检测GB1e在乳腺癌细胞和组织中的表达
评估GB1e在乳腺癌细胞系和组织中的表达水平及其与致瘤性的关联。
通过RT-PCR和qRT-PCR检测GB1e mRNA水平,通过免疫印迹和免疫组化检测GB1e蛋白水平在人乳腺癌细胞系、乳腺癌组织及癌旁组织中的表达。
GABAB1e promotes the malignancy of human cancer cells by targeting the tyrosine phosphatase PTPN12.
包含细胞系体外功能实验(增殖、克隆、球体、迁移、侵袭)和体内动物模型(皮下移植瘤和尾静脉转移模型),并进行了机制验证(免疫共沉淀、磷酸化位点突变、下游信号通路检测)。
人乳腺癌细胞系(MCF7, T-47D, MDA-MB-231, BT-549) BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型 BALB/c裸鼠尾静脉转移模型 人乳腺癌组织样本
细胞系:MCF7, T-47D(低致瘤性)用于过表达GB1e;MDA-MB-231, BT-549(高致瘤性)用于敲低GB1e。 GB1e敲低采用两种shRNA(sh-GB1 #1和#2),并进行了回补实验验证。 体内实验使用的细胞数量和注射途径:皮下注射1×10^6细胞,尾静脉注射2×10^5细胞。 GB1e磷酸化位点Y230和Y404突变为苯丙氨酸(Y230F, Y404F)对功能的影响。 EGFR和Akt磷酸化水平的变化(4G10免疫沉淀和pAkt检测)。
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估GB1e在乳腺癌细胞系和组织中的表达水平及其与致瘤性的关联。
通过RT-PCR和qRT-PCR检测GB1e mRNA水平,通过免疫印迹和免疫组化检测GB1e蛋白水平在人乳腺癌细胞系、乳腺癌组织及癌旁组织中的表达。
确定GB1e在细胞内的分布及其是否经历分泌、糖基化和蛋白降解。
通过ELISA、免疫印迹分析GB1e在细胞表面和细胞质中的分布,检测条件培养基中的分泌形式;用衣霉素和布雷菲德菌素A处理细胞评估N-糖基化;通过微体分离和蛋白质输出实验研究GB1e从内质网到胞质的逆向转运;用MG132处理细胞观察蛋白酶体降解途径。
验证GB1e在体外对乳腺癌细胞增殖、克隆形成、球体形成、迁移和侵袭的影响。
在MCF7和T-47D细胞中过表达GB1e,在MDA-MB-231和BT-549细胞中敲低GB1e,然后进行CCK-8增殖实验、克隆形成实验、球体形成实验和Transwell迁移/侵袭实验。
在动物模型中评估GB1e对乳腺癌细胞致瘤性和转移能力的影响。
将对照或GB1e敲低的MDA-MB-231细胞皮下注射或尾静脉注射到裸鼠中,测量肿瘤体积和重量,通过H&E染色和免疫组化分析肿瘤增殖标志物,并评估实验性肺转移。
阐明GB1e促癌的分子机制,包括其与PTPN12的结合及其对EGFR信号的影响。
通过质谱鉴定GB1e相互作用蛋白,用免疫共沉淀验证GB1e与PTPN12的结合,评估GB1e对EGFR和PTPN12相互作用的影响,并检测EGFR、Akt的磷酸化水平以及下游信号通路。
确定GB1e上对PTPN12相互作用和致癌功能至关重要的酪氨酸磷酸化位点。
通过生物信息学分析预测候选磷酸化位点,构建Y228F、Y230F、Y234F、Y404F和Y230F/Y404F突变体,检测突变对GB1e磷酸化、PTPN12结合、EGFR信号以及细胞克隆形成的影响。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫印迹 | 抗GB1抗体 | Abcam | ab55051 |
| 抗Flag抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-51590 | |
| 抗PTPN12抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-65229 | |
| 免疫组织化学 | 抗Ki-67抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-23900 |
| 免疫印迹 | 抗EGFR抗体 | Cell Signaling Technology | 2085 |
| 抗pAkt (Ser473)抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗总Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗pERK1/2 (T202/Y204)抗体 | Cell Signaling Technology | 4370 | |
| 抗总ERK1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695 | |
| 抗pSTAT3 (Tyr705)抗体 | Cell Signaling Technology | 9145 | |
| 抗总STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 4904 | |
| 抗钙联蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 2679 | |
| HRP偶联抗Flag抗体 | Cell Signaling Technology | 86861 | |
| HRP偶联抗兔IgG | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| HRP偶联抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 7076 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488偶联抗小鼠IgG | Cell Signaling Technology | 4408 |
| 免疫印迹 | 抗β-肌动蛋白抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 |
| 免疫共沉淀 | 磷酸酪氨酸抗体,克隆4G10 | Sigma-Aldrich | 05-321 |
| 药物处理 | 衣霉素 | YEASEN | 60251ES03 |
| 布雷菲德菌素A | Beyotime | S1536 | |
| 巴氯芬 | R&D Systems | 0796 | |
| CGP54626 | R&D Systems | 1088 | |
| 球体形成 | B-27补充剂(50x)无血清 | ThermoFisher Scientific | 17504044 |
| 人EGF重组蛋白 | ThermoFisher Scientific | PHG0311 | |
| 人bFGF重组蛋白 | ThermoFisher Scientific | PHG0261 | |
| 侵袭实验 | BD基质胶基质(生长因子减少) | BD Biosciences | 365234 |
| RT-PCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | RR047A |
| qRT-PCR | SYBR Green PCR预混液 | Applied Biosystems | 4309155 |
| 定点突变 | QuikChange定点突变试剂盒 | Agilent Technologies | 200521 |
| 微体分离 | 微体分离试剂盒 | Biovision | K249-50 |
| 细胞转染 | Lipofectamine™ 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668019 |
| siRNA转染 | PepMute™ siRNA转染试剂 | SignaGen Laboratories | SL100566 |
| 免疫共沉淀 | 4G10偶联琼脂糖珠 | Sigma-Aldrich | 16-101 |
| EGFR抗体偶联琼脂糖珠 | Cell Signaling Technology | 8083 | |
| 蛋白A琼脂糖珠 | Millipore | 16-125 | |
| 蛋白G琼脂糖珠 | Millipore | 16-266 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC)和培养条件(培养基、血清浓度、抗生素) 阅读提示:STAR★Methods中Cell lines部分 |
| GB1e过表达和敲低 | 转染试剂和转染方法(Lipofectamine 2000, PepMute)、筛选药物(G418, 嘌呤霉素)及浓度 阅读提示:STAR★Methods中Cell transfection部分 |
| 体外功能实验 | 细胞接种密度、处理时间、检测时间点(CCK-8实验24/48/72/96小时) 阅读提示:STAR★Methods中Proliferation, colony and spheroid formation部分 |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、周龄(3-4周)、性别(雌性)、细胞注射数量(皮下1×10^6,尾静脉2×10^5) 阅读提示:STAR★Methods中Tumor xenografts and experimental metastasis部分 |
| 免疫共沉淀 | 裂解液成分、抗体用量(anti-GB1、anti-Flag、anti-PTPN12、4G10)、 beads类型和孵育时间 阅读提示:STAR★Methods中Immunoprecipitation部分 |