建立UC-CRC小鼠模型
诱导溃疡性结肠炎相关性结直肠癌,用于研究Pou3f1的作用。
使用6-8周龄雄性C57BL/6小鼠,腹腔注射AOM,随后进行3个周期的DSS饮水处理,每个周期包含7天3% DSS和14天正常饮水。
Pou3f1 mediates the effect of Nfatc3 on ulcerative colitis-associated colorectal cancer by regulating inflammation.
包含AOM/DSS诱导的UC-CRC小鼠模型、LPS处理的巨噬细胞体外模型、Nfatc3与Pou3f1的ChIP和荧光素酶报告基因验证,以及体内外功能验证。
AOM/DSS诱导的UC-CRC小鼠模型 LPS处理的RAW264.7细胞 LPS处理的小鼠骨髓源性巨噬细胞(BMDMs)
AOM剂量:10 mg/kg,腹腔注射 DSS浓度:3%,饮水给予,连续7天,重复3个周期 AAV-shPou3f1或AAV-shNC通过结肠灌肠给药,AOM处理前2周 体外LPS处理浓度:100 ng/ml,处理3小时 小鼠品系:6-8周龄雄性C57BL/6小鼠
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
诱导溃疡性结肠炎相关性结直肠癌,用于研究Pou3f1的作用。
使用6-8周龄雄性C57BL/6小鼠,腹腔注射AOM,随后进行3个周期的DSS饮水处理,每个周期包含7天3% DSS和14天正常饮水。
验证Nfatc3是否直接结合Pou3f1启动子并调控其表达。
在结肠组织和RAW264.7细胞中进行ChIP实验,使用Nfatc3抗体免疫沉淀染色质,通过PCR/qPCR检测Pou3f1启动子富集;使用荧光素酶报告基因实验验证Nfatc3对Pou3f1启动子转录活性的影响,包括野生型和突变型启动子片段。
研究Pou3f1在LPS诱导的巨噬细胞炎症反应中的作用。
使用LPS处理RAW264.7细胞和BMDMs,检测Pou3f1表达变化;通过腺病毒介导的Pou3f1敲低(Ad-shPou3f1)和Nfatc3过表达(Ad-Nfatc3),检测炎症因子(IL-1β, IL-6, TNF-α, MCP-1)mRNA水平、iNOS和COX-2蛋白水平以及ROS水平。
验证Pou3f1敲低对UC-CRC小鼠疾病进展的影响。
通过结肠灌肠给予AAV-shPou3f1或AAV-shNC,检测小鼠体重、存活率、疾病活动指数、结肠长度、肿瘤数量、组织学损伤、炎症指标(ELISA、qPCR、MPO活性、ROS)、细胞增殖(PCNA)和凋亡(TUNEL)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 氧化偶氮甲烷 | Sigma | A5486 |
| 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Servicebio | G4510 |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | L3000-008 | |
| 细胞处理 | 脂多糖 | Solarbio | L8880 |
| ChIP | 组织ChIP试剂盒 | Wanleibio | WLA122 |
| 细胞ChIP试剂盒 | Wanleibio | WLA106a | |
| Nfatc3抗体 | Proteintech | 18222-1-AP | |
| 荧光素酶报告基因实验 | 荧光素酶报告基因检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | KGAF040 |
| ROS检测 | ROS检测试剂盒 | Beyotime | S0033 |
| DCFH-DA溶液 | JianCheng | E004 | |
| ELISA | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| IL-1β ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK201B | |
| MCP-1 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK287 | |
| PGE2 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK8103 | |
| MPO检测 | MPO活性检测试剂盒 | JianCheng | A044 |
| 组织染色 | 伊红 | Sangon | A600190 |
| 免疫组织化学 | COX-2抗体 | ABclonal | A1253 |
| HRP标记的山羊抗兔二抗 | ThermoFisher Scientific | 31460 | |
| 免疫荧光 | PCNA抗体 | ABclonal | A0264 |
| F4/80抗体 | Santa Cruz | sc-377009 | |
| FITC标记的山羊抗兔IgG抗体 | Beyotime | A0562 | |
| Cy3标记的山羊抗小鼠IgG抗体 | Beyotime | A0521 | |
| TUNEL | 原位细胞死亡检测试剂盒 | Roche | 11684795910 |
| 免疫荧光 | DAPI染液 | Aladdin | D106471 |
| 显微镜 | 奥林巴斯显微镜 | Olympus | BX53 |
| RNA提取 | TRIpure试剂 | BioTeke | RP1001 |
| qPCR | BeyoRT II M-MLV逆转录酶 | Beyotime | D7160L |
| SYBR Green试剂 | Solarbio | SY1020 | |
| Exicycler 96实时荧光定量PCR仪 | Bioneer | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Solarbio | R0010 |
| PVDF膜 | Millipore | IPVH00010 | |
| Pou3f1抗体 | ABclonal | A19330 | |
| iNOS抗体 | ABclonal | A0312 | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 山羊抗兔IgG/HRP抗体 | Solarbio | SE134 | |
| 山羊抗小鼠IgG/HRP抗体 | Solarbio | SE131 | |
| ECL Western blot底物 | Solarbio | PE0010 | |
| 流式细胞术 | NovoCyte流式细胞仪 | AceaBio | -- |
| ROS检测 | 多功能酶标仪 | Biotek | Synergy |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| UC-CRC小鼠模型建立 | 小鼠品系、性别、年龄、体重;AOM剂量、给药途径、DSS浓度、给药周期 阅读提示:Methods: Animal models; Figure 1A |
| Pou3f1敲低实验 | AAV血清型、注射途径、给药时间、剂量 阅读提示:Methods: Animal models; Figure 2A |
| 体外巨噬细胞处理 | 细胞系、培养条件、LPS浓度、处理时间、感染复数、转染试剂 阅读提示:Methods: Cell treatment |
| ChIP实验 | 抗体浓度、细胞交联条件、染色质片段化、PCR引物序列 阅读提示:Methods: Chromatin immunoprecipitation; Figure legends 1G-H, 2B-D |
| 荧光素酶报告基因实验 | 报告基因载体、启动子片段、结合位点突变、共转染质粒、检测时间 阅读提示:Methods: Luciferase reporter assay; Figure 2E |