S100A4表达检测
明确S100A4在NSCLC细胞中的表达水平,确定高表达和低表达的细胞系
通过RT-qPCR检测BEAS-2B、A549、H1299等细胞中S100A4的mRNA水平,证实A549为高表达,H1299为低表达。
Exosome-transmitted S100A4 induces immunosuppression and non-small cell lung cancer development by activating STAT3.
包含体外细胞功能实验、外泌体传递实验、ChIP机制验证及体内小鼠移植瘤模型等多层级验证。
A549细胞系 H1299细胞系 T细胞共培养体系 BALB/c裸鼠皮下移植瘤模型
使用A549和H1299细胞系,其中A549高表达S100A4,H1299低表达S100A4 敲低S100A4(si-S100A4)或过表达S100A4(oe-S100A4)的转染效率 A549细胞来源的外泌体或外泌体耗竭的条件培养基处理H1299细胞 体内实验中,每只小鼠皮下接种2×10^6个细胞(100 μl),每组6只,共24只雄性BALB/c裸鼠 ChIP实验验证STAT3与PD-L1启动子的结合
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确S100A4在NSCLC细胞中的表达水平,确定高表达和低表达的细胞系
通过RT-qPCR检测BEAS-2B、A549、H1299等细胞中S100A4的mRNA水平,证实A549为高表达,H1299为低表达。
验证从细胞培养上清中成功提取外泌体
使用外泌体提取试剂盒从MRC-5、A549、H1299细胞上清中提取外泌体,通过TEM观察形态,Western blot检测外泌体标志物CD63、CD9及阴性标志物Calnexin。
确认si-S100A4和oe-S100A4的转染效果,为后续功能实验提供基础
设计si-S100A4转染A549细胞,oe-S100A4转染H1299细胞,通过RT-qPCR和Western blot检测转染效率。
评估S100A4对NSCLC细胞体外功能的影响
使用CCK-8检测细胞增殖,克隆形成实验检测克隆能力,流式细胞术检测凋亡和细胞周期,Transwell实验检测迁移和侵袭。
探究S100A4是否通过STAT3调控PD-L1表达,并影响T细胞活性
敲低S100A4后检测STAT3和PD-L1蛋白表达;si-STAT3敲低后验证与PD-L1的相互作用;si-S100A4处理A549后与T细胞共培养,检测CD4+和CD8+ T细胞比例;过表达STAT3观察对PD-L1表达的逆转效果。
证明A549细胞来源的外泌体通过传递S100A4影响NSCLC细胞功能
用A549来源的外泌体或外泌体耗竭的CM处理H1299细胞,检测S100A4表达及细胞功能;或使用si-ctrl/si-S100A4处理的外泌体处理H1299细胞。
验证外泌体传递的S100A4对NSCLC肿瘤生长的影响
将敲低或过表达S100A4的细胞皮下注射到BALB/c裸鼠,监测肿瘤体积和重量,进行HE、Ki-67、TUNEL和IHC检测。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | MEM培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| Ham's F-12K培养基 | -- | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | -- | |
| 外泌体提取 | 外泌体提取试剂盒 | SBI | EXOQ5A-1 |
| Western blot | CD63抗体 | proteintech | 25682-1-AP |
| CD9抗体 | proteintech | 20597-1-AP | |
| Calnexin抗体 | proteintech | 66903-1-Ig | |
| T细胞分离 | MagniSort人CD4 T细胞富集试剂盒 | ThermoFisher | 8804-6811-74 |
| MagniSort人CD8 T细胞富集试剂盒 | ThermoFisher | 8804-6812-74 | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | -- | -- |
| 逆转录试剂盒 | Beijing ComWin Biotech | CW2569 | |
| UltraSYBR混合物试剂盒 | Beijing ComWin Biotech | CW2601 | |
| QuantStudio1荧光定量PCR仪 | Thermo | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 裂解缓冲液 | meilunbio | MB2479 | |
| SDS-PAGE上样缓冲液 | -- | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| S100A4抗体 | proteintech | 16105-1-AP | |
| cyclin D1抗体 | proteintech | 26939-1-AP | |
| BAX抗体 | proteintech | 50599-2-Ig | |
| Bcl-2抗体 | proteintech | 26593-1-AP | |
| E-钙粘蛋白抗体 | proteintech | 20874-1-AP | |
| vimentin抗体 | proteintech | 10366-1-AP | |
| N-钙粘蛋白抗体 | proteintech | 22018-1-AP | |
| twist抗体 | proteintech | 11752-1-AP | |
| slug抗体 | proteintech | 12129-1-AP | |
| snail抗体 | proteintech | 13099-1-AP | |
| c-Myc抗体 | proteintech | 10828-1-AP | |
| β-连环蛋白抗体 | proteintech | 51067-2-AP | |
| STAT3抗体 | proteintech | 10253-2-AP | |
| PD-L1抗体 | proteintech | 17952-1-AP | |
| β-肌动蛋白抗体 | proteintech | 66009-1-Ig | |
| CCK-8实验 | CCK-8试剂盒 | DOJINDO | NU679 |
| 酶标仪 | Bio-Tek | MB-530 | |
| 细胞凋亡与周期检测 | Annexin V-FITC试剂 | keygenbio | KGA108 |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | Beckman | A00-1-1102 | |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | 33318035 |
| Matrigel基底膜基质 | BD Biocoat | -- | |
| 显微镜 | Olympus | -- | |
| 免疫组织化学 | Ki-67抗体 | abcam | ab16667 |
| DAB显色液 | -- | -- | |
| TUNEL实验 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | KeyGen Biotech | KGA704 |
| 生物素 | Leagene Biotechnology | IH0125 | |
| DAB显色液 | ZSGB-BIO | ZLI-9018 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系的选择:A549(高表达S100A4)、H1299(低表达S100A4),培养基分别为Ham's F-12K和RPMI-1640,均添加10% FBS、1%青霉素和1%链霉素。 阅读提示:Methods and materials 中的 Cell culture and treatment |
| 外泌体提取与鉴定 | 外泌体提取试剂盒为SBI的EXOQ5A-1;外泌体标志物CD63、CD9阳性,Calnexin阴性。 阅读提示:Methods and materials 中的 Exosome isolation and identification |
| 基因敲低和过表达 | si-S100A4转染A549,oe-S100A4转染H1299;使用si-STAT3和si-PD-L1敲低;需要确认转染效率。 阅读提示:Methods and materials 中的 Cell culture and treatment;Results 中 Figure 2A, 3C, 3F |
| 细胞功能实验 | CCK-8实验细胞密度1×10^4/孔,检测时间点12, 24, 48, 72小时;克隆形成1000细胞/孔培养2-3周;凋亡检测使用Annexin V-FITC/PI;周期检测PI染色;Transwell实验细胞密度1×10^6/ml,培养48小时。 阅读提示:Methods and materials 中的 Cell Counting Kit 8 assay, Clone formation assay, Cell apoptosis and cycle, Transwell assay |
| 机制验证 | ChIP实验检测STAT3与PD-L1结合;T细胞共培养检测CD4+和CD8+ T细胞比例。 阅读提示:Methods and materials 中的 Chromatin immunoprecipitation 和 Identification and treatment of CD8+ and CD4+ T cells;Results 中的 Figure 3 |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠,雄性,4周龄,每组6只;皮下注射2×10^6个细胞(100 μl);肿瘤体积每4天监测,30天后处死。 阅读提示:Methods and materials 中的 In vivo tumorigenesis;Results 中的 Figure 5 |