体内补充谷氨酰胺对肿瘤组织中PD-L1表达及通路激活的影响
BALB/c裸鼠皮下注射T24细胞建立移植瘤模型,瘤内注射谷氨酰胺或PBS,检测PD-L1表达和通路激活。
验证谷氨酰胺缺乏诱导的PD-L1上调对T细胞功能的影响
T24和TCCSUP细胞在谷氨酰胺缺乏条件下预处理,并与CD3+ T细胞共培养,检测IFN-γ产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | T24细胞系 | Typical Culture Preservation Commission Cell Bank (Shanghai, China) | RRID: |
| TCCSUP细胞系 | Procell (Wuhan, China) | RRID: | |
| 抑制剂处理 | AZD9291 | MCE | HY-15772 |
| U0126 | MCE | HY-12031 | |
| SCH772984 | MCE | HY-50846 | |
| SP600125 | MCE | HY-12041 | |
| 茴香霉素 | MCE | HY-18982 | |
| 重组人EGF | Novus | -- | |
| Western blot | BCA试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 增强化学发光试剂盒 | Millipore | -- | |
| HRP标记二抗 | JacksonImmunoResearch | -- | |
| 抗PD-L1抗体 | Cell Signaling Technology | 13684 | |
| 磷酸化EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 3777 | |
| EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 4267 | |
| 磷酸化MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 9154 | |
| MEK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 8727 | |
| 磷酸化ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 磷酸化c-Jun抗体 | Cell Signaling Technology | 3270 | |
| c-Jun抗体 | Cell Signaling Technology | 9165 | |
| GAPDH抗体 | Sigma-Aldrich | G9545 | |
| 免疫荧光 | Cy3偶联二抗 | Jackson ImmunoResearch | -- |
| DAPI | -- | -- | |
| 荧光显微镜 | Olympus | IX71 | |
| 共聚焦激光扫描显微镜 | Leica | SPE | |
| 冷冻切片机 | SLEE International, Inc. | -- | |
| qPCR | TRIzol | Takara | 9109 |
| PrimeScript反转录试剂盒 | Takara | RR037A | |
| SYBR Green PCR预混液 | Takara | -- | |
| Roche LightCycler 480II实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| ChIP | Dynal蛋白G磁珠 | Thermo | 10003D |
| c-Jun (60A8)兔单克隆抗体 | CST | 9165 | |
| 同型对照兔单克隆抗体IgG | CST | 3900 | |
| T细胞功能 | 人IFN-γ ELISA试剂盒 | Elabscience | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与谷氨酰胺剥夺 | 细胞系(T24和TCCSUP)的来源、培养条件(37°C, 5% CO2)、谷氨酰胺浓度(低、无、对照300 mg/L)、处理时间(T24 24小时,TCCSUP 15小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture and Glutamine Deprivation; Figure 1 |
| 信号通路抑制剂处理 | 抑制剂名称、浓度(AZD9291 4 μM,U0126 T24 8 μM/TCCSUP 20 μM,SCH772984 T24 1 μM/TCCSUP 0.25 μM,SP600125 20 μM)、处理时间(T24 24小时,TCCSUP 15小时) 阅读提示:Materials and Methods: Assays of Inhibitor Treatment; Figures 3-5 |
| 谷氨酰胺恢复实验 | 恢复时间(T24:24小时剥夺后恢复24小时;TCCSUP:15小时剥夺后恢复24小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture and Glutamine Deprivation; Figure 7A,B |
| 体内异种移植模型 | 动物品系(BALB/c裸鼠,4-5周龄)、细胞注射量(7×10^6)、瘤内注射谷氨酰胺浓度(1.5 g/L)、注射体积(20 μl/部位)、频率(每3天一次,共6次) 阅读提示:Materials and Methods: Glutamine Supplementation Assay in an in vivo Xenograft Model; Figure 7C-E |
| T细胞功能检测 | 共培养细胞数量(T24/TCCSUP 5×10^5,T细胞3×10^5)、处理时间(U0126处理24小时,共培养15小时)、刺激条件(PMA/Iono 5小时)、检测IFN-γ的方法(ELISA) 阅读提示:Materials and Methods: IFN-γ Analysis of T Cells; Figure 8 |
| Western blot | 一抗稀释度未明确、二抗稀释度1:10,000,内参GAPDH,蛋白上样量未明确 阅读提示:Materials and Methods: Western Blot Analysis |