检测ELF4表达变化
确定ELF4在肾I/R损伤和OGD/R细胞模型中的表达水平变化。
通过qRT-PCR、Western blot和免疫组化检测肾脏组织及HK-2细胞中ELF4的mRNA和蛋白表达。
Knockdown of ELF4 aggravates renal injury in ischemia/reperfusion mice through promotion of pyroptosis, inflammation, oxidative stress, and endoplasmic reticulum stress.
包含体内I/R小鼠模型和体外OGD/R细胞模型,具有功能验证(敲低/过表达)和机制验证(检测凋亡、OS、ERS、炎症、焦亡相关蛋白及生化指标)。
C57BL/6小鼠肾缺血/再灌注(I/R)模型 HK-2人肾近端肾小管上皮细胞OGD/R模型
小鼠I/R手术:双侧肾蒂夹闭30分钟,再灌注6小时 HK-2细胞OGD/R处理:无糖培养基、1% O2、5% CO2、94% N2处理4小时,再复氧6小时 转染条件:si-ELF4或ov-ELF4转染48小时后进行OGD/R处理 主要检测指标:血清Cr、BUN、KIM-1、凋亡、ROS、SOD、CAT、GSH-PX、ERS及焦亡相关蛋白
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定ELF4在肾I/R损伤和OGD/R细胞模型中的表达水平变化。
通过qRT-PCR、Western blot和免疫组化检测肾脏组织及HK-2细胞中ELF4的mRNA和蛋白表达。
探究ELF4敲除对I/R诱导的肾功能和组织损伤的影响。
检测血清Cr、BUN水平,进行H&E染色观察肾组织病理变化,并通过Western blot检测KIM-1表达。
验证ELF4对I/R和OGD/R诱导的细胞凋亡的影响。
通过TUNEL染色检测肾组织凋亡,Western blot检测Bax和Bcl-2蛋白水平;在HK-2细胞中检测细胞活力和凋亡。
探究ELF4对I/R和OGD/R诱导的氧化应激和内质网应激的影响。
检测血清SOD、CAT、GSH-PX水平,Western blot检测Nrf2、HO-1、NQO-1(OS相关)和GRP78、CHOP、caspase-12(ERS相关)蛋白表达;在HK-2细胞中检测ROS水平。
探究ELF4对I/R和OGD/R诱导的炎症反应和细胞焦亡的影响。
通过Western blot检测肾组织和细胞中炎症因子(IL-6、TNF-α、IL-18、IL-1β)及焦亡相关蛋白(GSDMD、N-GSDMD、caspase-11/4)的水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 微动脉瘤夹 | Fine Science Tools | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Invitrogen | 11885084 |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | 11668030 |
| RNA提取和qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| PrimeScript™反转录试剂盒 | Takara | RR037Q | |
| SYBR Premix Ex Tag试剂盒 | Takara | RR820A | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Sigma-Aldrich | 20-188 |
| 抗ELF4抗体 | Abcam | ab96075 | |
| 抗Nrf2抗体 | Abcam | ab137550 | |
| 抗NQO-1抗体 | Abcam | ab34173 | |
| 抗GRP78抗体 | Abcam | ab21685 | |
| 抗KIM-1抗体 | Abcam | ab302932 | |
| 抗IL-6抗体 | Abcam | ab259341 | |
| 抗IL-1β抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-12742 | |
| 抗IL-18抗体 | ABclonal | A1115 | |
| 抗N-GSDMD抗体 | ABclonal | A22523 | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 2772 | |
| 抗Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 3498 | |
| 抗TNF-α抗体 | Cell Signaling Technology | 3707 | |
| 抗caspase-4抗体 | Cell Signaling Technology | 4450 | |
| 抗caspase-11抗体 | Cell Signaling Technology | 14340 | |
| 抗caspase-12抗体 | Cell Signaling Technology | 35965 | |
| 抗CHOP抗体 | Cell Signaling Technology | 2895 | |
| 抗HO-1抗体 | Cell Signaling Technology | 43966 | |
| 抗GSDMD抗体 | Cell Signaling Technology | 39754 | |
| 抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 二抗 | Cell Signaling Technology | 7074 | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 免疫组化 | 10%福尔马林 | Sigma-Aldrich | HT501128 |
| 3%过氧化氢 | Sigma-Aldrich | H1009 | |
| 牛血清白蛋白 | Sigma-Aldrich | A1933 | |
| 抗ELF4抗体(免疫组化) | Bioss | bs-14563R | |
| 二抗(免疫组化) | Cell Signaling Technology | 8114 | |
| 显微镜 | Olympus | BX53 | |
| H&E染色 | 伊红 | Beyotime Biotechnology | C0109 |
| 光学显微镜 | Olympus | -- | |
| TUNEL染色 | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C1089 |
| 蛋白酶K | -- | -- | |
| 生化检测 | 血清肌酐检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C011-2-1 |
| 尿素氮检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | C013-2-1 | |
| 超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A001-1-2 | |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A007-1-1 | |
| 谷胱甘肽过氧化物酶检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng Bioengineering Institute | A005-1-2 | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂 | Beyotime Biotechnology | C0037 |
| 酶标仪 | BioTek | ELX-800 | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC | Beyotime Biotechnology | C1062S-1 |
| 碘化丙啶 | Beyotime Biotechnology | C1062S-3 | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | Accuri | |
| ROS检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime Biotechnology | S0033S |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠I/R模型 | 小鼠品系:C57BL/6;性别:雄性;周龄:文中未明确说明;体重:文中未明确说明;I/R手术:双侧肾蒂夹闭30分钟,再灌注6小时;麻醉:1%戊巴比妥钠;分组:WT sham、ELF4−/− sham、WT I/R、ELF4−/− I/R,每组n=5 阅读提示:见Methods 'Mouse model of renal I/R injury' 及图2图注 |
| 体外OGD/R模型 | 细胞系:HK-2;OGD/R处理:无糖培养基、1% O2、5% CO2、94% N2处理4小时,随后完全培养基、21% O2复氧6小时;培养基:DMEM+10% FBS+1%青霉素/链霉素;温度37°C,5% CO2 阅读提示:见Methods 'Cell culture and treatments' 及图1图注 |
| 基因操作 | si-ELF4、ov-ELF4及对照(si-NC、ov-NC);转染试剂:Lipofectamine 2000;转染时间:48小时 阅读提示:见Methods 'Cell culture and treatments' |
| 检测指标 | 肾功能:血清Cr、BUN;肾损伤标志物:KIM-1;氧化应激:血清SOD、CAT、GSH-PX及细胞ROS水平;凋亡:TUNEL染色、Bax/Bcl-2;内质网应激:GRP78、CHOP、caspase-12;炎症:IL-6、TNF-α、IL-18、IL-1β;焦亡:GSDMD、N-GSDMD、caspase-11/4 阅读提示:见Methods 'Biochemical assays', 'Detection of cell viability', 'Detection of cell apoptosis', 'Detection of reactive oxygen species' 及图3-5图注 |