构建Dmrt1敲低小鼠模型
研究Dmrt1在体内的功能,特别是对生精和免疫稳态的影响。
通过生精小管移植(STT)将shDmrt1慢病毒或siRNA注入小鼠睾丸,建立Dmrt1特异性敲低模型。
Transcription factor Dmrt1 triggers the SPRY1-NF-κB pathway to maintain testicular immune homeostasis and male fertility.
包含体内小鼠模型(Dmrt1/Spry1敲低)、体外细胞模型(TM4、原代支持细胞)、转录组学(RNA-seq)及表观遗传学(ChIP-seq)、蛋白互作(Co-IP、IP-MS)、功能验证(LPS诱导炎症)等多层级证据。
小鼠睾丸支持细胞(SC) 小鼠生精小管移植模型 TM4细胞系 HEK293T细胞
Dmrt1和Spry1的敲低效率(qRT-PCR和Western blot验证) LPS诱导炎症的剂量(10 mg/kg腹腔注射)和处理时间(2小时) SPRY1与NF-κB1的互作及结合域(SPRY域和ANK域) 血睾屏障完整性(ZO-1、CLDN1表达和紧密连接超微结构)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究Dmrt1在体内的功能,特别是对生精和免疫稳态的影响。
通过生精小管移植(STT)将shDmrt1慢病毒或siRNA注入小鼠睾丸,建立Dmrt1特异性敲低模型。
评估Dmrt1敲低对生精和睾丸免疫的影响。
通过组织学、精子计数、精子活力、免疫荧光、TUNEL和ELISA等检测生精细胞、精子参数和炎症因子。
鉴定Dmrt1调控的基因和信号通路。
对Si-NC和Si-Dmrt1睾丸进行RNA-seq,并与ChIP-seq数据联合分析,鉴定Dmrt1直接靶基因。
验证Dmrt1是否直接转录激活Spry1。
通过双荧光素酶报告实验、Dmrt1剂量依赖实验和qRT-PCR验证Dmrt1对Spry1启动子的激活作用。
研究Spry1在睾丸中的功能。
利用STT方法敲低Spry1,评估生精、血睾屏障和炎症反应。
研究Dmrt1和Spry1在LPS诱导的炎症反应中的作用。
使用LPS处理过表达或敲低Dmrt1/Spry1的细胞,检测炎症因子表达和NF-κB信号激活。
揭示SPRY1抑制NF-κB信号通路的分子机制。
通过Co-IP、IP-MS、BiFC和结构域截短实验确定SPRY1与NF-κB1的结合及其关键结构域。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| LPS处理 | 脂多糖(Sigma L2630) | Sigma | L2630 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Corning | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| DMEM/F12培养基 | Corning | -- | |
| 细胞转染 | Lipo6000转染试剂 | Beyotime | C0526 |
| ELISA | GDNF ELISA试剂盒 | FANKEL | F2110-B |
| 抗精子抗体ELISA试剂盒 | FANKEL | F2532-B | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | FANKEL | F2163-B | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | FANKEL | F2132-B | |
| 免疫组织化学 | DAB显色液 | Beyotime | -- |
| 免疫荧光 | Hoechst染料 | -- | -- |
| DAPI染料 | Beyotime | C1002 | |
| Alexa Fluor 488 | ZSGB-BIO | ZF-0511 | |
| Alexa Fluor 594 | ZSGB-BIO | ZF-0513 | |
| 透射电镜 | Tecnai G2 Spirit Bio透射电镜 | FEI | -- |
| TUNEL | TUNEL染色试剂盒 | Beyotime | C1090 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | TaKaRa | 9108 |
| 逆转录 | 逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| qRT-PCR | SYBR qPCR预混液 | Vazyme Biotech | Q311-02 |
| CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白提取 | NP40裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白定量 | Bradford法蛋白定量试剂盒 | Tiangen Biotech | PA102 |
| 蛋白提取 | 核浆蛋白提取试剂盒 | Beyotime | P0027 |
| 免疫共沉淀 | NP-40裂解液 | Beyotime | P0013 |
| 抗Flag磁珠 | Beyotime | P2115 | |
| 抗HA磁珠 | Beyotime | P2121 | |
| 蛋白质染色 | CBB快速染色液 | Tiangen Biotech | PA101 |
| Western blot | 抗DMRT1抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-377167 |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗TNF-α抗体 | Proteintech | 60291-1-Ig | |
| 抗IL-6抗体 | Proteintech | 21865-1-AP | |
| 抗IL-1β抗体 | Proteintech | 16806-1-AP | |
| 抗NF-κB p65抗体 | CST | #8242 | |
| 抗磷酸化NF-κB p65抗体 | CST | #3033 | |
| 抗裂解Caspase3抗体 | CST | #9661 | |
| 抗NF-κB1抗体 | Proteintech | 14220-1-AP | |
| 抗NF-κB2抗体 | Proteintech | 10409-2-AP | |
| 抗SPRY1抗体 | Immunoway | YN3905 | |
| 抗FLAG标签抗体 | Sigma | F1804 | |
| 抗HA标签抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7392 | |
| 抗PCNA抗体 | Proteintech | 24036-1-AP | |
| 抗鼠IgG-HRP | Boster | BA1050 | |
| 抗兔IgG-HRP | Boster | BA1054 | |
| 免疫组织化学 | 抗DDX4抗体 | Abcam | ab13840 |
| 抗ZBTB16抗体 | Bioss | bs-5971R | |
| 抗SYCP3抗体 | Abcam | ab15093 | |
| 抗SOX9抗体 | Abcam | ab185230 | |
| 抗Claudin 1抗体 | Proteintech | 28674-1-AP | |
| 抗ZO1抗体 | Proteintech | 21773-1-AP | |
| 抗TLR4抗体 | Proteintech | 19811-1-AP | |
| RNA-seq | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| KC-Digital™链特异性mRNA文库制备试剂盒 | Wuhan Seqhealth Technology | DR08502 | |
| NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- | |
| ChIP-seq | VAHTS通用DNA文库制备试剂盒 | Vazyme | ND607 |
| 双荧光素酶报告 | pGL3-Basic质粒 | Promega | -- |
| 双荧光素酶报告系统 | Beyotime | -- | |
| 荧光检测 | BHP9504光学分析系统 | Hamamatsu Photonics | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| Dmrt1敲低小鼠构建 | 慢病毒注射量(100 μL)、小鼠品系、每组数量(至少20只)、敲低效率(qRT-PCR和Western blot验证) 阅读提示:Materials and Methods: Generation of Dmrt1 and Spry1 KD mice |
| LPS诱导炎症模型 | LPS剂量(10 mg/kg,腹腔注射)、处理时间(图注中指示)、对照组(PBS) 阅读提示:Materials and Methods: LPS administration |
| 细胞培养和处理 | 细胞系(TM4、原代支持细胞)、LPS浓度(20 ng/mL)、处理时间(0-2小时) 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and cell transfection; Results |
| SPRY1与NF-κB1互作验证 | Co-IP抗体(anti-SPRY1、anti-NF-κB1)、细胞裂解液(NP40)、磁珠(anti-Flag/HA)、结构域截短体构建 阅读提示:Materials and Methods: Western blotting, immunoblotting, and Co-IP; Results |
| RNA-seq和ChIP-seq | RNA-seq生物学重复数(2)、ChIP-seq细胞数(1×10^7)、抗体(anti-Flag)、测序平台(NovaSeq 6000) 阅读提示:Materials and Methods: RNA-seq and data analysis; ChIP-seq and data analysis |