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-20℃及4℃
- 规格:
20T
万类生物试剂促销:试剂盒8折优惠,细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)-20T 原价2135元,现价1708元。
产品名称:细胞染色质免疫共沉淀(ChIP)试剂盒
产品概述:染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)作为最佳的研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法,它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,通过对目的片断的纯化与检测,从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。
该产品被引用文献(仅展示部分):
1、 Pan M; Luo M; Liu L, et al., EGR1 suppresses HCC growth and aerobic glycolysis by transcriptionally downregulating PFKL. J Exp Clin Cancer Res 2024, 43 (1), 35.
IF: 7.73 Year: 2020 PMID:33305374
3、 Zhang X; Liu L; Liu X, et al., Chidamide suppresses adipogenic differentiation of bone marrow derived mesenchymal stem cells via increasing REEP2 expression. iScience 2023, 26 (3), 106221.
操作流程:
2. 终止交联:加1M 甘氨酸1.26ml,使其终浓度为0.125M,室温培养5min。
3. 吸尽培养基,用预冷的PBS洗两次后,加适量蛋白酶抑制剂(2ml PBS中加入5µl 蛋白酶抑制剂),用细胞刮收集细胞,2000rpm,4℃离心5min。
4. 弃上清,加入1ml Buffer A,冰上放置10min,3000-5000rpm离心5min。
5. 弃上清,加入400µl Buffer B(每100µl Buffer B中含有106细胞)重悬后加入5µl 蛋白酶抑制剂。
6. 超声破碎。一般来说,300W超声10s,间隔30s,12次。12000rpm,4℃离心20min。取20µl上清电泳检测,抹带集中在500-1000bp左右即可。
7. 样品分成三组,每组100µl,A:实验组; B:阳性对照组;C:阴性对照组,剩余样品可放置-80℃保存。
8. 在三组样品中分别加入900µl Chip Diluiton Buffer。
9. 准备ProteinA beads,用1ml PBS 清洗三次(3000rpm离心1min)后保存备用,此步可提前准备。
10. 三组样品中各加入60 µl ProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
11. 混匀后4℃静置10min,3000rpm离心1min。
12. 取上清,每组样品取20µl 进行 Input实验,-20℃保存。
13. 实验组中加入1-10µg 抗体;阳性对照组加入1µg RNA Polymerase II抗体;阴性对照组加入1µg 正常血清IgG,4℃颠倒混匀过夜。
14. 三组样品中再加入60µl ProteinA beads, 4℃颠倒混匀1-2h。
15. 洗涤ProteinA beads 依次用下列溶液清洗沉淀复合物。清洗步骤为:加入1ml 预冷溶液,在4℃混匀10min,3000rpm离心1min,除去上清。
a. Low Salt Wash Buffer,1次。
b. High Salt Wash Buffer,1次。
c. LiCl Wash Buffer,1次。
d. TE Buffer,2次。
16. 每管加入100µl Elution Buffer(100µl 10%SDS+100µl 1M NaHCO3+800µl ddH2O),室温颠转10min后3000rpm离心1min,收集上清。重复洗脱1次,终体积200µl。
17. 取出Input实验样品,室温融化后加入180µl Elution Buffer。
18. 解交联。每管中加入8µl 5M NaCl,混匀,65℃解交联过夜。
19. 解交联结束后,每管加入1µl RNaseA,37℃孵育1h。
20. 每管加入4µl 0.5M EDTA,8µl 1M Tris-HCl(PH=6.5),1µl Proteinase K,45℃孵育2h。
21. DNA片段回收(WLA092a PCR纯化试剂盒)。
22. 对照品的PCR。
23. 取出每种PCR反应物10μl,采用4%琼脂糖凝胶电泳(采用100bp DNA marker)进行分析。
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文献和实验1、Zhang X; Liu L; Liu X, et al., Chidamide suppresses adipogenic differentiation of bone marrow derived mesenchymal stem cells via increasing REEP2 expression. iScience 2023, 26 (3), 106221.
PubMed: 36879811
2、Zhang W; Wang Q; Xing X, et al., The antagonistic effects and mechanisms of microRNA-26a action in hypertensive vascular remodelling. Br J Pharmacol 2021, 178 (5), 1037-1054.
PubMed: 33305374
了编码 HA-BDCA-2 载体的小鼠 B 前体细胞后,提取的蛋白使用 SDS-PAGE 的方法进行检测。 蛋白免疫共沉淀(co-IP)与染色质免疫共沉淀(ChIP) μMACS Protein A/G MicroBeads 专为蛋白质免疫共沉淀分析而开发,免疫复合物 30 分钟即可形成并得到磁性分离。 在强磁场的分离柱中进行润洗,可保证背景充分去除,即便是弱结合的蛋白复合物依然可得到充分分离。传统免疫共沉淀工作流程需要抗体孵育过夜,相比之下 MACS Techology 可令实验时间缩短
,将 CUT&RUN 技术升级到单细胞水平,并应用于早期胚胎研究。 2019 年 Henikoff 等发明 CUT&Tag ,使用带有接头的 Tn5 转座酶替代 MNase ,简化实验操作,将细胞量从 104 级别降到 60 个细胞甚至单细胞。 2.蛋白质-DNA 互作技术概述 ✦染色质免疫共沉淀(ChIP): ChIP 是全基因组范围内检测蛋白-DNA 互作的标准方法,该技术由 Orlando 等于 1997 年创立[1]。 图 1:ChIP 基本原理图[1] ✦ ChIP
染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种用于研究目的蛋白在染色质上定位的技术。ChIP 的原理是通过甲醛处理细胞固定 DNA 和蛋白,然后提取染色质,使用超声或酶解将染色质剪切成小片段。 之后使用结合在染色质的目的蛋白或组蛋白修饰特异性抗体富集 DNA 片段。富集的 DNA 片段可以通过 PCR,DNA 芯片或测序进行分析。虽然原理看起来很简单,但 ChIP 是一项非常具有挑战的技术,很多因素都可能导致实验










