检测血管钙化条件下nesfatin-1的表达
明确nesfatin-1在钙化环境中的表达变化,探究其与钙化的相关性。
通过高磷或β-GP/钙处理VSMCs,离体培养主动脉环,VD3诱导小鼠模型以及患者血清样本,检测nesfatin-1的mRNA、蛋白和血清水平。
Nesfatin-1 enhances vascular smooth muscle calcification through facilitating BMP-2 osteogenic signaling.
包含细胞水平、离体血管环、动物模型(VD3诱导小鼠)及患者样本,并通过功能获得/丧失、机制验证(泛素化、信号通路)和药物筛选等实验。
大鼠原代主动脉血管平滑肌细胞(VSMCs) 小鼠主动脉环(离体培养) VD3诱导的血管钙化小鼠模型(C57BL/6J) 冠状动脉钙化患者血清样本
VSMCs使用高磷(Na2HPO4/NaH2PO4,2.6 mM)处理12天或β-GP(5 mM)+Ca2+(2.5 mM)处理14天 小鼠模型:VD3皮下注射(5.5×10^5 U/kg,每天一次,共3次),之后正常饮食6周 AAV9介导的VSMC特异性nesfatin-1敲低或过表达(SM22α启动子,尾静脉注射2×10^11载体基因组) Curculigoside和Chebulagic acid处理:小鼠腹腔注射30 mg/kg,隔天一次,共6周 患者样本:102例疑似CAD患者,根据Agatston评分分组分析血清nesfatin-1水平
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
明确nesfatin-1在钙化环境中的表达变化,探究其与钙化的相关性。
通过高磷或β-GP/钙处理VSMCs,离体培养主动脉环,VD3诱导小鼠模型以及患者血清样本,检测nesfatin-1的mRNA、蛋白和血清水平。
验证nesfatin-1在体内和离体血管钙化中的因果作用。
通过AAV9介导的VSMC特异性nesfatin-1敲低或过表达,在VD3诱导的钙化小鼠或离体主动脉环中观察钙化程度和相关蛋白/mRNA表达变化。
验证nesfatin-1对VSMCs成骨分化的影响,确定其细胞自主性作用。
用shRNA或过表达质粒处理VSMCs,在高磷条件下诱导钙化,检测钙结节、钙含量、ALP活性以及成骨/收缩标志物表达。
阐明nesfatin-1促进钙化的分子机制,验证其是否通过BMP-2信号通路。
通过共免疫沉淀、激光共聚焦、截短突变体实验检测nesfatin-1与BMP-2的相互作用。使用可溶性BMPR-IA阻断实验、western blot和qPCR检测BMP-2下游信号(Smad磷酸化、RUNX2/MSX2表达)以及RUNX2/HDAC4事件(乙酰化、核转位)。
验证nesfatin-1是否通过影响泛素-蛋白酶体途径调节BMP-2蛋白稳定性。
使用MG132和氯喹抑制蛋白酶体和自噬-溶酶体途径,检测BMP-2蛋白水平。通过放线菌酮追踪实验检测蛋白半衰期。通过泛素化实验分析BMP-2的泛素化水平。利用UbiBrowser预测并验证E3连接酶SYTL4的作用。
寻找能够抑制nesfatin-1的化合物,并验证其在VC治疗中的潜力。
利用荧光素酶报告基因筛选小分子化合物库(含171种天然黄酮),通过CETSA和DARTS验证结合,分子对接计算结合能。在体外和VD3诱导小鼠模型中评估Curculigoside和Chebulagic acid对钙化程度及nesfatin-1、BMP-2、RUNX2等蛋白表达的影响。
揭示钙化条件下nesfatin-1上调的转录机制。
利用基于质谱的DNA-蛋白质相互作用筛选技术,在VSMCs中鉴定与nesfatin-1启动子结合的转录因子。通过ChIP、荧光素酶报告基因、过表达/敲低验证STAT3对nesfatin-1转录的调控。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Hyclone | -- |
| 胎牛血清 | Hyclone | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Hyclone | -- | |
| 胰蛋白酶 | Hyclone | -- | |
| 磷酸钠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 甘油磷酸二钠 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白提取 | Western和IP裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Beyotime | -- | |
| 钙调神经磷酸酶抑制剂 | Beyotime | -- | |
| 重组蛋白 | 重组人BMP受体1A | R&D Systems | -- |
| 钙含量检测 | 钙检测试剂盒 | Jiancheng Bioengineering Institute | -- |
| ALP活性检测 | 碱性磷酸酶活性检测试剂盒 | Abbkine | -- |
| 染色 | 茜素红S染色液 | Solarbio | -- |
| Von Kossa检测试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 药物处理 | MG132 | MCE | -- |
| 氯喹 | MCE | -- | |
| 仙茅苷 | MCE | -- | |
| 诃子酸 | MCE | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白A/G琼脂糖珠 | Santa Cruz | -- |
| Western blot | PVDF膜 | Millipore | -- |
| ECL化学发光液 | Biosharp | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI染色液 | -- | -- |
| RT-PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| Hifair® III第一链cDNA合成预混液 | Yeasen Biotechnology | -- | |
| SYBR Green PCR预混液 | Yeasen Biotechnology | -- | |
| Applied Biosystems QuantStudio 3实时荧光定量PCR仪 | Thermo Fisher | -- | |
| 核/质提取 | 核蛋白提取试剂盒 | Beyotime | -- |
| Western blot | nesfatin-1抗体 | Proteintech | 26712-1-AP |
| RUNX2抗体 | Cell Signaling Technology | 12556S | |
| BMP-2抗体 | Huabio | ER80602 | |
| α-SMA抗体 | Proteintech | 14395-1-AP | |
| SM22α抗体 | Proteintech | 10493-1-AP | |
| HDAC4抗体 | Cell Signaling Technology | 7628S | |
| 磷酸化Smad抗体 | Cell Signaling Technology | 13820 | |
| 总Smad抗体 | Cell Signaling Technology | 6944 | |
| Msx2抗体 | Biorbyt | orb415625 | |
| Lamin B1抗体 | Proteintech | 12987-1-AP | |
| HA抗体 | Proteintech | 81290-1-RR | |
| Flag抗体 | Proteintech | 66008-4-Ig | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 4970 | |
| His抗体 | Proteintech | 66005-1-Ig | |
| STAT3抗体 | Proteintech | 10253-2-AP | |
| 磷酸化HDAC4抗体(Ser246) | Bioss | bs-10325R | |
| 泛素抗体 | Proteintech | 10201-2-AP | |
| GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 乙酰化赖氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 9441 | |
| SYTL4抗体 | Proteintech | 12128-1-AP | |
| STAT3抗体 | Cell Signaling Technology | 9139 | |
| β-tubulin抗体 | Boster | M05613-6 | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG | Proteintech | SA00001-2 | |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Proteintech | SA00001-1 | |
| 免疫荧光/免疫沉淀 | nesfatin-1抗体 | Proteintech | 26712-1-AP |
| 免疫荧光 | α-SMA抗体 | Abcam | ab7817 |
| RUNX2抗体 | Abcam | ab192256 | |
| HDAC4抗体 | Abcam | ab12172 | |
| Alexa Fluor 488标记山羊抗小鼠IgG | Invitrogen | A11029 | |
| Alexa Fluor 594标记山羊抗兔IgG | Invitrogen | A11012 | |
| ELISA | 人nesfatin-1 ELISA试剂盒 | Boster | EK1138 |
| BioTek酶标仪 | BioTek | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 药物筛选 | 荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Yeasen | -- |
| ChIP | EZ-ChIP™染色质免疫沉淀试剂盒 | Millipore | -- |
| 对照IgG抗体 | Proteintech | 30000-0-AP | |
| 质谱分析 | 链霉亲和素C1磁珠 | Invitrogen | -- |
| CETSA | M-PER哺乳动物蛋白提取试剂 | Solarbio | -- |
| 动物实验 | 维生素D3 | Sigma | C1357 |
| 携带nesfatin-1 shRNA或过表达基因的AAV9载体 | Packgene | -- | |
| 异氟烷 | -- | -- | |
| 肝素钠真空采血管 | Becton-Dickinson | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与钙化诱导 | VSMCs来源(大鼠胸主动脉)、代数(P5-P8)、高磷浓度(Na2HPO4/NaH2PO4 2.6 mM)处理时间(12天)或β-GP(5 mM)+Ca2+(2.5 mM)处理时间(14天) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture |
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6J雄性)、年龄(16周)、VD3剂量(5.5×10^5 U/kg)、注射方式(皮下)、频率(每天一次共3次)、持续时间(6周) 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| VSMC特异性基因操作 | AAV9载体类型(shRNA或过表达)、启动子(SM22α)、注射剂量(2×10^11载体基因组)、注射途径(尾静脉) 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| 药物处理 | Curculigoside和Chebulagic acid的剂量(小鼠30 mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、频率(隔天一次)、时长(6周) 阅读提示:Materials and methods: Animals |
| 患者样本 | 患者群(疑似CAD,102例)、钙评分分组标准(Agatston评分0–10, 11–100, 101–400, >400)、血样采集时间(CT前)和保存条件(4°C 4h内处理,-80°C) 阅读提示:Materials and methods: Study population |